重慶臨床網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析服務(wù)

來源: 發(fā)布時間:2021-11-20

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是運用多種數(shù)據(jù)庫及軟件綜合分析、篩選、構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)圖,其中主要的數(shù)據(jù)庫、軟件及相關(guān)作用如下:中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫和分析平臺(TCMSP)主要用于藥物化合物成分及相關(guān)靶標(biāo)的篩選;通用蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(Uniprot)用于靶標(biāo)蛋白基因的搜索篩選;有機(jī)小分子生物活性數(shù)據(jù)庫(Pubchem/OMIM)用于藥物化合物2D、3D結(jié)構(gòu)搜索;人類基因數(shù)據(jù)庫(GeneCards)用于疾病基因搜索篩選;在線韋恩圖反映藥物篩選靶標(biāo)基因與疾病基因的交集基因;蛋白互作平臺數(shù)據(jù)庫(STRING)用于構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)(PPI);生物學(xué)信息注釋數(shù)據(jù)庫(DAVIDv6.8)用于GO分類富集和KEGG通路富集分析;在線云平臺(Omicshare)主要用于GO分類富集分析和KEGG通路分析結(jié)果繪制氣泡圖;GraphPadPrism6制圖軟件主要用于GO分類富集分析和KEGG通路分析結(jié)果繪制柱狀圖;網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵傩苑治鲕浖﨏ytoscapeVersion3.6.1主要用于構(gòu)建“成分-靶標(biāo)-通路”網(wǎng)絡(luò)。成分與疾病共同靶標(biāo)的確認(rèn):采用韋恩圖進(jìn)行確認(rèn)。重慶臨床網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析服務(wù)

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是人工智能和大數(shù)據(jù)時代藥物系統(tǒng)性研究的新興、交叉、前沿學(xué)科,強調(diào)從系統(tǒng)層次和生物網(wǎng)絡(luò)的整體角度出發(fā),解析藥物及醫(yī)療對象之間的分子關(guān)聯(lián)規(guī)律,被普遍應(yīng)用于藥物和中藥活性化合物發(fā)現(xiàn)、整體作用機(jī)制闡釋、藥物組合和方劑配伍規(guī)律解析等方面,為中藥復(fù)雜體系研究提供了新思路,為臨床合理用藥、新藥研發(fā)等提供了新的科技支撐。在大數(shù)據(jù)背景下,隨著網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的影響力和應(yīng)用日益普遍,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)在理論分析、算法發(fā)展和實際應(yīng)用等方面,面臨著重要的發(fā)展機(jī)遇和挑戰(zhàn)。整合臨床、實驗的海量數(shù)據(jù),結(jié)合科學(xué)驗證,揭示藥物對疾病的調(diào)控機(jī)制,是網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究的主要任務(wù)。然而,目前網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究存在質(zhì)量良莠不齊、數(shù)據(jù)缺乏規(guī)范、科學(xué)檢驗不足等問題,亟須建立嚴(yán)謹(jǐn)規(guī)范、科學(xué)統(tǒng)一的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究評價標(biāo)準(zhǔn),以保障該新興學(xué)科的健康發(fā)展。黑龍江護(hù)理網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)數(shù)據(jù)的獲取和驗證:網(wǎng)絡(luò)分析技術(shù)。

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究思路:網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是通過各數(shù)據(jù)庫及軟件進(jìn)行高通量分支和整體篩選,先進(jìn)行藥物靜態(tài)化合物小分子篩選,篩選對應(yīng)相關(guān)靶標(biāo)蛋白大分子,然后進(jìn)行蛋白基因篩選,再分支從疾病靶標(biāo)蛋白基因篩選,再進(jìn)行整合篩選交集基因,將藥物與疾病之間進(jìn)行基因?qū)用娴穆?lián)系,結(jié)尾進(jìn)行蛋白質(zhì)相互作用及信號通路,即作用機(jī)制研究,從“藥物-疾病”兩個分支開始,以二者相互作用終止。概括為“以網(wǎng)絡(luò)為中心,展開網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建、網(wǎng)絡(luò)可視化、網(wǎng)絡(luò)分析技術(shù)”整體分析中醫(yī)藥。

中醫(yī)藥學(xué)主要包括了2個方面:中醫(yī)學(xué)和中藥學(xué),而中醫(yī)學(xué)是以中醫(yī)藥理論為基礎(chǔ),結(jié)合實踐經(jīng)驗進(jìn)行研究的一門學(xué)科,研究人類生命活動健康與疾病的轉(zhuǎn)化規(guī)律及其預(yù)防、診斷、醫(yī)療、康復(fù)和保健的綜合性學(xué)科,注重整體觀念和辨證論治;而中藥學(xué)是研究中藥基礎(chǔ)理論和各味中藥的來源、采制、性能、功效和臨床應(yīng)用等相關(guān)知識的學(xué)科,基礎(chǔ)理論主要包括中藥的性能、功效和配伍規(guī)律等。但二者并未分開,共同在中醫(yī)藥理論的基礎(chǔ)上組成了中醫(yī)藥學(xué),中醫(yī)藥離不開中藥的物質(zhì)基礎(chǔ),而中藥離不開中醫(yī)學(xué)的理論指導(dǎo)。目前無論是單味中藥材、還是中藥復(fù)方及其配伍,其成分復(fù)雜多樣,各成分之間相互協(xié)同或拮抗、作用于相同或不同靶點、不同藥效途徑發(fā)揮臨床療效,其藥效作用機(jī)制同樣復(fù)雜。目前網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)在中醫(yī)藥領(lǐng)域研究應(yīng)用普遍。成分收集及處理:通過檢索數(shù)據(jù)庫、文獻(xiàn),收集中藥所含化學(xué)成分。

通過構(gòu)建藥物-靶點-疾病之間的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析藥物的作用機(jī)制,使藥理研究由傳統(tǒng)尋找單一靶點轉(zhuǎn)向綜合網(wǎng)絡(luò)分析。同時,通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析可發(fā)現(xiàn),在不同發(fā)展階段的同一疾病,由不同的功能基因或功能蛋白調(diào)控;而部分功能蛋白可在多個疾病中起中樞(Hub)調(diào)控作用,與中醫(yī)藥理論的“同病異治”和“異病同治”相似。而中藥復(fù)方所含化學(xué)成分較復(fù)雜和藥理作用具有多靶點多層次的特點,與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)具有天然的兼容性。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)能夠從整體性分析和闡述中藥復(fù)方的作用機(jī)理,有利于推動中藥復(fù)方的深入研究和擴(kuò)大臨床適應(yīng)癥的發(fā)展。生物網(wǎng)絡(luò)是采用數(shù)學(xué)領(lǐng)域圖論的研究手段,借助復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的研究方法。黑龍江護(hù)理網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)數(shù)據(jù)的獲取和驗證:高通量高內(nèi)涵技術(shù)。重慶臨床網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析服務(wù)

一些單一成分的化學(xué)藥物可能作用于蛋白受體、離子通道、跨膜信號傳導(dǎo)分子和酶等多個不同類型的靶點。靶點與靶點之間的聯(lián)系十分復(fù)雜,許多疾病的發(fā)病機(jī)理也非常復(fù)雜,導(dǎo)致藥物的作用機(jī)制變得更為復(fù)雜。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)能從分子、基因水平上去分析單一成分藥物作用于不同靶點、細(xì)胞和部位的行為,能系統(tǒng)地預(yù)測和揭示藥物的作用及機(jī)理,從而評價藥物作用的有效性和安全性。黃明峰等用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法探討活血化瘀中藥醫(yī)療的作用機(jī)理,為研究中藥多成分、多靶點、多途徑作用模式開辟了新的途徑,為醫(yī)療作用機(jī)理的闡釋提供有力的理論基礎(chǔ)和新思路,為闡釋中藥的配伍作用、協(xié)同機(jī)理等提供技術(shù)支持。重慶臨床網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析服務(wù)

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