基于10X Geomics 動態(tài)微流控技術(shù)，利用Tn5轉(zhuǎn)座酶酶切開放染色質(zhì)，形成短片段，單細胞ATAC測序在表觀基因組學水平上，揭示單細胞染色質(zhì)的可及性問題，區(qū)分細胞異質(zhì)性，獲得開放染色質(zhì)的位置、轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點、核小體的調(diào)控區(qū)域和染色質(zhì)狀態(tài)等信息，是單細胞表觀遺傳學的重要突破：分析每個細胞數(shù)千個獨特的染色質(zhì)開放區(qū)域，識別細胞類型和細胞狀態(tài)；識別重要的轉(zhuǎn)錄因子，進行譜系和發(fā)育追蹤；探究驅(qū)動細胞類型和狀態(tài)之間基因表達差異的非編碼序列；探究細胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡特征等。是當前重要的多組學研究基因表達和表觀遺傳學的手段。測序可準確地分析基因表達差異、基因結(jié)構(gòu)變異、篩選分子標記（SNPs或SSR）等生命科學重要問題。吉林二代測序單細胞測序服務
基因和基因產(chǎn)物并不是單獨運作的，而是參與了相互關聯(lián)的復雜通路、網(wǎng)絡和分子系統(tǒng)，這些合在一起實現(xiàn)了細胞、組織和生物體的運作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用，對于了解生物系統(tǒng)如何運作至關重要。”為了推動科學發(fā)現(xiàn)，科學家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復雜性的研究工具。對于越來越多的研究人員來說，單細胞RNA測序和單細胞多組學——即在單細胞分辨率下對基因表達及其他基于DNA、RNA或蛋白質(zhì)的分析物進行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學問題上已證實是行之有效的。合肥單細胞測序百萬通量平臺單細胞測序技術(shù)提供了單個細胞水平下的科學研究視角。
基于10X Next GEM技術(shù)，單細胞測序一次實驗可以同時檢測近萬個細胞，可在一個樣本中同時獲3'端mRNA表達譜、如需和免疫組庫（TCR和BCR）的數(shù)據(jù)進行聯(lián)合時，即某些研究還需結(jié)合基因的表達譜和V(D)J數(shù)據(jù)進行復雜組織樣本的是影響免疫應答分析，監(jiān)測免疫療法的效果，研究疾病發(fā)生、發(fā)展的分子機制，可進行單細胞免疫組庫測序： 烈冰單細胞免疫組庫平臺具備：1000+項目經(jīng)驗，一次實驗可同時獲取1000-20000個細胞的文庫構(gòu)建，獲得轉(zhuǎn)錄組和免疫組數(shù)據(jù)； 具備完善的免疫組庫測序和實驗質(zhì)控流程，獲取V(D)J全長序列的配對信息；豐富的免疫組庫測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗，實現(xiàn)專屬個性化數(shù)據(jù)分析服務，搭配單細胞分析云平臺，一鍵導出交互性的動態(tài)結(jié)果報告。
科技的發(fā)展讓單細胞測序已經(jīng)應用于疾病發(fā)展過程中的關鍵過程和事件，如前病變向惡性的轉(zhuǎn)化、惡性向轉(zhuǎn)移性的發(fā)展，以及對多種用藥的反應。單細胞測序技術(shù)作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液，或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核，進而對于每一個單細胞或者細胞核進行測序得到結(jié)果的技術(shù)，其空間定位信息是丟失的。這就衍生出了一個問題就是如果單細胞A與B并不出現(xiàn)在一個組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉(zhuǎn)化么？免疫研究中，兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關系的細胞在組織切片上風馬牛不相及，這樣PDL1-PD1的關系會生效么？深度的單細胞測序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時代。
單細胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺，可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便：單細胞瀏覽器的操作簡單，不需要命令行操作。簡單拖拽、設置參數(shù)即可運行，即使生信0基礎用戶也可以運用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息；以及不同Cluster對應的細胞數(shù)量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等；3D立體展示，文章動圖先人一步：單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進行三維立體展示，更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。豐富的測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗，烈冰配套全程個性化、定制化地數(shù)據(jù)分析服務。陜西10X Chromium X單細胞測序商業(yè)化服務
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機體為響應各種應激，其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當細胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時，往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組，導致一些基因被沉默，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài)。擬時序分析，即根據(jù)不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況，構(gòu)建細胞譜系發(fā)育，但這里的時間并不是真時間，而是一個虛擬的時間，是指的細胞與細胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中，也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此，不論測定了多少樣本，我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉(zhuǎn)化和變化進行描述。吉林二代測序單細胞測序服務
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