空間代謝組學(AFADESI-MSI):中文標題:使用敞開式質(zhì)譜成像技術及代謝組學繪制大鼠腦代謝網(wǎng)絡圖研究對象:大鼠腦發(fā)表期刊:AnalyticalChemistry影響因子:6.986發(fā)表時間:2021年4月23日研究單位:中國醫(yī)學科學院藥物研究所天然藥物活性物質(zhì)與功能國家重點實驗室運用生物技術:空間代謝組學(AFADESI-MSI)。大腦是結構**復雜的***之一,主要功能與其微區(qū)的分子相互作用密切相關。大腦的小分子調(diào)節(jié)機制對理解***功能、精神疾病機理和藥物研發(fā)有很大的幫助。動物的認知過程和行為控制均依賴于腦部強大的***網(wǎng)絡——神經(jīng)連接體??茖W家進行了很多研究,但是對腦部小分子網(wǎng)絡的研究仍有不足。空間代謝組學哪家好,為各類科學領域提供線索和方向。江蘇植物空間代謝組學
空間代謝組學能夠在復雜的EA微環(huán)境中區(qū)分組織類型,本文作者使用兩個隊列對食管腺*的甘油磷脂特征進行了表征。**初運用空間代謝組學對連續(xù)患者的成對手術切除活檢(EA和MHEE)進行甘油磷脂差異分析;(樣本策略)選擇這種取樣方法的目的是為了進行手術切緣分析,并通過取樣更大的樣本來克服**的區(qū)域代謝組學差異。接下來,采用內(nèi)窺鏡活檢對第二組人群進行采樣。這樣就可以從健康的志愿者和Barrett化***育不良的患者身上獲得標本。這樣還使作者能夠驗證***個隊列的發(fā)現(xiàn),調(diào)查該技術在小樣本上的表現(xiàn),并演示在內(nèi)鏡套件中促進診斷的第二次臨床應用。陜西空間代謝組學技術歐易生物空間代謝組學。
本篇為2021年8月,國家**中心中國醫(yī)學院科學院**醫(yī)院崔巍研究員與專業(yè)多組學技術團隊合作在醫(yī)學一區(qū)消化道領域國際期刊《GUT》期刊發(fā)表了題的研究成果,通過非靶向代謝組、靶向代謝組以及AFADESI-MSI空間代謝組學(研究方法,整合了宏基因組的數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)了可用于腺瘤及結直腸*診斷的代謝標志物,建立的相關預測模型顯示出較高診斷準確性,為結直腸*早期診斷奠定堅實基礎。在本研究中,作者對血清代謝組學和糞便宏基因組測序的結果進行整合分析,確定了一組與腸道微生物群密切相關的CRC和腺瘤患者的血清代謝物,并基于代謝物研發(fā)了腸道微生物組相關血清代謝物 (GMSM) 策略,可準確區(qū)分CRC和腺瘤患者(統(tǒng)稱為結直腸異常)與正常健康個體。
如空間代謝組。研究中開發(fā)了一種新的基于拉曼光譜和空間代謝組學分析的脂質(zhì)組學(HSL)成像策略,用于分子表征和定量再髓鞘形成,并通過特定髓鞘蛋白的免疫標記進行了驗證。利用拉曼和空間代謝組學數(shù)據(jù)生成了分子成像圖譜,用于體外組織的生物分子結構和組成的關聯(lián)。將相關脂質(zhì)組成像方法應用于局灶性脫髓鞘小鼠模型和多發(fā)性硬化癥死后腦標本的髓鞘再分化研究。發(fā)現(xiàn)不僅在脫髓鞘腦組織和正常腦組織之間,在有髓鞘組織和正常有髓組織之間,脂質(zhì)成分皆存在差異??臻g代謝組產(chǎn)品齊全,價格低,高效專業(yè)。
進行了相關的空間代謝組學研究來自同一患者的正常白質(zhì)組織,旨在獲得與患者再髓鞘病變相關的特定脂質(zhì)譜(圖6D?1)。通過串聯(lián)質(zhì)譜法確認鑒定的脂質(zhì),并在表2中報告。正如在小鼠組織分析中所觀察到的,再髓鞘化區(qū)域主要在PC和PE脂質(zhì)群的組成上不同。結果表明,HSL成像可以有效地用于多發(fā)性硬化患者死后病變的脂質(zhì)譜分析,并表明多發(fā)性硬化患者再髓鞘化過程中產(chǎn)生的髓鞘與附近正常出現(xiàn)的白質(zhì)相比具有改變的脂質(zhì)譜。(a)正常白質(zhì)(NAWM)和有髓鞘病變的平均拉曼光譜±1標準差(SD)。(b)平均差譜±1SD(NAWM?再髓鞘損傷)在結構水平顯示再髓鞘過程。(c)基于有髓損傷的拉曼光譜的P***A后驗概率圖像突出NAWM(綠色)和有髓組織(紅色)??臻g代謝組學 技術咨詢中心。河南空間代謝組學的質(zhì)譜成像
蛋白質(zhì)組學的研究方法。江蘇植物空間代謝組學
空間代謝組學研究作者對P493-6B細胞淋巴瘤系(BCL)進行了全基因組表達譜、核突變和ChIP分析,發(fā)現(xiàn)MYC誘導增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關蛋白在內(nèi)的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達,在MYC誘導的肝細胞*(HCC)、急性白血?。═-ALL)和腎細胞*(RCC)的三種體內(nèi)轉基因小鼠模型中也有類似表達。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動子結合并啟動mRNA轉錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對這兩種蛋白進行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動子中的相同DNA分子結合(圖1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達,但不降低MYC基因的表達。其次,ChIP的MYC與啟動子結合,不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達,還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達。因此,MYC似乎會依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因:首先誘導葡萄糖和谷氨酰胺,然后誘導FA合成相關基因。通過RNA測序(RNA-seq)發(fā)現(xiàn),增加MYC水平會引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。江蘇植物空間代謝組學
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