未來,單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)的發(fā)展,一方面將集中在對現(xiàn)有技術(shù)的優(yōu)化和新方法的開發(fā).現(xiàn)有技術(shù)的優(yōu)化不僅包括建庫手段、測序技術(shù)和算法工具等方面,還包括優(yōu)化實驗設(shè)計、自動化實驗流程以及提升實驗效率.為了更好地檢測到各種大分子的特征,研究者可以考慮從生物、化學(xué)和物理等多學(xué)科中尋找解決方案.此外,新的計算方法和分析工具能幫助研究者越過一些實驗限制,發(fā)現(xiàn)更多新奇的生物過程.例如,擬時序分析(pseudotimetrajectory)將有助于人們理解早期胚胎發(fā)育的細(xì)胞分化軌跡.新方法則可以更多地關(guān)注目前未能檢測到的一些重要的基因表達(dá)調(diào)控層面,如DNA三維結(jié)構(gòu)、非編碼RNA和胞內(nèi)蛋白等.另一方面,目前的單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)發(fā)展勢頭強(qiáng)勁,研究者不斷研發(fā)并豐富著單細(xì)胞測序工具箱,各種組學(xué)方法百家爭鳴.未來,研究者需要從眾多相似的方法中篩選出一些穩(wěn)定、通用、成本低、可商業(yè)化的方法,并進(jìn)一步擴(kuò)大其實際應(yīng)用范圍。單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)方法的不斷 發(fā)展和改進(jìn), 為單細(xì)胞層級的多組學(xué)整合分析奠定了 基礎(chǔ)。西安single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持
單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢：1. 構(gòu)建蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫，大幅度提高蛋白質(zhì)鑒定數(shù)量；2. 不同層面表達(dá)水平分析，構(gòu)建表達(dá)“全景圖”；3. 多組學(xué)交叉驗證：深層次挖掘其中調(diào)控機(jī)制；4. 對基因突變信息在蛋白水平上進(jìn)行驗證；5.精細(xì)醫(yī)療：實現(xiàn)genomics到protegenomics的轉(zhuǎn)變。生物領(lǐng)域各個研究方面，1. 農(nóng)林領(lǐng)域：抗逆脅迫機(jī)制，生長發(fā)育機(jī)制，育種保護(hù)研究等；2. 畜牧業(yè)：肉類及乳品質(zhì)研究，致病機(jī)理研究等；3. 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷：生物標(biāo)志物，疾病機(jī)理機(jī)制，疾病分型等；4. 生物醫(yī)藥：藥物作用機(jī)理，藥效評價，藥物開發(fā)等；5. 微生物領(lǐng)域：致病機(jī)理，耐藥機(jī)制，病原體-宿主相互作用研究等；6. 海洋水產(chǎn)：漁業(yè)資源，海水養(yǎng)殖，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等；7. 生物能源、環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域：發(fā)酵過程優(yōu)化，生物燃料生產(chǎn)，環(huán)境危定風(fēng)險評估研究等；8.食品營養(yǎng)：食品儲藏及加工條件優(yōu)化，食品組分及品質(zhì)鑒定，功能性食品開發(fā)，食品安全監(jiān)檢測等。合肥單細(xì)胞多組學(xué)商業(yè)化服務(wù)目前已應(yīng)用的單細(xì)胞多組學(xué)聯(lián)合分析包括轉(zhuǎn)錄組和基因組，轉(zhuǎn)錄組和ＤＮＡ甲基化、轉(zhuǎn)錄組和蛋白組。
BDRhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)集成了熒光顯微成像系統(tǒng)，可以對不同熒光標(biāo)記的細(xì)胞進(jìn)行檢測并計數(shù)。在進(jìn)行質(zhì)量評估之前，首先要將細(xì)胞的培養(yǎng)體系更換成上機(jī)所需的Buffer。在這個過程中，需要進(jìn)行多次離心、重懸操作，烈冰Novelbio單細(xì)胞實驗團(tuán)隊推薦采用水平轉(zhuǎn)子離心機(jī)來進(jìn)行這步操作。這種離心機(jī)可以有效減少細(xì)胞在多次更換Buffer過程中的損失，尤其是對于細(xì)胞量較少的樣本來說，顯得非常有必要。更換完Buffer之后，還需要將細(xì)胞進(jìn)行過篩操作，去除較大的細(xì)胞團(tuán)，獲得較為純凈的單細(xì)胞懸液。
多樣本數(shù)據(jù)合并：FractionofReadsKept：合并樣本時，各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進(jìn)行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測序深度標(biāo)化到同一水平，從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！隨著單細(xì)胞多組學(xué)的不斷進(jìn)步, 研究者將有機(jī)會在單細(xì)胞分辨率下進(jìn)一步理解個體發(fā)育以及疾病發(fā)展機(jī)制。
分子檢測型單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)中也有一些集中于探究單細(xì)胞內(nèi)表觀遺傳組各層面的變化及關(guān)聯(lián)。功能研究型單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù),結(jié)合了強(qiáng)大的CRISPR基因編輯技術(shù),從而可以深度挖掘基因表達(dá)調(diào)控與細(xì)胞功能以及命運(yùn)決定之間的因果關(guān)系。在未來,為了更系統(tǒng)地研究多層組學(xué)之間的互動關(guān)系對細(xì)胞命運(yùn)的影響,一方面,單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)的策略會繼續(xù)向轉(zhuǎn)錄組結(jié)合其他多個組學(xué)的三組學(xué)甚至四組學(xué)方向發(fā)展.另一方面,單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)會轉(zhuǎn)向研發(fā)多組學(xué)測序分析和功能驗證同時進(jìn)行的方法,這種探究因果關(guān)系的策略對于揭示發(fā)育和疾病發(fā)展中的關(guān)鍵因子和分子網(wǎng)絡(luò)模塊十分重要。單細(xì)胞多組學(xué)可從整體層面快速有效地探尋疾病發(fā)生、發(fā)展的根本原因或藥物作用靶點等信息。重慶BD Rhapsody單細(xì)胞多組學(xué)多組學(xué)測序
單細(xì)胞組學(xué)通過一系列測序技術(shù)實現(xiàn)高分辨檢測單個細(xì)胞水平表達(dá)譜,以解析細(xì)胞異質(zhì)性及其功能表型。西安single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持
機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激，其細(xì)胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時，往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組，導(dǎo)致一些基因被“沉默”，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時序分析，即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時間的變化情況，構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育，但這里的時間并不是真時間，而是一個虛擬的時間，是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中，也會存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此，不論測定了多少樣本，我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。西安single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持
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