上海地區(qū)16s高通量測(cè)序技術(shù)

生工高通量測(cè)序樣品要求，RNA樣品：請(qǐng)?zhí)峁舛取?50 ng/μl、總量≥2μg的總RNA樣品，樣品請(qǐng)去蛋白并進(jìn)行DNase處理;請(qǐng)務(wù)必提供每個(gè)樣品具體的濃度、體積、制備時(shí)間以及物種來(lái)源。比較好附上QC數(shù)據(jù)，可以是電泳膠圖、分光光度值、Nanodrop儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)或者Agilent Bioanalyzer儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)等;一般情況下，轉(zhuǎn)錄組測(cè)序需要Agilent Bioanalyzer儀器檢測(cè)獲得的總RNA 28S:18S≥1，RIN≥7;小RNA測(cè)測(cè)序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒，可選擇傳統(tǒng)總RNA提取法（如乙醇沉淀、異丙醇沉淀等）或者選用專(zhuān)門(mén)的小RNA提取試劑盒;寄送RNA樣品請(qǐng)置于1.5 ml離心管中，管上注明樣品名稱(chēng)、濃度以及制備時(shí)間，管口使用Parafilm封口。在運(yùn)輸前將所有樣品管固定于50 ml帶蓋離心管中，再將50 ml管放在封口袋中。使用足量的干冰運(yùn)輸，并且盡量選用較快的郵遞方式，以降低運(yùn)輸過(guò)程中樣品降解的可能性。截止目前為止，生工生物可是為數(shù)不多的同時(shí)擁有ChromiumController和ChromiumX平臺(tái)的公司。上海地區(qū)16s高通量測(cè)序技術(shù)

單細(xì)胞測(cè)序是什么？單細(xì)胞測(cè)序是基于高通量測(cè)序（Next-generationsequencingtechnology，NGS）方法，檢測(cè)群體中單細(xì)胞基因組、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞表觀基因組及單細(xì)胞蛋白組，提供細(xì)胞間差異的高分辨率視圖，從分子水平揭示細(xì)胞奧秘。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（Single-cellRNA-Sequencing，ScRNA-Seq）指在單細(xì)胞水平上對(duì)mRNA進(jìn)行高通量測(cè)序和分析的技術(shù)。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序能獲得單個(gè)細(xì)胞內(nèi)近萬(wàn)個(gè)基因的表達(dá)信息，為辨別生物組織中各種細(xì)胞類(lèi)型的轉(zhuǎn)錄組特征和全方面揭示細(xì)胞之間基因表達(dá)的異質(zhì)性提供了有力的工具[3]。說(shuō)到細(xì)胞異質(zhì)性（Cellheterogeneity)，就要說(shuō)到我們?yōu)槭裁匆脝渭?xì)胞測(cè)序技術(shù)了。上海地區(qū)16s高通量測(cè)序技術(shù)生工高通量測(cè)序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗(yàn)，日均處理樣品200余例。

單細(xì)胞懸液質(zhì)檢方法，在進(jìn)行單細(xì)胞懸液質(zhì)檢時(shí)，需要用到以下兩大質(zhì)檢利器的輔助：熒光細(xì)胞計(jì)數(shù)儀（主要使用臺(tái)盼藍(lán)和雙熒光AO/PI染色法）進(jìn)行質(zhì)檢。首先我們先要了解一下細(xì)胞質(zhì)檢時(shí)染料染色的原理：臺(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)不能透過(guò)活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜，故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高，可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。熒光細(xì)胞計(jì)數(shù)儀檢測(cè)結(jié)果可以讓我們直觀的看到：細(xì)胞濃度（總細(xì)胞，活細(xì)胞，死細(xì)胞）、細(xì)胞存活率（臺(tái)盼藍(lán)和雙熒光AO/PI染色）、細(xì)胞平均直徑、細(xì)胞聚團(tuán)率、細(xì)胞直徑分布等結(jié)果的展示。

高通量測(cè)序技術(shù)是可以平行對(duì)數(shù)百萬(wàn)甚至數(shù)十億條序列測(cè)序的技術(shù)。在基因組測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、宏基因組測(cè)序、表觀遺傳測(cè)序、外顯子捕獲測(cè)序、靶區(qū)域測(cè)序等諸多科研及精細(xì)醫(yī)療檢測(cè)領(lǐng)域內(nèi)有普遍的運(yùn)用。生工生物工程（上海）股份有限公司自2011年成立高通量測(cè)序部以來(lái)，逐步引進(jìn)了Illumina，Life，PacBio等二代/三代測(cè)序平臺(tái)。建立了2000m2高標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室（通過(guò)了國(guó)家ISO認(rèn)證）以及10PB級(jí)運(yùn)算能力的服務(wù)器集群，能滿(mǎn)足絕大多數(shù)科研客戶(hù)的研究需要。同時(shí)，生工高通量測(cè)序團(tuán)隊(duì)建設(shè)也在不斷完善中，目前有50余專(zhuān)職員工，其中高級(jí)技術(shù)人員以及高級(jí)生物信息工程師占比50%以上，5年來(lái)，通過(guò)生工高通量測(cè)序結(jié)果發(fā)表的文章累計(jì)影響因子超過(guò)1000分以上。請(qǐng)注意選擇無(wú)RNA酶的容器盛放樣本，盡量避免RNA降解。

微生物基因組重測(cè)序（有參）：目前越來(lái)越多的微生物基因組被解析出來(lái)了。從而使得科研工作者們可以對(duì)某些物種微生物進(jìn)行進(jìn)行物種進(jìn)化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)有參考基因組微生物進(jìn)行多個(gè)體的基因組重測(cè)序，精細(xì)分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。微生物基因組從頭測(cè)序（無(wú)參）：對(duì)于不斷分離培養(yǎng)微生物的客戶(hù)來(lái)說(shuō)，要確定一個(gè)菌株是否是新菌株或者新菌種，較快捷的辦法就是，直接進(jìn)行基因組測(cè)序。利用高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)這些基因組進(jìn)行高深度測(cè)序，然后進(jìn)行基因組組裝，獲得基因組的框架圖或者精細(xì)圖甚至是完成圖。從而可以快速解析其基因組結(jié)構(gòu)、基因功能、進(jìn)化關(guān)系。特別申明：不能采用過(guò)柱離心的方法提取總RNA。上海16s高通量測(cè)序產(chǎn)品

PacBio Sequel/RSII 該測(cè)序平臺(tái)主要承接細(xì)菌基因組完成圖測(cè)序、fungus基因組精細(xì)圖測(cè)序、全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本測(cè)序服務(wù)。上海地區(qū)16s高通量測(cè)序技術(shù)

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序技術(shù)可以檢測(cè)復(fù)雜組織中單個(gè)細(xì)胞不同的生物學(xué)特性，這可以極大的幫助我們進(jìn)一步了解細(xì)胞與細(xì)胞之間的差異。"這幾乎就像通過(guò)幾顆星星看到了整個(gè)宇宙。"哈佛大學(xué)分子和細(xì)胞生物學(xué)教授 Alexander Schier的這句話應(yīng)用在這里也是很合適了。這幅圖正是來(lái)自于在2018年4月 Science 雜志發(fā)表的三篇[8-10]來(lái)自哈佛醫(yī)學(xué)院和哈佛大學(xué)的研究人員關(guān)于單細(xì)胞基因測(cè)序文章中的一幅結(jié)果圖，Alexander Schier教授也是其中一篇文章的作者。這幾篇文章使用多種檢測(cè)技術(shù)組合，其中包括對(duì)數(shù)千個(gè)發(fā)育中的斑馬魚(yú)和青蛙胚胎單細(xì)胞測(cè)序，在胚胎發(fā)育建議初的24小時(shí)內(nèi)追蹤單個(gè)細(xì)胞的發(fā)育情況，可以揭示出胚胎細(xì)胞何時(shí)何地轉(zhuǎn)變?yōu)樾碌募?xì)胞狀態(tài)和類(lèi)型并向我們展示了組織和整個(gè)機(jī)體從單細(xì)胞發(fā)育的完整歷程。上海地區(qū)16s高通量測(cè)序技術(shù)

生工生物工程（上海）股份有限公司總部位于香閔路698號(hào)，是一家研發(fā)、生產(chǎn)化學(xué)試劑、生化試劑、生物試劑、耗材、小型儀器及生物工程相關(guān)產(chǎn)品(以上經(jīng)營(yíng)涉及位險(xiǎn)化學(xué)品的只有分裝業(yè)務(wù))，銷(xiāo)售公司自產(chǎn)產(chǎn)品并提供售后技術(shù)服務(wù);從事上述產(chǎn)品的同類(lèi)商品(危險(xiǎn)化學(xué)品限許可證規(guī)定范圍)的進(jìn)出口、批發(fā)、傭金代理(拍實(shí)除外)及相關(guān)配套服務(wù);提供生物工程技術(shù)服務(wù)、技術(shù)開(kāi)發(fā)、技術(shù)咨詢(xún)。:提供倉(cāng)儲(chǔ)業(yè)務(wù)。 【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目。經(jīng)相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】的公司。公司自創(chuàng)立以來(lái)，投身于生化試劑，實(shí)驗(yàn)耗材，實(shí)驗(yàn)試劑，研發(fā)，是醫(yī)藥健康的主力軍。生工生物不斷開(kāi)拓創(chuàng)新，追求出色，以技術(shù)為先導(dǎo)，以產(chǎn)品為平臺(tái)，以應(yīng)用為重點(diǎn)，以服務(wù)為保證，不斷為客戶(hù)創(chuàng)造更高價(jià)值，提供更優(yōu)服務(wù)。生工生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康行業(yè)。滿(mǎn)足市場(chǎng)需求，提高產(chǎn)品價(jià)值，是我們前行的力量。