10× Genomics官方建議，當單細胞懸液活性低于70%時應做去除死細胞操作，并推薦使用MACS? Dead Cell Removal Kit(Miltenyi Biotec)。需要注意到，去除死細胞的操作會損失一定的細胞數(shù)量，10× Genomics和Miltenyi Biotec都沒有給出單細胞懸液含有多少細胞數(shù)量才建議做去除死細胞的操作?；诹冶嗄陠渭毎麥y序實驗經(jīng)驗，建議當細胞懸液進行質量和活性檢測后，考慮對細胞活性在50%-70%的懸液進行去除死細胞的操作。而太低活性的懸液（小于30%），懸液中細胞大量死亡，可能已經(jīng)丟失了原組織內的細胞比例和狀態(tài)，失真嚴重，建議重新收集樣本進行新的實驗，保證數(shù)據(jù)的高質量和實驗結果的準確性。烈冰測序數(shù)據(jù)分析平臺，不依賴已有物種信息，可研究非模式物種，針對不同平臺的數(shù)據(jù)，制定多套流程；二代測序單細胞測序價格
多樣本數(shù)據(jù)合并：Fraction of Reads Kept：合并樣本時，各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平，從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數(shù)量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結果，深入挖掘其背后的生物學意義；從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究，加速科研進程！北京高通量測序單細胞測序百萬通量平臺高通量測序技術是對傳統(tǒng)測序一次突破性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。
單細胞多組學帶來的突破 單細胞測序方法不但改進了實驗過程，還幫助科學家在健康和疾病研究的關鍵領域取得新進展。那些過去從轉錄平均值或單項參數(shù)讀取中無法獲得的新發(fā)現(xiàn)正在改變我們對傳染病、神經(jīng)退行性疾病等疾病的認識。從鑒定新的細胞類型和狀態(tài)，到揭開疾病用藥應答和耐藥的潛在機制，單細胞測序正在推動突破性的研究，有望改變生物學和醫(yī)療。無論是無法解釋的疾病，還是人體或自然界中尚未探索的系統(tǒng)，曾經(jīng)模糊的東西正變得越來越清晰。隨著我們邁向科學的未來，我們手頭的工具就像伽利略的望遠鏡一樣能夠提高焦距和放大倍數(shù)，而定義科學未來的知識新深度是十年前的人們所無法想象的。
關于10X Genomics單細胞平臺的樣本類型和樣本制備 ：10X平臺在上機前需要注意細胞消化后的細胞團塊，獲得分離良好的細胞懸液、無細胞隨便、極少的細胞團塊，且細胞活力高（＞70%）；此外，了解您所研究細胞的大小范圍也很重要。細胞大小通常與細胞表達的轉錄本數(shù)量有關。各種尺寸不同的細胞（一般直徑不大于50μm）均可與我們基因表達解決方案中使用的10X Genomics平臺兼容。一般來說，細胞制備方案將根據(jù)組織來源和細胞類型而變化。每種組織類型都是獨特的，因此，必須在開始任何單細胞實驗之前優(yōu)化樣本制備，烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗，累積10+物種、50+組織的消化protocol，若您的樣本為組織，且尚未成功將組織樣本消化成單細胞懸液，烈冰將盡可能提供技術及實驗上的幫助。單細胞測序是高通量測序下的又一重大技術突破。
基于10X Geomics 動態(tài)微流控技術，利用Tn5轉座酶酶切開放染色質，形成短片段，單細胞ATAC測序在表觀基因組學水平上，揭示單細胞染色質的可及性問題，區(qū)分細胞異質性，獲得開放染色質的位置、轉錄因子的結合位點、核小體的調控區(qū)域和染色質狀態(tài)等信息，是單細胞表觀遺傳學的重要突破：分析每個細胞數(shù)千個獨特的染色質開放區(qū)域，識別細胞類型和細胞狀態(tài)；識別重要的轉錄因子，進行譜系和發(fā)育追蹤；探究驅動細胞類型和狀態(tài)之間基因表達差異的非編碼序列；探究細胞類型特異性和基因調控網(wǎng)絡特征等。是當前重要的多組學研究基因表達和表觀遺傳學的手段。深度的單細胞測序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時代。天津10X Genomics單細胞測序服務公司
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