當(dāng)組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉(zhuǎn)錄組芯片上時，通過透化處理，細(xì)胞內(nèi)的mRNA釋放出來，從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲。被捕獲的mRNA開始逆轉(zhuǎn)錄，得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列。通過上機(jī)測序，可以將每個mRNA轉(zhuǎn)錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置。Visium空間轉(zhuǎn)錄組的重點(diǎn)在于芯片部分：正式文庫構(gòu)建的芯片上有4個捕獲區(qū)域（6.5mmX6.5mm，可以檢測4個樣本）每個捕獲區(qū)域含有約5000個被條形碼標(biāo)記的點(diǎn)（barcodedspots）每個spot直徑55μm，每個spot能捕獲1-10個細(xì)胞spot與spot中心點(diǎn)之間的距離為100μm每個spot含有上百萬個可以與mRNA結(jié)合的捕獲探針，每個探針上都帶有獨(dú)特的spatialbarcodes，用以標(biāo)記捕獲的mRNA的空間位置。個性化制定測序項(xiàng)目方面，滿足從檢測基因到蛋白的多組學(xué)測序要求。濟(jì)南BD空間轉(zhuǎn)錄組測序價格
烈冰科技作為國內(nèi)同時擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺的測序服務(wù)商及云計算服務(wù)供應(yīng)商，經(jīng)過多年實(shí)戰(zhàn)，擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗(yàn)，實(shí)測BDRhapsody對能夠高效捕獲粒細(xì)胞。針對不同的分選平臺、建庫方法，實(shí)戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程；烈冰科技NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學(xué)研究、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。完備的高通量測序?qū)嶒?yàn)平臺，包括NovaSeq6000、10XChromiumX、BDFACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等，配合一支來自海內(nèi)外名校、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊(duì)，為您的科學(xué)研究保駕護(hù)航。廣州上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)烈冰一站式多平臺測序服務(wù)：立足科學(xué)研究，解碼生命本質(zhì)。
烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺，針對龐大的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)，能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快、精、準(zhǔn)：一鍵導(dǎo)入genelist構(gòu)建個性化基因列表；輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Featureplot；任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型；一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖，還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板，幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析，節(jié)省您的工作時間并提升整體工作效率。
所謂的高通量測序技術(shù)，又名大規(guī)模平行測序，是將DNA（或者cDNA）隨機(jī)片段化、加接頭，制備測序文庫，通過對文庫中數(shù)以萬計的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng)，檢測對應(yīng)的信號并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法相比，高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時具有強(qiáng)大的優(yōu)勢，又快（兩天）又多（數(shù)百萬克隆），成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)。空間轉(zhuǎn)錄組測序是一個系統(tǒng)的工程，開展項(xiàng)目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配，如果匹配，實(shí)驗(yàn)過程如何規(guī)劃，實(shí)驗(yàn)平臺如何選擇，樣本如何制備，數(shù)據(jù)如何分析等等，而在這一切開始之前，我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了，從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持，我們開通全線對接渠道，幫助您快速定位項(xiàng)目訴求，提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計到文章發(fā)表的全流程，我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序因其強(qiáng)大的探究疾病--細(xì)胞--基因的關(guān)系，一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”。
空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)質(zhì)量和玻片有效區(qū)域的利用率、貼片的質(zhì)量和透化時間息息相關(guān)。貼片質(zhì)量不良會影響總的有效spot數(shù)等；而透化不合理會導(dǎo)致spot的reads數(shù)、基因中位數(shù)等參數(shù)。而在特異性基因表達(dá)方面，我們也可以統(tǒng)計空間轉(zhuǎn)錄組群體的特異性基因表達(dá)即Markergene，將他們在組織切片以及空轉(zhuǎn)上進(jìn)行著色。我們也可以對于任意一個已知的基因或者數(shù)據(jù)庫中的一些細(xì)胞Marker，然后將其在基因表達(dá)在空間轉(zhuǎn)錄組的切片以及HE染色上展示自己的基因表達(dá)進(jìn)而了解，群體中的可能的細(xì)胞組成關(guān)系。烈冰全線實(shí)驗(yàn)平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測序。廣州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組平臺
強(qiáng)勢發(fā)文！烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序助力揭示愈傷組織能再生的機(jī)制。濟(jì)南BD空間轉(zhuǎn)錄組測序價格
細(xì)胞中基因的表達(dá)是嚴(yán)格按照時間和空間順序發(fā)生，因此細(xì)胞類型和基因表達(dá)具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點(diǎn)的樣本進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序來分析。但是單細(xì)胞測序結(jié)果動輒上百G數(shù)據(jù)量，龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求，單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序（scRNA-Seq）在單細(xì)胞懸液制備的過程中破壞了細(xì)胞的空間結(jié)構(gòu)，無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題，其以點(diǎn)陣形式記錄組織切片細(xì)胞的空間信息。濟(jì)南BD空間轉(zhuǎn)錄組測序價格
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