天津拷貝數(shù)變異數(shù)字PCR怎么樣

來源: 發(fā)布時(shí)間:2021-09-11

20 世紀(jì)末,Vogelstein等提出數(shù)字PCR(digital PCR,dPCR) 的概念,通過將一個(gè)樣本分成幾十到幾萬份,分配到不同的反應(yīng)單元,每個(gè)單元包含一個(gè)或多個(gè)拷貝的目標(biāo)分子( DNA 模板) ,在每個(gè)反應(yīng)單元中分別對(duì)目標(biāo)分子進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增結(jié)束后對(duì)各個(gè)反應(yīng)單元的熒光信號(hào)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。與 qPCR 不同的是,數(shù)字PCR不依賴于CT值,因此不受擴(kuò)增效率影響,擴(kuò)增結(jié)束后通過直接計(jì)數(shù)或泊松分布公式來計(jì)算每個(gè)反應(yīng)單元的平均濃度(含量),能夠?qū)⒄`差控制在5%以內(nèi),數(shù)字PCR 可以不需要對(duì)照標(biāo)準(zhǔn)樣品和標(biāo)準(zhǔn)曲線來實(shí)現(xiàn)***定量分析。肺*T790M突變-cfDNA動(dòng)態(tài)監(jiān)測。天津拷貝數(shù)變異數(shù)字PCR怎么樣

值得注意的是,在gDNA長度≥20kb或進(jìn)行拷貝數(shù)變異檢測實(shí)驗(yàn)時(shí),必須對(duì)樣品進(jìn)行酶切處理,確保大片段DNA序列或串聯(lián)序列在酶切處理后,模板隨機(jī)且均勻的進(jìn)入**反應(yīng)體系,以實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確和精確的定量。數(shù)字PCR實(shí)驗(yàn)離不開包含有Mg2+、dNTP、Buffer和DNA聚合酶等PCR反應(yīng)所需要的MasterMix。隨著實(shí)驗(yàn)的不斷深入,對(duì)于實(shí)驗(yàn)條件的要求也不斷提高,其中DNA聚合酶對(duì)實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性起著至關(guān)重要的作用。由于非熱啟動(dòng)的DNA聚合酶在反應(yīng)體系易使引物在室溫條件下發(fā)生非特異性擴(kuò)增,直接影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。四川PCR數(shù)字PCR售后服務(wù)市場想象空間大,國內(nèi)外入局者眾多。

*****的實(shí)時(shí)監(jiān)控:已有數(shù)篇文章報(bào)道了使用數(shù)字PCR技術(shù)對(duì)患者***過程中的循環(huán)**DNA(ctDNA)進(jìn)行檢測,實(shí)時(shí)監(jiān)控疾病進(jìn)展。在非小細(xì)胞肺*、乳腺*和腸*等多種**患者中都取得了令人鼓舞的結(jié)果。與影像學(xué)及其他常規(guī)指標(biāo)相比,ctDNA突變及豐度改變通常會(huì)提前數(shù)月出現(xiàn),這樣就可以提醒醫(yī)生及時(shí)調(diào)整***方案,使患者得到更有效的***。無創(chuàng)產(chǎn)前篩查:唐氏綜合征、地中海貧血或胎兒遺傳性耳聾基因檢測等,目前無創(chuàng)檢測標(biāo)本來源主要為孕婦血液,檢測胎兒DNA會(huì)受到母體DNA的干擾,依靠數(shù)字PCR可提高檢測準(zhǔn)確性。對(duì)比NGS,數(shù)字PCR技術(shù)可以提高工作效率、降低檢測成本。

該技術(shù)提出至今雖然只有十幾年時(shí)間,但是由于其獨(dú)特的技術(shù)優(yōu)勢和應(yīng)用前景,使得其產(chǎn)業(yè)化發(fā)展相當(dāng)迅速。迄今為止,已有包括Fluidigm和 Bio-Rad等幾家公司相繼推出了數(shù)字 PCR 產(chǎn)品,并已經(jīng)應(yīng)用于單細(xì)胞分析、**早期診斷和產(chǎn)前診斷等研究領(lǐng)域。目前,有關(guān)數(shù)字 PCR 技術(shù)的綜述類文獻(xiàn)并不多見,本文將在現(xiàn)有文獻(xiàn)基礎(chǔ)上,對(duì)該技術(shù)的原理、定量方法、分類及應(yīng)用進(jìn)行評(píng)述,并對(duì)發(fā)展趨勢進(jìn)行展望。數(shù)字 PCR 技術(shù)提出至今,相關(guān)技術(shù)和產(chǎn)業(yè)化發(fā)展都非常迅速。迄今為止,數(shù)字 PCR 技術(shù)主要有三類: 微反應(yīng)室/孔板、大規(guī)模集成微流控芯片和液滴數(shù)字PCR系統(tǒng)。高效篩查胎兒疾病,提高無創(chuàng)產(chǎn)檢普及性和依從性。

數(shù)字PCR是一種新的核酸檢測和定量方法,借助微液滴或微坑,通過單個(gè)模板分子的PCR擴(kuò)增,可實(shí)現(xiàn)不依賴于標(biāo)準(zhǔn)曲線和參照樣本的準(zhǔn)確、***定量。數(shù)字PCR使得反應(yīng)更靈敏、結(jié)果更可靠、展示更直觀,尤其適用于微量或痕量DNA檢測與定量?;虮磉_(dá)差異研究:數(shù)字PCR可以提供比實(shí)時(shí)熒光定量PCR更精確的基因差異表達(dá)研究,尤其對(duì)于那些靶基因表達(dá)差異微小的情況,如:mRNA、microRNA、lncRNAs等的表達(dá)分析;等位基因的不平衡表達(dá);單細(xì)胞基因表達(dá)分析;外泌體核酸分子定量分析等。制藥公司巨頭羅氏等也有數(shù)字PCR產(chǎn)品在研。云南拷貝數(shù)變異數(shù)字PCR口碑推薦

增加引物或探針的Tm值,從而實(shí)現(xiàn)更短的引物和探針設(shè)計(jì)。天津拷貝數(shù)變異數(shù)字PCR怎么樣

單細(xì)胞的基因表達(dá)分析:基因表達(dá)分析有助于了解細(xì)胞和組織的特征及其如何應(yīng)對(duì)發(fā)育和環(huán)境信號(hào)的改變。檢測已知和未知基因轉(zhuǎn)錄水平的方法在過去的四十多年來發(fā)生了翻天覆地的變化,變得更加有效,更加敏感,定量更加精細(xì),能夠一次性對(duì)大量的基因轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行分析。但是,在組成復(fù)雜的細(xì)胞混合物中,盡管***表達(dá)的基因可以被識(shí)別出來,但來自于少數(shù)細(xì)胞群體(例如干細(xì)胞)的轉(zhuǎn)錄本卻很可能會(huì)被掩蓋掉,尤其是在每個(gè)細(xì)胞中以低豐度形式出現(xiàn)的轉(zhuǎn)錄本。為了解決這個(gè)問題,單細(xì)胞檢測技術(shù)應(yīng)用而生,而且逐漸受到了越來越多的重視。ddPCR在單細(xì)胞分析中的優(yōu)勢在于它不需要標(biāo)準(zhǔn)曲線就能進(jìn)行***定量。而且,由于能夠以非常高的敏感性區(qū)分至少五種不同的基因轉(zhuǎn)錄本,因此無需進(jìn)行其他方法所要求的單細(xì)胞cDNA預(yù)擴(kuò)增,這可以消除預(yù)擴(kuò)增和NGS文庫準(zhǔn)備中潛在的轉(zhuǎn)錄本定量失真,能夠能加真實(shí)的反映單細(xì)胞群體中關(guān)鍵基因的特征。天津拷貝數(shù)變異數(shù)字PCR怎么樣