上海市轉(zhuǎn)錄組高通量測序平臺

IlluminaHiSeq2500/4000可以運(yùn)行PE150/PE250模式，可以承擔(dān)轉(zhuǎn)錄組測序、人基因組重測序、外顯子捕獲測序、宏基因組測序、微生物分類測序等服務(wù)；IlluminaMiSeq運(yùn)行PE300模式，可以承擔(dān)細(xì)菌基因組重測序/Denovo測序、微生物分類測序、擴(kuò)增子測序、核酸適配體測序等服務(wù)；LifeIontorrentPGM運(yùn)行314、316、318芯片，可以承接擴(kuò)增子測序、靶區(qū)域測序、基因組重測序服務(wù)；PacBioSequel/RSII該測序平臺讀長超長，平均可達(dá)10kb以上，主要承接細(xì)菌基因組完成圖測序、***基因組精細(xì)圖測序、全長轉(zhuǎn)錄本測序等服務(wù)；小RNA測測序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒。上海市轉(zhuǎn)錄組高通量測序平臺

單細(xì)胞測序是什么？單細(xì)胞測序是基于高通量測序（Next-generationsequencingtechnology，NGS）方法，檢測群體中單細(xì)胞基因組、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞表觀基因組及單細(xì)胞蛋白組，提供細(xì)胞間差異的高分辨率視圖，從分子水平揭示細(xì)胞奧秘。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序（Single-cellRNA-Sequencing，ScRNA-Seq）指在單細(xì)胞水平上對mRNA進(jìn)行高通量測序和分析的技術(shù)。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序能獲得單個(gè)細(xì)胞內(nèi)近萬個(gè)基因的表達(dá)信息，為辨別生物組織中各種細(xì)胞類型的轉(zhuǎn)錄組特征和全方面揭示細(xì)胞之間基因表達(dá)的異質(zhì)性提供了有力的工具[3]。說到細(xì)胞異質(zhì)性（Cellheterogeneity)，就要說到我們?yōu)槭裁匆脝渭?xì)胞測序技術(shù)了。上海地區(qū)基因組高通量測序技術(shù)如果你的樣品是質(zhì)?；蛘呤蔷?，那為什么不試試我們的KBSeq呢？

為什么要用單細(xì)胞測序技術(shù)？細(xì)胞是生物體結(jié)構(gòu)和功能的基本單位，在生物體生長發(fā)育的過程中，因細(xì)胞類型、外界環(huán)境以及內(nèi)部調(diào)節(jié)因素的不同，其轉(zhuǎn)錄組信息也不盡相同。由于基因組和表觀遺傳的重編程，以及在細(xì)胞分裂和分化過程中出現(xiàn)的誤差造成來自同一細(xì)胞系或個(gè)體的細(xì)胞呈現(xiàn)出不同的基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組[4]。這就是我們上面提到的細(xì)胞異質(zhì)性。細(xì)胞異質(zhì)性是生物組織和生物系統(tǒng)的普遍特征[5]。但是我們常規(guī)的二代測序檢測的是一個(gè)細(xì)胞群體的基因組、轉(zhuǎn)錄組的信息，如培養(yǎng)的大量細(xì)胞、動(dòng)植物組織甚至是整個(gè)生物體。在過去的20多年中，人們對轉(zhuǎn)錄組的人數(shù)仍然局限在群體水平[6]。這種方法可以為我們提供大量的基因組或轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，卻無法揭示細(xì)胞的異質(zhì)性。傳統(tǒng)方法得到的是細(xì)胞群的平均基因組，而單細(xì)胞測序測量的是細(xì)胞群中單個(gè)細(xì)胞的基因組[7]?，F(xiàn)在也有學(xué)者為了區(qū)分傳統(tǒng)測序和單細(xì)胞測序的區(qū)別，將傳統(tǒng)方法稱為批量測序。

高通量測序技術(shù)是可以平行對數(shù)百萬甚至數(shù)十億條序列測序的技術(shù)。在基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、宏基因組測序、表觀遺傳測序、外顯子捕獲測序、靶區(qū)域測序等諸多科研及精細(xì)醫(yī)療檢測領(lǐng)域內(nèi)有普遍的運(yùn)用。生工生物工程（上海）股份有限公司自2011年成立高通量測序部以來，逐步引進(jìn)了Illumina，Life，PacBio等二代/三代測序平臺。建立了2000m2高標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室（通過了國家ISO認(rèn)證）以及10PB級運(yùn)算能力的服務(wù)器集群，能滿足絕大多數(shù)科研客戶的研究需要。同時(shí)，生工高通量測序團(tuán)隊(duì)建設(shè)也在不斷完善中，目前有50余專職員工，其中高級技術(shù)人員以及高級生物信息工程師占比50%以上，5年來，通過生工高通量測序結(jié)果發(fā)表的文章累計(jì)影響因子超過1000分以上。請注意選擇無RNA酶的容器盛放樣本，盡量避免RNA降解。

生工人、大、小鼠全基因組測序，項(xiàng)目介紹：人或者大、小鼠全部基因組重測序，研究其突變信息（包括SNP/InDel/CNV/SV），并注釋突變位點(diǎn)信息。該技術(shù)可同時(shí)獲取編碼區(qū)及非編碼區(qū)突變信息，被廣泛應(yīng)用于遺傳病、tumour及其它其它疾病研究中。測序平臺：HiSeq XTen平臺進(jìn)行PE150測序。生工微生物基因組測序，項(xiàng)目介紹：微生物基因組重測序（有參）目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對某些物種微生物進(jìn)行進(jìn)行物種進(jìn)化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測序技術(shù)，對有參考基因組微生物進(jìn)行多個(gè)體的基因組重測序，精細(xì)分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。X儀器本身有16個(gè)通道（Controller為8通道），每個(gè)通道極限多捕獲20000個(gè)細(xì)胞（Controller為10000個(gè)細(xì)胞） 。上海宏全基因組高通量測序公司

近年來，隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展和普及，單細(xì)胞測序技術(shù)發(fā)展十分迅速。上海市轉(zhuǎn)錄組高通量測序平臺

真核/原核無參mRNA-Seq，項(xiàng)目介紹；測序使用Illumina Xten平臺，測序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后進(jìn)行拼接，并進(jìn)一步對拼接所得轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行功能注釋、CDD、CDS分析，SNP分析，SSR標(biāo)記開發(fā)等分析。在計(jì)算基因的表達(dá)量后，進(jìn)行基因表達(dá)差異及差異基因GO、KOG（原核生物為COG）、KEGG功能富集分析，KEGG pathway等分析。對于多個(gè)樣本，可進(jìn)行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達(dá)分析、PCA主成分分析。另外，還可以進(jìn)行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析，深入研究基因功能，進(jìn)一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息，為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)理提供方向。 上海市轉(zhuǎn)錄組高通量測序平臺

生工生物工程（上海）股份有限公司是一家研發(fā)、生產(chǎn)化學(xué)試劑、生化試劑、生物試劑、耗材、小型儀器及生物工程相關(guān)產(chǎn)品(以上經(jīng)營涉及位險(xiǎn)化學(xué)品的只有分裝業(yè)務(wù))，銷售公司自產(chǎn)產(chǎn)品并提供售后技術(shù)服務(wù);從事上述產(chǎn)品的同類商品(危險(xiǎn)化學(xué)品限許可證規(guī)定范圍)的進(jìn)出口、批發(fā)、傭金代理(拍實(shí)除外)及相關(guān)配套服務(wù);提供生物工程技術(shù)服務(wù)、技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢。:提供倉儲業(yè)務(wù)。 【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目。經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng)】的公司，是一家集研發(fā)、設(shè)計(jì)、生產(chǎn)和銷售為一體的專業(yè)化公司。生工生物深耕行業(yè)多年，始終以客戶的需求為向?qū)?，為客戶提供高質(zhì)量的生化試劑，實(shí)驗(yàn)耗材，實(shí)驗(yàn)試劑，研發(fā)。生工生物致力于把技術(shù)上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產(chǎn)品上的貼心，為用戶帶來良好體驗(yàn)。生工生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場，以敏銳的市場洞察力，實(shí)現(xiàn)與客戶的成長共贏。