青島單細胞多組學服務(wù)機構(gòu)

來源: 發(fā)布時間:2022-09-17

單細胞多組學測序主要包含細胞分離、文庫構(gòu)建、高通量測序和生物信息學分析等步驟.因此,單細胞多組學測序技術(shù)的發(fā)展也為相關(guān)算法的開發(fā)帶來了機遇和挑戰(zhàn)。利用多模態(tài)計算方法不僅可以更好地進行細胞分群和譜系追蹤,還可以推斷基因表達調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和解析細胞在組織中的空間位置等信息。多組學的聯(lián)合分析需要解決的計算問題是如何將大量單細胞產(chǎn)生的多種不同的組學數(shù)據(jù)進行有效地生成、識別、整合與分析,并且降低數(shù)據(jù)背景噪音和樣本間的批次差異.目前,單細胞多組學的生物信息分析方法仍有待發(fā)展,面臨著諸多問題與挑戰(zhàn)。烈冰生物首批引進 Chromium X 平臺,開啟百萬級通量單細胞測序新時代。青島單細胞多組學服務(wù)機構(gòu)

相對于Smart-Seq技術(shù)在細胞數(shù)量上的問題,10X平臺普遍提供的細胞數(shù)量都在1000-20000不等的測序細胞量,這個量級的測序細胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此,這兩種技術(shù)對于基于基因表達進行準確細胞分型上,無論是從細胞數(shù)量上來說還是表達檢測可靠性來說,都會更實用。同時依托Random Cell Label技術(shù),使得其對于NovaSeq、HiSeq X Ten、Hiseq 4000等設(shè)備存在的Index hooping現(xiàn)象,相對于Smart-Seq數(shù)據(jù)來說,影響幾乎可以忽略不計(10X Genomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測試結(jié)果,顯示無影響。蘇州BD單細胞多組學服務(wù)機構(gòu)單細胞多組學突破了以往單細胞檢測的單一性,可更多樣化。

隨著單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)(scRNA-Seq)的蓬勃發(fā)展,其在在胚胎發(fā)育,腫瘤細胞異質(zhì)性,免疫細胞轉(zhuǎn)化等多方面屢建奇功,但是由于細胞形態(tài)的不同和單細胞制備中細胞敏感性的差異等因素影響,scRNA-Seq在數(shù)據(jù)分析時可能會出現(xiàn)細胞類型占比失真,個別細胞類型丟失等情況。為了克服單細胞測序技術(shù)的局限性,單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)(snRNA-Seq)應(yīng)運而生,snRNA-Seq可利用凍存組織直接制備單細胞核進行轉(zhuǎn)錄組測序,不僅克服了細胞形態(tài)差異致使的細胞捕獲差異,還克服了單細胞測序必須使用新鮮樣本的多個局限性。

FluidigmC1平臺基于富魯達(Fluidigm®)的微流控技術(shù)應(yīng)用于單細胞測序(SingleCellRNASequencing)領(lǐng)域的商業(yè)化中,該技術(shù)大約在幾個小時中可以捕獲96個左右的細胞,進行各類的Single-Cell測序建庫。當然,通量還是比較小。但不可否認的是,現(xiàn)在很多非RNA類SingleCell測序,仍然在采用這樣的技術(shù),如SingleCellDNA-Seq,SingleCellATAC-Seq等,都是采用此技術(shù)進行單細胞分選后再分別用不同試劑盒建庫。所以可以說,至少在10XGenomics、BD或者其他企業(yè)推出有效的SingleDNA測序技術(shù)之前,C1仍然會是市場上的重要組成部分。單細胞測序技術(shù)提供了單個細胞水平下的科學研究視角。

單細胞測序?qū)嶒炘贅颖炯毎蠙C分選簽,需要對細胞數(shù)量、細胞活性進行準確判斷,這對SingleCell分選標記、建庫、下機數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細胞計數(shù)偏高,將會影響建庫的成功率;計數(shù)偏低,則會顯著提高雙細胞的比例;而細胞活率過低,就會使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,因此把好單細胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,不同的液體流速將直接影響單細胞的入孔效果。因此烈冰生物BDRhapsody單細胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器,其具有PrimeTreat、CellLoad、BeadLoad、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式,來對應(yīng)各種不同的操作。通過已經(jīng)設(shè)定的程序來控制液體的流速,大幅度降低人為操作習慣帶來的差異,保證實驗操作的一致性。單細胞測序技術(shù)遍地開花,烈冰服務(wù)讓您的生物醫(yī)學研究如虎添翼。合肥BD Rhapsody單細胞多組學測序價格

未來,單細胞多組學測序技術(shù)的策略會繼續(xù)向轉(zhuǎn)錄組結(jié)合其他多個組學的三組學甚至四組學方向發(fā)展。青島單細胞多組學服務(wù)機構(gòu)

單細胞多組學技術(shù)優(yōu)勢:1. 構(gòu)建蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫,大幅度提高蛋白質(zhì)鑒定數(shù)量;2. 不同層面表達水平分析,構(gòu)建表達“全景圖”;3. 多組學交叉驗證:深層次挖掘其中調(diào)控機制;4. 對基因突變信息在蛋白水平上進行驗證;5.精細醫(yī)療:實現(xiàn)genomics到protegenomics的轉(zhuǎn)變。生物領(lǐng)域各個研究方面,1. 農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機制,生長發(fā)育機制,育種保護研究等;2. 畜牧業(yè):肉類及乳品質(zhì)研究,致病機理研究等;3. 基礎(chǔ)醫(yī)學、臨床診斷:生物標志物,疾病機理機制,疾病分型等;4. 生物醫(yī)藥:藥物作用機理,藥效評價,藥物開發(fā)等;5. 微生物領(lǐng)域:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等;6. 海洋水產(chǎn):漁業(yè)資源,海水養(yǎng)殖,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等;7. 生物能源、環(huán)境科學領(lǐng)域:發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),環(huán)境危定風險評估研究等;8.食品營養(yǎng):食品儲藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,功能性食品開發(fā),食品安全監(jiān)檢測等。青島單細胞多組學服務(wù)機構(gòu)

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