山東小基因組完成圖小基因組測(cè)序多少錢(qián)

技術(shù)優(yōu)勢(shì)：

1. 業(yè)內(nèi)**的mtDNA&cpDNA富集抽提服務(wù)：自主研發(fā)的細(xì)胞器基因組富集提取技術(shù)，高效實(shí)現(xiàn)高質(zhì)量細(xì)胞器基因組富集。

2. 一對(duì)一的生物信息分析，人工基因注釋矯正：告別在線注釋平臺(tái)的偏差，滿足NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)上傳要求，高質(zhì)量結(jié)果交付，助力高水平研究。

3. **技術(shù)團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人均9年以上從業(yè)經(jīng)驗(yàn)，項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)豐富，提供可以個(gè)性化方案定制。

4. 已完成葉綠體&線粒體基因組項(xiàng)目數(shù)百例，96%以上樣本實(shí)現(xiàn)完成圖水平交付。

5. 配套數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建服務(wù)，提升科研水準(zhǔn)，助力高水平研究發(fā)表。 小基因組測(cè)序樣本怎么制備呢？山東小基因組完成圖小基因組測(cè)序多少錢(qián)

1.測(cè)序數(shù)據(jù)概況

(1) 原始測(cè)序數(shù)據(jù)說(shuō)明

(2) 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控及統(tǒng)計(jì)

(3) 三代測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)

2.基因組組裝

3. 基因組組分分析

(1) 編碼基因分析

(2) ORFs掃描及跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

(3) 非編碼RNA分析

4. 基因功能注釋

 基因組圈圖

高級(jí)分析：

比較基因組分析

1.SNP檢測(cè)與注釋

2.Indel檢測(cè)與注釋

3.SV檢測(cè)

4.基因組共線性分析

5.線粒體與葉綠體基因組片段交流分析

6.共有和特有基因分析

7.系統(tǒng)進(jìn)化分析、選擇壓力分析

定制化生信分析

1.密碼子偏好性分析

2.長(zhǎng)重復(fù)序列Long repeat分析

3.簡(jiǎn)單重復(fù)序列SSR分析

4.基因表達(dá)量及表達(dá)差異分析（可由客戶提供RNAseq） 四川線粒體小基因組測(cè)序要多少錢(qián)小基因組測(cè)序的好處有很多。

基因組組裝：首先，利用ABySS v2.0.2初步組裝Illumina測(cè)序數(shù)據(jù)，然后利用blasR比對(duì)Pacbio三代數(shù)據(jù)，根據(jù)比對(duì)結(jié)果對(duì)單分子測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行一次矯正與糾錯(cuò)，目的在于減少單分子長(zhǎng)序列中單堿基、插入缺失的錯(cuò)誤；***利用糾正過(guò)的單分子測(cè)序數(shù)據(jù)與二代數(shù)據(jù)進(jìn)行混合組裝，使用的軟件是SPAdes-3.10.1；挑選覆蓋深度足夠高且組裝長(zhǎng)度較長(zhǎng)的序列作為候選序列，比對(duì)NT庫(kù)確認(rèn)；***再次利用Illumina數(shù)據(jù)進(jìn)行校驗(yàn)，得到**終的組裝結(jié)果。基因組組分分析：通過(guò)多種方法對(duì)編碼基因、非編碼RNA等進(jìn)行預(yù)測(cè)，獲取測(cè)序樣本基因組的組成情況。

虎耳草科植物cpDNA的重復(fù)序列和熱點(diǎn)區(qū)域：O. rupifraga-BJCP cpDNA***鑒定出58個(gè)gSSRs。其中，44個(gè)位于LSC區(qū)域，而8個(gè)和6個(gè)分別位于IR和SSC區(qū)域。 在這些SSR中，43個(gè)mo**1個(gè)di-，4個(gè)tetra-。在O. rupifraga和M. rossii的葉綠體基因組中，分別檢測(cè)到15和17個(gè)正向重復(fù)序列序列（>30bp），3個(gè)葉綠體基因組中都檢測(cè)到17個(gè)回文重復(fù)序列。在cpDNA中同事檢測(cè)到60bp、61bp、62bp和79bp長(zhǎng)重復(fù)序列。熱點(diǎn)區(qū)域?qū)殡S后的Oresitrophe和Mukdenia的系統(tǒng)地理學(xué)和分化歷史研究提供重要的遺傳信息。 小基因組測(cè)序的好處您了解嗎？

非編碼RNA分析：非編碼RNA（ncRNA）執(zhí)行多種生物學(xué)功能的RNA分子，其本身并不攜帶翻譯為蛋白質(zhì)的信息，直接在RNA水平對(duì)生命活動(dòng)發(fā)揮作用。相比于“垃圾RNA”的舊觀念，人們開(kāi)始認(rèn)識(shí)到生物體內(nèi)富含的這類RNA的無(wú)窮潛力。研究非編碼RNA不僅為了解生物體的基因表達(dá)調(diào)控系統(tǒng)和生長(zhǎng)提供了重要信息。對(duì)于葉綠體而言，非編碼RNA的主要類型包括rrn5，rrn4.5，rrn16，rrn23；植物線粒體的非編碼RNA類型包括rrn5，rrn18，rrn26；***和動(dòng)物線粒體的非編碼RNA類型包括rrnS，rrnL。云生物自主研發(fā)的Enrichment富集技術(shù)，可降低核DNA污染，將總DNA中靶細(xì)胞器基因組比例提升。青海線粒體小基因組測(cè)序多少錢(qián)

云生物提供小基因組測(cè)序的質(zhì)檢報(bào)告嗎？山東小基因組完成圖小基因組測(cè)序多少錢(qián)

葉綠體基因組 | “**”遺傳資源開(kāi)發(fā)新模式：葉綠體基因組結(jié)構(gòu)和特征：三個(gè)樣品的完整葉綠體基因組基本信息，包含由LSC（87,496-87,604bp）和SSC（18,222-18,342bp）區(qū)域分開(kāi)的兩個(gè)IR拷貝（25,507-25,519bp）。編碼相同的131個(gè)基因組，其中113個(gè)是獨(dú)特的，18個(gè)在IR區(qū)域中重復(fù)。113個(gè)獨(dú)特的基因包含79個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因，30個(gè)tRNA基因和4個(gè)rRNA基因。14個(gè)含有一個(gè)內(nèi)含子（6個(gè)tRNA基因和8個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因），3個(gè)含有兩個(gè)內(nèi)含子（rps12,clpP,ycf3）。 rps12基因的5'-末端外顯子位于LSC區(qū)域，基因的內(nèi)含子和3'-末端外顯子位于IR區(qū)域。山東小基因組完成圖小基因組測(cè)序多少錢(qián)