上海基因組高通量測(cè)序技術(shù)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-23

生工其他PCR產(chǎn)物測(cè)序,項(xiàng)目介紹:隨著基因編輯技術(shù)(尤其是CRISPR-cas9技術(shù))的發(fā)展,科研人員使用傳統(tǒng)的Sanger測(cè)序無(wú)法快速有效鑒定基因編輯效率。但是,通過(guò)對(duì)靶基因區(qū)域附近設(shè)計(jì)引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行高通量測(cè)序,可以快速高效的獲得目標(biāo)區(qū)域的突變頻率信息,尤其是對(duì)低頻突變的檢測(cè)效果遠(yuǎn)遠(yuǎn)優(yōu)于一代測(cè)序,性?xún)r(jià)比極高??侱NA 或者包裝完好的原始樣品(如土壤、糞便、 水體和口腔物);樣品名稱(chēng)清晰,冷藏運(yùn)輸。如有對(duì)照與實(shí)驗(yàn)樣品的區(qū)分,標(biāo)明正常樣品與實(shí)驗(yàn)樣品,如有分組,詳細(xì)描述分組分析信息,以及分組比較的分析需求信息。RNA樣品建議用足量干冰運(yùn)輸。上?;蚪M高通量測(cè)序技術(shù)

什么是KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序?它基于第二代測(cè)序技術(shù),一次性對(duì)大量質(zhì)粒(比較多可達(dá)6000個(gè)樣本)進(jìn)行并行測(cè)序,利用生物信息學(xué)分析,對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行序列組裝并獲得每一個(gè)質(zhì)粒的完整序列信息。所以我們也稱(chēng)它為,可以部分替代一代測(cè)序的高通量測(cè)序技術(shù)。測(cè)序長(zhǎng)度:對(duì)于測(cè)序長(zhǎng)度較長(zhǎng),如果我們用Sanger測(cè)序往往需要花費(fèi)大量的時(shí)間,而我們KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序則只需要5-7天,就可以測(cè)通片段長(zhǎng)度小于30kb以下的片段。樣本用量:KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序?qū)τ跇颖镜牧?,要求的也比較少,比如質(zhì)粒我們的樣本要求DNA的濃度需≥ 1 ng/μl, 體積需≥5 μl,如果比較珍貴的樣本或者是樣本比較難提取的,KBSeq就更為適合了。上海轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序公司ChIP項(xiàng)目至少要求50ng DNA,以Qubit 2.0檢測(cè)為準(zhǔn)。其余具體咨詢(xún)生工高通量測(cè)序部。

IlluminaHiSeq2500/4000可以運(yùn)行PE150/PE250模式,可以承擔(dān)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、人基因組重測(cè)序、外顯子捕獲測(cè)序、宏基因組測(cè)序、微生物分類(lèi)測(cè)序等服務(wù);IlluminaMiSeq運(yùn)行PE300模式,可以承擔(dān)細(xì)菌基因組重測(cè)序/Denovo測(cè)序、微生物分類(lèi)測(cè)序、擴(kuò)增子測(cè)序、核酸適配體測(cè)序等服務(wù);LifeIontorrentPGM運(yùn)行314、316、318芯片,可以承接擴(kuò)增子測(cè)序、靶區(qū)域測(cè)序、基因組重測(cè)序服務(wù);PacBioSequel/RSII該測(cè)序平臺(tái)讀長(zhǎng)超長(zhǎng),平均可達(dá)10kb以上,主要承接細(xì)菌基因組完成圖測(cè)序、***基因組精細(xì)圖測(cè)序、全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本測(cè)序等服務(wù);

2021年11月1日,在這個(gè)平凡而又特殊的日子里,生工生物高通量測(cè)序部迎來(lái)了一位新成員——10xGenomics Chromium X!不要看我們個(gè)頭小,我們可是百萬(wàn)級(jí)單細(xì)胞捕獲神器吆。X是如何實(shí)現(xiàn)單次運(yùn)行有這么高的吞吐量呢?多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。X儀器本身有16個(gè)通道(Controller為8通道),每個(gè)通道比較多捕獲20000個(gè)細(xì)胞(Controller為10000個(gè)細(xì)胞)。再結(jié)合10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù),每個(gè)通道比較多可捕獲60,000個(gè)細(xì)胞,去除雙細(xì)胞率后,每張芯片比較多可捕獲750,000個(gè)單細(xì)胞。請(qǐng)注意選擇無(wú)RNA酶的容器盛放樣本,盡量避免RNA降解。

生工人、大、小鼠全基因組測(cè)序,項(xiàng)目介紹:人或者大、小鼠全部基因組重測(cè)序,研究其突變信息(包括SNP/InDel/CNV/SV),并注釋突變位點(diǎn)信息。該技術(shù)可同時(shí)獲取編碼區(qū)及非編碼區(qū)突變信息,被廣泛應(yīng)用于遺傳病、tumour及其它其它疾病研究中。測(cè)序平臺(tái):HiSeq XTen平臺(tái)進(jìn)行PE150測(cè)序。生工微生物基因組測(cè)序,項(xiàng)目介紹:微生物基因組重測(cè)序(有參)目前越來(lái)越多的微生物基因組被解析出來(lái)了。從而使得科研工作者們可以對(duì)某些物種微生物進(jìn)行進(jìn)行物種進(jìn)化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)有參考基因組微生物進(jìn)行多個(gè)體的基因組重測(cè)序,精細(xì)分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。DNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類(lèi)似容器里,并旋緊蓋子。上海SNP高通量測(cè)序NGS

請(qǐng)合理安排樣品寄送時(shí)間,避免樣本在周六、周日或法定節(jié)假日到達(dá)生工生物。上?;蚪M高通量測(cè)序技術(shù)

使用顯微鏡進(jìn)行懸液質(zhì)檢操作時(shí)應(yīng)注意:1.使用血球計(jì)數(shù)板時(shí),可以提前鏡檢觀察每小格計(jì)數(shù)室內(nèi)是否潔凈無(wú)雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層,則需要多次清洗,直至計(jì)數(shù)室潔凈無(wú)瑕;2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴(kuò)口***頭吹打混勻;3.臺(tái)盼藍(lán)染色后需要盡快完成細(xì)胞計(jì)數(shù),一般建議不要超過(guò)10分鐘;4.如果方格中細(xì)胞數(shù)目過(guò)多,難以數(shù)清,應(yīng)當(dāng)對(duì)細(xì)胞懸液進(jìn)行稀釋以便于計(jì)數(shù);5.對(duì)于壓在方格界線上的細(xì)胞應(yīng)當(dāng)計(jì)數(shù)同側(cè)相鄰兩邊上的細(xì)胞數(shù),一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線,數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理,另兩邊不計(jì)數(shù)。上?;蚪M高通量測(cè)序技術(shù)

生工生物工程(上海)股份有限公司位于香閔路698號(hào)。公司自成立以來(lái),以質(zhì)量為發(fā)展,讓匠心彌散在每個(gè)細(xì)節(jié),公司旗下生化試劑,實(shí)驗(yàn)耗材,實(shí)驗(yàn)試劑,研發(fā)深受客戶(hù)的喜愛(ài)。公司秉持誠(chéng)信為本的經(jīng)營(yíng)理念,在醫(yī)藥健康深耕多年,以技術(shù)為先導(dǎo),以自主產(chǎn)品為重點(diǎn),發(fā)揮人才優(yōu)勢(shì),打造醫(yī)藥健康良好品牌。生工生物憑借創(chuàng)新的產(chǎn)品、專(zhuān)業(yè)的服務(wù)、眾多的成功案例積累起來(lái)的聲譽(yù)和口碑,讓企業(yè)發(fā)展再上新高。

標(biāo)簽: 高通量測(cè)序