單細胞測序高通量測序平臺

來源: 發(fā)布時間:2022-09-05

核酸適配體測序,項目介紹:核酸適配體是一類能夠特異性地和靶物質(zhì)結(jié)合的寡核苷酸序列。它可作用于蛋白質(zhì)、金屬離子、小分子化合物、細胞膜表面受體等靶標。其結(jié)合能力可與抗體相當甚至更強,同時具有低免疫原性、 穩(wěn)定性好等特點,并可結(jié)合各種藥物及載體構(gòu)建多元復合靶向給藥系統(tǒng)用于tumour靶向treat, 在生物醫(yī)學領(lǐng)域有潛在高價值。生工生物針對核酸適配體特殊結(jié)構(gòu),結(jié)合Illumina MiSeq測序平臺,可以快速對核酸適配體文庫進行大規(guī)模高通量測序,省去克隆測序的麻煩,提高測序深度,快速計算適配體序列頻率,方便科研客戶快速評估序列富集程度。單細胞測序技術(shù)可以檢測復雜組織中單個細胞不同的生物學特性.單細胞測序高通量測序平臺

單細胞測序技術(shù)的應用:單細胞測序技術(shù)可以檢測復雜組織中單個細胞不同的生物學特性,這可以極大的幫助我們進一步了解細胞與細胞之間的差異。"這幾乎就像通過幾顆星星看到了整個宇宙。"哈佛大學分子和細胞生物學教授 Alexander Schier的這句話應用在這里也是很合適了。這幅圖正是來自于在2018年4月 Science 雜志發(fā)表的三篇[8-10]來自哈佛醫(yī)學院和哈佛大學的研究人員關(guān)于單細胞基因測序文章中的一幅結(jié)果圖,Alexander Schier教授也是其中一篇文章的作者。這幾篇文章使用多種檢測技術(shù)組合,其中包括對數(shù)千個發(fā)育中的斑馬魚和青蛙胚胎單細胞測序,在胚胎發(fā)育建議初的24小時內(nèi)追蹤單個細胞的發(fā)育情況,可以揭示出胚胎細胞何時何地轉(zhuǎn)變?yōu)樾碌募毎麪顟B(tài)和類型并向我們展示了組織和整個機體從單細胞發(fā)育的完整歷程。上海羥甲基化測序高通量測序平臺目前,生工生物已開展10x單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(scRNA-seq)服務,如果正好您有需要,那就快快來call我們吧!

簡化基因組測序,項目介紹:通過限制性內(nèi)切酶對基因組DNA進行酶切,并對酶切片段進行高通量測序,這種通過酶切降低基因組的復雜度的測序技術(shù)統(tǒng)稱為簡化基因 組測序技術(shù)。利用生物信息學方法,進行SNP單體型圖譜繪制,全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),連鎖分析和QTL定位分析,種群進化,主成分分析等。比較有代表性的方法有GBS-seq和RAD-seq。宏全基因組測序,項目介紹:宏基因組指特定環(huán)境樣品內(nèi)全部遺傳物質(zhì)的總和。直接提取環(huán)境樣品內(nèi)全部基因組DNA,隨后進行大規(guī)模高通量測序(shotgun 策 略)。測到數(shù)據(jù)后,先進行必要的數(shù)據(jù)質(zhì)控,而后進行基因組拼接、注釋(物種、基因功能),使得我們可以獲取環(huán)境樣品內(nèi)菌群分布、系統(tǒng)進化、功能代謝等信息。該方法已經(jīng)得到普遍的運用。

真核/原核無參mRNA-Seq,項目介紹;測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后進行拼接,并進一步對拼接所得轉(zhuǎn)錄本進行功能注釋、CDD、CDS分析,SNP分析,SSR標記開發(fā)等分析。在計算基因的表達量后,進行基因表達差異及差異基因GO、KOG(原核生物為COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。對于多個樣本,可進行重復相關(guān)性檢查、共表達分析、PCA主成分分析。另外,還可以進行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析,深入研究基因功能,進一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息,為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機理提供方向。 PacBio Sequel/RSII 該測序平臺主要承接細菌基因組完成圖測序、fungus基因組精細圖測序、全長轉(zhuǎn)錄本測序服務。

small RNA測序,項目簡介:Small RNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子,長度在18-30 nt之間,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導基因沉默,參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,從而調(diào)節(jié)細胞生長、分化,以及個體發(fā)育、生殖等重要生物學過程。高通量測序技術(shù)可以對樣本中所有small RNA家族進行測序和表達定量,從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應靶序列。測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后,進行Clean reads 長度分布統(tǒng)計,small RNA注釋,已知 miRNA 注釋,已知piRNA注釋,ncRNA分析,新 miRNA 預測(有參考基因組),差異基因可視化分析,miRNA 家族分析,差異表達 miRNA 聚類分析,miRNA靶基因預測,靶基因GO、KEGG富集分析。使用足量的干冰運輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運輸過程中樣品降解的可能性。SNP高通量測序技術(shù)

為什么要用單細胞測序技術(shù)?單細胞測序高通量測序平臺

16s/18s/ITS微生物分類測序,項目介紹:環(huán)境微生物是自然界中分布建議廣、種類建議多、數(shù)量比較大的生物類群,其群落結(jié)構(gòu)及多樣性和微生物的功能及代謝機理是微生物生態(tài)學的研究熱點,對于我們研究微生物與環(huán)境的關(guān)系、環(huán)境治理和微生物資源的利用以及人類醫(yī)療健康有著重要的理論和現(xiàn)實意義。隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展以及大量序列數(shù)據(jù)的積累,通用引物擴增結(jié)合高通量測序技術(shù),可以快速檢索環(huán)境內(nèi)微生物的群落結(jié)構(gòu)。這項運用我們稱之為微生物分類測序。如Illumina公司的MiSeq高通量測序平臺不僅可實現(xiàn)對多樣品的多個可變區(qū)同時測序,而且在測序速度和測序通量上都有進一步提升,目前此平臺已在微生物多樣性群落結(jié)構(gòu)研究方面受到了廣大學者的認可。單細胞測序高通量測序平臺

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