常用的通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測藥物醫(yī)療疾病的作用機(jī)制,其技術(shù)路線一般是先通過中藥成分?jǐn)?shù)據(jù)庫得到活性化合物,再通過化合物靶標(biāo)關(guān)系數(shù)據(jù)庫得到靶標(biāo)信息,通過基因信息數(shù)據(jù)庫將靶標(biāo)進(jìn)行基因注釋,將藥物靶標(biāo)蛋白與疾病數(shù)據(jù)庫中的靶標(biāo)蛋白求交集得到潛在作用靶標(biāo),再對潛在作用靶標(biāo)進(jìn)行功能分析,將潛在作用靶標(biāo)與藥物分子、疾病、通路等的關(guān)系整合,構(gòu)建一個復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)。在此網(wǎng)絡(luò)中,用連接有效的算法對該網(wǎng)絡(luò)中的蛋白與藥物分子、通路的連接鄰近度打分,進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋮?shù)分析。然后再通過這些參數(shù)篩選出重要節(jié)點(diǎn),從而進(jìn)行藥物作用機(jī)制的挖掘。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是在網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)與多向藥理學(xué)的基礎(chǔ)上提出的藥物設(shè)計(jì)的新思路。上海醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)費(fèi)用
2007年英國Dundee大學(xué)藥理學(xué)家AndrewL.Hopkins率先提出了網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)”概念。該概念是基于系統(tǒng)生物學(xué)、基因組學(xué)、蛋白組學(xué)、多向藥理學(xué)等學(xué)科的理論,運(yùn)用組學(xué)、高通量篩選、網(wǎng)絡(luò)可視化及網(wǎng)絡(luò)分析等技術(shù)揭示藥物、基因、靶點(diǎn)、疾病之間復(fù)雜的生物網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,在此基礎(chǔ)上分析、預(yù)測藥物的藥理學(xué)機(jī)制并通過相應(yīng)的實(shí)驗(yàn)來驗(yàn)證、評估藥物的藥效、不良反應(yīng)及作用機(jī)制,發(fā)現(xiàn)高效低毒的藥物。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于系統(tǒng)生物學(xué)的理論,對生物系統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)分析,選取特定信號節(jié)點(diǎn)進(jìn)行多靶點(diǎn)藥物分子設(shè)計(jì)的新學(xué)科。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)強(qiáng)調(diào)對信號通路的多途徑調(diào)節(jié),提高藥物的醫(yī)療效果,降低毒副作用,從而提高新藥臨床試驗(yàn)的成功率,節(jié)省藥物的研發(fā)費(fèi)用。上海醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)費(fèi)用評價數(shù)據(jù)信息的提取與轉(zhuǎn)換、軟件/算法的開發(fā)、網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建與分析以及實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證等流程是否規(guī)范。
近年來,將藥理學(xué)實(shí)驗(yàn)與生物信息學(xué)技術(shù)、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法相融合,成為中藥藥理學(xué)研究的重要方式之一,打破了傳統(tǒng)的中藥復(fù)方機(jī)制研究的瓶頸,使得原先難以定性的機(jī)制得以預(yù)測和驗(yàn)證,在發(fā)表SCI論文方面已獲得較高認(rèn)可。與此同時,中方子體和復(fù)方的研究成為近年來研究的熱點(diǎn)和國家自然基金重點(diǎn)支持的領(lǐng)域。作為臨床醫(yī)生、科研人員和碩博士研究生,尤其是沒有生物信息學(xué)分析基礎(chǔ)和網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)基礎(chǔ)的初學(xué)者,面對自己實(shí)驗(yàn)獲得的大量錯綜復(fù)雜的基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)時,難免會無從下手分析。
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是于2007年由英國鄧迪大學(xué)藥理學(xué)家Hopkins初次提出,是基于系統(tǒng)生物學(xué)的理論,融合多向藥理學(xué)、生物信息學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)等多學(xué)科的技術(shù)和內(nèi)容,進(jìn)行“疾病表型-基因-靶點(diǎn)-藥物”等多層次網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建,探索藥物與疾病間相關(guān)性,指導(dǎo)新藥研發(fā),闡明藥物作用機(jī)制,其整體性、系統(tǒng)性及藥物成分間相互作用,“多成分-多靶點(diǎn)-多途徑”構(gòu)建網(wǎng)絡(luò),經(jīng)過拓?fù)鋮?shù)分析,以及蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖、柱狀圖、氣泡圖等可視化,將藥物作用于靶點(diǎn),作用機(jī)制以及各生理病理過程等闡明清楚,與中醫(yī)藥特點(diǎn)不謀而合。將其應(yīng)用于中醫(yī)藥研究中的創(chuàng)新點(diǎn)是基于經(jīng)典的復(fù)方中藥、中藥材,用于新藥研發(fā),以藥測病,以傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)為疾病靶標(biāo),挖掘疾病作用機(jī)制。其中心技術(shù)則是對復(fù)雜疾病機(jī)制的揭示和預(yù)防藥物的發(fā)現(xiàn),即已知某中藥或中藥復(fù)方醫(yī)療的疾病預(yù)測其作用機(jī)制和已知藥物不知其醫(yī)療作用篩選作用機(jī)制,從而篩選預(yù)防某類疾病的藥物或發(fā)現(xiàn)藥物新的醫(yī)療作用。實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證:采用適當(dāng)技術(shù),對預(yù)測的中藥物質(zhì)基礎(chǔ)和作用機(jī)制進(jìn)行實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)(其實(shí)不是中藥也適用)的分析思路一般有兩類:其一,基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的某中方子劑醫(yī)療某疾病/改善某表型的分子機(jī)制研究。這類研究,側(cè)重于整體研究,不需要做實(shí)驗(yàn),基于公共數(shù)據(jù)庫、文本挖掘、軟件分析、高通量測序的分析,可以單獨(dú)成一篇1-3分的SCI文章。其二,某中方子劑通過某某基因調(diào)節(jié)某某通路醫(yī)療某某疾病/表型的研究。這類研究,側(cè)重于細(xì)節(jié)研究,把網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)當(dāng)做篩選靶基因、通路的手段,再用常規(guī)的分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)的技術(shù)加以驗(yàn)證。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)為藥物的發(fā)現(xiàn)、研究和綜合評估提供了一種新方法。上海醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)費(fèi)用
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)中,有些藥物的結(jié)構(gòu)和功能具有類似性,可以構(gòu)建出藥物-藥物,藥物-靶標(biāo)等網(wǎng)絡(luò)。上海醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)費(fèi)用
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)還受到許多毒理學(xué)研究者的高度重視?;诰W(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、系統(tǒng)生物學(xué)等的研究提出了網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)研究的理念,即根據(jù)構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)模型來研究藥物的毒理學(xué)性質(zhì)。通過對網(wǎng)絡(luò)模型的關(guān)聯(lián)分析及揭示藥物的不良反應(yīng)及機(jī)制。從相關(guān)數(shù)據(jù)庫中提取出基因、蛋白、不良反應(yīng)等要素,將這些要素作為節(jié)點(diǎn),運(yùn)用計(jì)算機(jī)技術(shù)構(gòu)建不良反應(yīng)-藥物-基因、靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)模型,推測和判斷藥物的不良反應(yīng)及產(chǎn)生不良反應(yīng)的物質(zhì)。該研究思路不只為毒理學(xué)研究帶來了全新視角,也為藥物的安全性評價提供了新的依據(jù)。范驍輝等討論了建立網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)及中藥網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)研究思路,談到復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及分析技術(shù)的快速發(fā)展為網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)的誕生奠定了基礎(chǔ)。建立中藥網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué),有望為開展有毒中藥的毒性成分篩查、致毒機(jī)制和配伍禁忌等研究提供了新的手段,不只為提高中藥的安全性和合理用藥提供技術(shù)支持,也必將推進(jìn)中藥現(xiàn)代化的進(jìn)程。上海醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)費(fèi)用
杭州鉑賽生物科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家服務(wù)型的公司。公司業(yè)務(wù)分為實(shí)驗(yàn)外包服務(wù),課題設(shè)計(jì),網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析服務(wù)等,目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn),為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù)。公司將不斷增強(qiáng)企業(yè)重點(diǎn)競爭力,努力學(xué)習(xí)行業(yè)知識,遵守行業(yè)規(guī)范,植根于醫(yī)藥健康行業(yè)的發(fā)展。鉑賽生物憑借創(chuàng)新的產(chǎn)品、專業(yè)的服務(wù)、眾多的成功案例積累起來的聲譽(yù)和口碑,讓企業(yè)發(fā)展再上新高。