根據(jù)烈冰多年單細胞測序服務(wù)經(jīng)驗，為什么不建議您一味的追求高細胞數(shù)量的捕獲：單細胞測序所有的分析都是基于細胞聚類進行，而細胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后，獲得細胞基因表達譜，通過降維（pca），無監(jiān)督聚類以及可視化（t-SNE）得到的。進行細胞聚類時需要考慮到每個細胞的基因表達模式，因此即使是相同的數(shù)據(jù)，在剔除幾個細胞的情況下，前后獲得的聚類圖也會出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細胞捕獲數(shù)過多時，無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細胞數(shù)據(jù)，都會對正常細胞聚類產(chǎn)生影響，造成聚類結(jié)果失真。這也是很多文章，特別是很多高分文章，為什么單個樣本捕獲細胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個樣本捕獲細胞數(shù)在3000-5000個時，數(shù)據(jù)量在100G左右時，可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求。強勢發(fā)文！烈冰BD單細胞測序平臺助力揭示愈傷組織能再生的機制。南通BD VDJ單細胞服務(wù)機構(gòu)
烈冰生物為您的實驗定制工作流程： 對于不同用戶和實驗，單細胞實驗工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質(zhì)量和通量。BD儀器選項可以根據(jù)具體需求進行配置。烈冰生物搭建BD FACS流式分選平臺（如 BD FACSMelody），是上游樣本富集的良好選擇。此外，我們具備BD Rhapsody單細胞成像儀提供自動化細胞計數(shù)和細胞樣本活性測試，幫助用戶制備適用于Cartridge微孔板單細胞捕獲濃度的樣本。掃描儀提供了微孔板上磁珠捕獲細胞的計數(shù)。BD Rhapsody 樣品上樣工作站輕巧便攜，可在實驗室內(nèi)輕松移動。搭配烈冰傾情研發(fā)多年的成果NovelBrain生物信息大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)，完成測序數(shù)據(jù)的生物信息分析和結(jié)果可視化呈現(xiàn)。這些工具包括 UMI 分析算法和可視化工具，即使沒有經(jīng)驗的用戶也可分析和理解單細胞數(shù)據(jù)。西安BD單細胞實驗平臺烈冰科技成立10余年，為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù)。
作為單細胞測序的又一個重要里程碑，BD Rhapsody單細胞捕獲平臺整合了儀器、試劑盒和基礎(chǔ)信息學(xué)軟件，能精確對接illumina測序儀，因此可實現(xiàn)大量大細胞的快速高效標記、測序和分析，獲得單細胞水平的基因表達譜和差異情況，并通過對復(fù)雜細胞群體進行深入細致分析，繪制大規(guī)模單細胞表達圖譜。 以量化細胞內(nèi)的群體異質(zhì)性，并逐個鑒定細胞類型、細胞狀態(tài)和動態(tài)細胞躍遷。除了有望鑒定新的細胞亞型和稀有細胞群體，單細胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系。
多樣本數(shù)據(jù)合并：Fraction of Reads Kept：合并樣本時，各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平，從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究，加速科研進程！烈冰BD Rahpsody單細胞測序平臺，助力您的深入科學(xué)探究。
什么時候要用到去死細胞的操作呢？跟進烈冰生物多年單細胞測序服務(wù)經(jīng)驗來看，當(dāng)細胞懸液進行質(zhì)量和活性檢測后，考慮對細胞活性在50%-70%的懸液進行去除死細胞的操作。而太低活性的懸液（小于30%），懸液中細胞大量死亡，可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細胞比例和狀態(tài)，失真嚴重，建議重新收集樣本進行新的實驗，保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實驗結(jié)果的準確性。但需要注意到，去除死細胞的操作會損失一定的細胞數(shù)量，因此希望您在提供樣本時，盡可能提供足量的細胞，以備實驗過程中可能存在的細胞死亡的問題，BD Rhapsody單細胞捕獲平臺對樣本起始細胞量的要求較低，一般提供10萬個細胞以上均可滿足需求，特殊樣本可詳細咨詢烈冰生物。個性化制定測序項目方面，滿足從檢測基因到蛋白的多組學(xué)測序要求。云南BD單細胞平臺
烈冰生物全國五大實驗中心，多地部署B(yǎng)D Rahpsody平臺，助您的樣本更快速抵達“戰(zhàn)場”。南通BD VDJ單細胞服務(wù)機構(gòu)
科研的魅力之處，在于無窮盡的探尋生命的本底，通過單細胞測序，我們對組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級到深層，并在單細胞層面逐漸達成一致，那么不禁要問一句，組織的空間位置到底重不重要？空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征，細胞的位置信息更能反應(yīng)細胞命運調(diào)控機制和細胞譜系發(fā)生過程。因此時間和空間即像組織的AB面，而不可否認的是，此時空間坐標的記錄，像一個還未長大的娃娃，雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層，但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個高峰。南通BD VDJ單細胞服務(wù)機構(gòu)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司總部位于江月路999號奇亞特中心22幢，是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢，市場營銷策劃，市場信息咨詢與調(diào)查（不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗），從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù)，計算機、軟件及耗材（除專控），軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目，經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的公司。烈冰生物擁有一支經(jīng)驗豐富、技術(shù)創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團隊，以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學(xué)測序。烈冰生物不斷開拓創(chuàng)新，追求出色，以技術(shù)為先導(dǎo)，以產(chǎn)品為平臺，以應(yīng)用為重點，以服務(wù)為保證，不斷為客戶創(chuàng)造更高價值，提供更優(yōu)服務(wù)。烈冰生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康行業(yè)。滿足市場需求，提高產(chǎn)品價值，是我們前行的力量。