術(shù)語解釋：Cox回歸：又稱比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型(proportionalhazardsmodel，簡稱Cox模型)，是由英國統(tǒng)計(jì)學(xué)家。該模型以生存結(jié)局和生存時(shí)間為應(yīng)變量，可同時(shí)分析多種因素對于生存期長短的影響。Cox模型能分析帶有截尾生存時(shí)間的資料，且不要求估計(jì)資料的生存分布類型，因此在醫(yī)學(xué)界被***使用。Logistic回歸：又稱邏輯回歸模型，屬于廣義線性模型。邏輯回歸是一種用于解決二分類問題的分析方法，用于估計(jì)某種事物的可能性。相較于傳統(tǒng)線性模型，邏輯回歸模型以概率形式輸出結(jié)果，可控性高且結(jié)果可解釋性強(qiáng)。數(shù)據(jù)要求：樣本臨床信息或生物學(xué)特征（基因突變、基因表達(dá)等）樣本的隨訪數(shù)據(jù)（總生存期，生存狀態(tài)）或樣本的分組情況下游分析：1.補(bǔ)充相關(guān)因素的已有相關(guān)研究2.解釋相關(guān)因素對研究課題的意義。 云生物數(shù)據(jù)分析需要多久？四川數(shù)據(jù)科學(xué)經(jīng)驗(yàn)豐富
當(dāng)前位置：首頁>商城導(dǎo)航>immunetherapy免疫***收藏|分享immunetherapy免疫***價(jià)格：￥：標(biāo)準(zhǔn)套餐高級套餐購買數(shù)量：加入購物車立即購買產(chǎn)品詳情產(chǎn)品評論(0)immunetherapy免疫療法免疫療法是指利用人體自身免疫系統(tǒng)，來終止**細(xì)胞。它通過操縱免疫系統(tǒng)，來實(shí)現(xiàn)靶向**抗原或突破T細(xì)胞浸潤的障礙。免疫系統(tǒng)是**的重要***者。很多臨床數(shù)據(jù)表明，**的發(fā)生與機(jī)體免疫功能密切相關(guān)，宿主免疫功能低下或受***往往都會(huì)導(dǎo)致**發(fā)生率增高。**能夠發(fā)生的原因之一在于**細(xì)胞的免疫逃逸和其分泌的免疫***因子，導(dǎo)致**微環(huán)境中的免疫細(xì)胞獲得免疫***性。因此重新***免疫細(xì)胞，逆轉(zhuǎn)**微環(huán)境的免疫***狀態(tài)，是免疫療法的重要目標(biāo)。應(yīng)用場景預(yù)測單個(gè)樣本或者某亞型對免疫***的響應(yīng)可能性基本原理：通過靶向***免疫檢查點(diǎn)受體——CTLA4，PD1及其配體（PDL1，PDL2），來抵抗**微環(huán)境的免疫***作用，進(jìn)而解除機(jī)體免疫***，****功能發(fā)揮抗**作用。PD-1是共刺激受體B7/CD28家族的成員。它通過與其配體programmeddeathligand1（PD-L1）和programmeddeathligand2（PD-L2）結(jié)合來調(diào)節(jié)T細(xì)胞活化。CTLA-4介導(dǎo)的T細(xì)胞***。 四川數(shù)據(jù)科學(xué)經(jīng)驗(yàn)豐富胰腺疾病預(yù)后相關(guān)長鏈非編碼RNA。
RoastROAST是一種差異表達(dá)分析方法，有助于提高統(tǒng)計(jì)能力、組織和解釋結(jié)果以及在不同實(shí)驗(yàn)中的關(guān)聯(lián)表達(dá)模式，一般適用于microarray、RNA-seq的表達(dá)矩陣，用limma給全部基因做差異表達(dá)分析，不需要篩差異表達(dá)基因?；驹恚篟OAST是一種假設(shè)驅(qū)動(dòng)的測試，對結(jié)果基因集做富集分析，富集分析考慮基因集中基因的方向性(上調(diào)或下調(diào))和強(qiáng)度(log2倍變化)，判斷上/下調(diào)基因是否***富于集目標(biāo)基因集；ROAST使用rotation,一種MonteCarlotechnology的多元回歸方法，適用于樣本數(shù)量較少的情況；roast檢驗(yàn)一個(gè)geneset，對于復(fù)雜矩陣，使用mroast做multipleroasttests。富集分析結(jié)果用barcodeplot展示，使上/下調(diào)基因在目標(biāo)基因集中的分布可視化。數(shù)據(jù)要求：表達(dá)矩陣。
mutationEvents**已存在的基因突變會(huì)影響其他基因的突變，突變分析時(shí)確定這些基因突變潛在的相互作用，能更好地了解健康細(xì)胞轉(zhuǎn)化為*細(xì)胞的過程和機(jī)制。DISCOVER，一種針對基因突變的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)工具，幫助尋找***的基因突變間互斥性和共現(xiàn)性。一般可應(yīng)用的研究場景：探索一組基因是否在**中存在互斥性和共現(xiàn)性；基于基因突變的互斥性和共現(xiàn)性，研究**發(fā)***展的潛在機(jī)制?；驹恚篋ISCOVER（DiscreteIndependenceStatisticControllingforObservationswithVaryingEventRates）是一種用于檢測**基因組數(shù)據(jù)的共現(xiàn)性和互斥性的新統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)方法。與Fisher'sexacttest等用于這些任務(wù)的傳統(tǒng)方法不同的是，DISCOVER基于一個(gè)空模型，該模型考慮了總體**特異性的變化率，從而決定變化率的同時(shí)發(fā)生的頻率是否高于或低于預(yù)期。該方法避免了共現(xiàn)檢測中的虛假關(guān)聯(lián)，提高了檢測互斥性的統(tǒng)計(jì)能力。DISCOVER的性能與其他幾個(gè)已發(fā)布的互斥性測試相比，在整個(gè)***性水平范圍內(nèi)，DISCOVER在控制假陽性率的同時(shí)更敏感。 circos圖通過圓圈和連線展示多個(gè)亞組之間的關(guān)系，包括且不限于基因、基因片段、亞型。
術(shù)語解讀
數(shù)據(jù)降維：
降維就是一種對高維度特征數(shù)據(jù)預(yù)處理方法。降維是將高維度的數(shù)據(jù)保留下**重要的一些特征，去除噪聲和不重要的特征，從而實(shí)現(xiàn)提升數(shù)據(jù)處理速度的目的。在實(shí)際的生產(chǎn)和應(yīng)用中，降維在一定的信息損失范圍內(nèi)，可以為我們節(jié)省大量的時(shí)間和成本。降維也成為應(yīng)用非常***的數(shù)據(jù)預(yù)處理方法。
數(shù)據(jù)要求：
表達(dá)譜芯片或測序數(shù)據(jù)（已經(jīng)過預(yù)處理）
下游分析
得到PCA分析結(jié)果之后的分析有：
1.對組成主要成分的基因進(jìn)行后續(xù)分析，探究該情況下關(guān)鍵基因表達(dá)情況
2.對組成不同主成分簇的基因進(jìn)行后續(xù)分析，探究該情況下不同基因集的表達(dá)情況 調(diào)控區(qū)域ChiP-seq信號(hào)分布圖。北京臨床統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)科學(xué)經(jīng)驗(yàn)豐富
我們團(tuán)隊(duì)具備完整的數(shù)據(jù)分析、數(shù)據(jù)庫構(gòu)建、軟件開發(fā)團(tuán)隊(duì)。四川數(shù)據(jù)科學(xué)經(jīng)驗(yàn)豐富
Nomogram列線圖（nomogram，諾莫圖）是在平面直角坐標(biāo)系中，用一簇互不相交的線段表示多個(gè)臨床指標(biāo)或者生物學(xué)特征，用以預(yù)測一定的臨床結(jié)局或者某類事件發(fā)生的概率的圖。列線圖使預(yù)測模型的結(jié)果更具有可讀性，可個(gè)性化地計(jì)算特定**患者生存率,在臨床實(shí)踐中有較大的價(jià)值。一般可應(yīng)用的研究方向有：將回歸的結(jié)果進(jìn)行可視化呈現(xiàn)，對個(gè)體樣本給出其發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)或比例風(fēng)險(xiǎn)；根據(jù)多個(gè)臨床指標(biāo)或生物學(xué)特征，判斷個(gè)體樣本的疾病分類或特征。基本原理：列線圖的理論于1884年提出，**早用于工程學(xué)。它能夠?qū)?fù)雜的計(jì)算公式以圖形的方式，快速、直觀、精確的展現(xiàn)出來。列線圖通過構(gòu)建多因素回歸模型（例如Cox回歸、Logistic回歸等），根據(jù)模型中各個(gè)影響因素對結(jié)局變量的影響程度的高低，即回歸系數(shù)的大小，給每個(gè)影響因素的每個(gè)取值水平進(jìn)行賦分。將各個(gè)評分相加得到總評分，通過總評分與結(jié)局事件發(fā)生概率之間的函數(shù)轉(zhuǎn)換關(guān)系，從而計(jì)算出該個(gè)體結(jié)局事件的預(yù)測概率。校準(zhǔn)曲線（calibrationcurve）為實(shí)際發(fā)生率和預(yù)測發(fā)生率的散點(diǎn)圖，常于用于化工行業(yè)溶液配制。在這里通過觀察預(yù)測值與實(shí)際值相差情況，判斷基于回歸模型構(gòu)建列線圖的有效性。 四川數(shù)據(jù)科學(xué)經(jīng)驗(yàn)豐富