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生工優(yōu)勢(shì):1.生工高通量測(cè)序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗(yàn),日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動(dòng)物組織/細(xì)胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過(guò)程。2.生物信息分析經(jīng)驗(yàn)豐富,可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容(以生工分析報(bào)告模板為準(zhǔn)),全部無(wú)費(fèi)用。3.生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系,可以承接從分子到蛋白各個(gè)層級(jí)的實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目。一站式解決問(wèn)題。目前,生工生物已開(kāi)展10x單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(scRNA-seq)服務(wù),如果正好您有需要,那就快快來(lái)call我們吧!生工生物 高通量測(cè)序應(yīng)用
懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細(xì)胞懸液質(zhì)檢關(guān)卡究竟是怎樣運(yùn)作的呢?單細(xì)胞懸液質(zhì)控要求:?細(xì)胞濃度:700-1200cells/μl;?細(xì)胞活率>80%(當(dāng)細(xì)胞懸液活率低于70%時(shí)建議進(jìn)行去除死細(xì)胞處理);細(xì)胞團(tuán)及碎片雜質(zhì)<5%(無(wú)細(xì)胞粘連,無(wú)明顯的細(xì)胞碎片和細(xì)胞團(tuán),并保證細(xì)胞的完整性);?細(xì)胞狀態(tài):細(xì)胞直徑在7-40um之間(細(xì)胞直徑過(guò)大則建議進(jìn)行抽核處理);?不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和非細(xì)胞的核酸分子。上海單細(xì)胞測(cè)序高通量測(cè)序公司單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序指在單細(xì)胞水平上對(duì) mRNA 進(jìn)行高通量測(cè)序和分析的技術(shù)。
對(duì)于細(xì)胞樣品,送樣量需達(dá)到 5 × 106(5乘10的6次方)數(shù)量級(jí)。富集后置于 2 ml Ep管中,用 1 ml TRIzol 重懸,注意取樣后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰中用保溫箱寄送。強(qiáng)烈建議細(xì)胞樣品先做細(xì)胞鑒定及支原體/衣原體污染之后,再送出來(lái)。對(duì)于血液樣本,只接收未凍存過(guò)的抗凝血新鮮樣本。抗凝劑不可使用肝素鈉,可用EDTA或ACD抗凝劑,取血后以冰袋保存,切記不能使血液凍結(jié),從取血之時(shí)開(kāi)始計(jì)算,須在48小時(shí)之內(nèi)送達(dá)生工上??偛扛咄繙y(cè)序部。如果不能提供新鮮樣本,則請(qǐng)?zhí)峁难褐刑崛〉目俁NA樣本。備樣要求詳見(jiàn)B、RNA 樣品。
生工外顯子測(cè)序,項(xiàng)目介紹:已知人類(lèi)基因組上有180000個(gè)外顯子,占整個(gè)基因組約1-2%。這些區(qū)域主要負(fù)責(zé)編碼蛋白。絕大多數(shù)的單基因遺傳突變與復(fù)雜疾病突變都發(fā)生在外顯子區(qū)域。相比于全基因組重測(cè) 序,全外顯子捕獲測(cè)序有測(cè)序深度高、價(jià)格便宜的優(yōu)勢(shì),性價(jià)比很高。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng),可以高效富集人全外顯子區(qū)域,并結(jié)合Illumina XTen測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行深度測(cè)序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測(cè),形成完整的分析報(bào)告。RNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類(lèi)似容器里,并旋緊蓋子。
為什么要用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)?細(xì)胞是生物體結(jié)構(gòu)和功能的基本單位,在生物體生長(zhǎng)發(fā)育的過(guò)程中,因細(xì)胞類(lèi)型、外界環(huán)境以及內(nèi)部調(diào)節(jié)因素的不同,其轉(zhuǎn)錄組信息也不盡相同。由于基因組和表觀遺傳的重編程,以及在細(xì)胞分裂和分化過(guò)程中出現(xiàn)的誤差造成來(lái)自同一細(xì)胞系或個(gè)體的細(xì)胞呈現(xiàn)出不同的基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組[4]。這就是我們上面提到的細(xì)胞異質(zhì)性。細(xì)胞異質(zhì)性是生物組織和生物系統(tǒng)的普遍特征[5]。但是我們常規(guī)的二代測(cè)序檢測(cè)的是一個(gè)細(xì)胞群體的基因組、轉(zhuǎn)錄組的信息,如培養(yǎng)的大量細(xì)胞、動(dòng)植物組織甚至是整個(gè)生物體。在過(guò)去的20多年中,人們對(duì)轉(zhuǎn)錄組的人數(shù)仍然局限在群體水平[6]。這種方法可以為我們提供大量的基因組或轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),卻無(wú)法揭示細(xì)胞的異質(zhì)性。傳統(tǒng)方法得到的是細(xì)胞群的平均基因組,而單細(xì)胞測(cè)序測(cè)量的是細(xì)胞群中單個(gè)細(xì)胞的基因組[7]?,F(xiàn)在也有學(xué)者為了區(qū)分傳統(tǒng)測(cè)序和單細(xì)胞測(cè)序的區(qū)別,將傳統(tǒng)方法稱(chēng)為批量測(cè)序。寄送RNA樣品請(qǐng)置于1.5 ml離心管中,管上注明樣品名稱(chēng)、濃度以及制備時(shí)間,管口使用Parafilm封口。上海轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序平臺(tái)
生工生物接受客戶自備文庫(kù)測(cè)序項(xiàng)目。生工生物 高通量測(cè)序應(yīng)用
全基因組測(cè)序是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體的基因組測(cè)序,其研究主要包括3個(gè)方面:第一種為不參考任何現(xiàn)有序列從頭組裝測(cè)序,是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行基因組測(cè)序,并綜合利用不同測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)工具對(duì)研究物種進(jìn)行序列拼接和修正,進(jìn)而獲得該物種的基因組序列圖譜;第二種為常見(jiàn)的全基因組重測(cè)序,是對(duì)已知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體或群體的測(cè)序研究,建立一個(gè)測(cè)序文庫(kù)進(jìn)行單個(gè)個(gè)體或不同個(gè)體混合池測(cè)序,發(fā)現(xiàn)遺傳變異標(biāo)記,進(jìn)行后續(xù)的研究;第三種是在已有參考基因組序列圖譜的基礎(chǔ)上,對(duì)不同品種的具有代表性個(gè)體建立多個(gè)文庫(kù)進(jìn)行全基因組從頭組裝測(cè)序,此方法能夠進(jìn)一步的進(jìn)行參考基因組的修補(bǔ)和發(fā)現(xiàn)短序列比對(duì)難以發(fā)現(xiàn)的遺傳變異。生工生物擁有眾多生物信息分析人才,可進(jìn)行專(zhuān)業(yè)的項(xiàng)目分析,為客戶提供個(gè)性化服務(wù)。生工生物 高通量測(cè)序應(yīng)用
生工生物工程(上海)股份有限公司致力于醫(yī)藥健康,以科技創(chuàng)新實(shí)現(xiàn)高質(zhì)量管理的追求。生工生物作為醫(yī)藥健康的企業(yè)之一,為客戶提供良好的生化試劑,實(shí)驗(yàn)耗材,實(shí)驗(yàn)試劑,研發(fā)。生工生物不斷開(kāi)拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺(tái),以應(yīng)用為重點(diǎn),以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價(jià)值,提供更優(yōu)服務(wù)。生工生物創(chuàng)始人王啟松,始終關(guān)注客戶,創(chuàng)新科技,竭誠(chéng)為客戶提供良好的服務(wù)。