網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究離不開生物網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建。生物網(wǎng)絡(luò)是采用數(shù)學(xué)領(lǐng)域圖論的研究手段，借助復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的研究方法，將生物體中各種物質(zhì)及其相互作用加以抽象，如將構(gòu)成系統(tǒng)內(nèi)的各個組分抽象成節(jié)點，他們之間的聯(lián)系或相互作用關(guān)系描繪成邊，由節(jié)點和邊構(gòu)成的圖就是網(wǎng)絡(luò)，結(jié)尾組成一個包含多個體、多層次相互作用的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)。包括生物分子為基礎(chǔ)的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)、信號通路網(wǎng)絡(luò)、代謝網(wǎng)絡(luò)、基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、miRNA網(wǎng)絡(luò)、生物過程網(wǎng)絡(luò)、組織網(wǎng)絡(luò)等。中藥藥效物質(zhì)基礎(chǔ)是指中藥發(fā)揮藥效的活性成分體系。四川初級網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究思路：網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是通過各數(shù)據(jù)庫及軟件進(jìn)行高通量分支和整體篩選，先進(jìn)行藥物靜態(tài)化合物小分子篩選，篩選對應(yīng)相關(guān)靶標(biāo)蛋白大分子，然后進(jìn)行蛋白基因篩選，再分支從疾病靶標(biāo)蛋白基因篩選，再進(jìn)行整合篩選交集基因，將藥物與疾病之間進(jìn)行基因?qū)用娴穆?lián)系，結(jié)尾進(jìn)行蛋白質(zhì)相互作用及信號通路，即作用機(jī)制研究，從“藥物-疾病”兩個分支開始，以二者相互作用終止。概括為“以網(wǎng)絡(luò)為中心，展開網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建、網(wǎng)絡(luò)可視化、網(wǎng)絡(luò)分析技術(shù)”整體分析中醫(yī)藥。四川初級網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)從相互聯(lián)系的角度研究問題，恰恰與中藥的中心思想不謀而合。
中藥具有多成分、多靶點、調(diào)節(jié)方式多樣的特點，蘊含了極大的信息量。采用西醫(yī)單靶標(biāo)、單成分的研究思路來研究中藥，比較難體現(xiàn)中藥的系統(tǒng)性，不能科學(xué)解釋中藥復(fù)方的藥效物質(zhì)基礎(chǔ)及組方規(guī)律等問題。隨著網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)技術(shù)的提出，單靶標(biāo)、單成分研究思路開始向整體探究、系統(tǒng)調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)變。2007年，Yildirim等首先應(yīng)用了網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)的概念，通過對藥物與基因、蛋白相互作用數(shù)據(jù)進(jìn)行集成分析，發(fā)現(xiàn)多數(shù)藥物是通過間接調(diào)節(jié)發(fā)揮作用，而非直接作用于疾病相關(guān)蛋白。在此基礎(chǔ)上，Hopkins于同年提出了網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)（networkpharmacology）研究方法，認(rèn)為藥物是作用于多個靶點，并通過多靶點間的相互作用產(chǎn)生增效減毒的效果。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)從相互聯(lián)系的角度研究問題，恰恰與中藥的中心思想不謀而合。
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究主要由網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建、網(wǎng)絡(luò)分析和實驗驗證三方面構(gòu)成，即先利用公共數(shù)據(jù)庫和文獻(xiàn)，結(jié)合高通量組學(xué)技術(shù)和生物信息學(xué)技術(shù)，篩選出已知藥物成分的靶點信息和特定疾病的靶點信息;然后采用網(wǎng)絡(luò)可視化工具構(gòu)建“基因-藥物-靶點-疾病”多維生物網(wǎng)絡(luò)模型，通過對網(wǎng)絡(luò)中特定信號節(jié)點在細(xì)胞、分子以及生物整體水平上的多層次分析，找出關(guān)鍵節(jié)點，并從整體生物網(wǎng)絡(luò)平衡角度發(fā)現(xiàn)目標(biāo)藥物對“致病網(wǎng)絡(luò)”的干擾作用機(jī)制，進(jìn)而預(yù)測已知藥物防治疾病的藥效活性成分、作用靶點及可能參與調(diào)控的細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、潛在藥理學(xué)機(jī)制和方劑配伍規(guī)律;結(jié)尾進(jìn)行動物或細(xì)胞水平等的驗證，揭示藥物防治疾病的現(xiàn)代藥理學(xué)機(jī)制，并探究藥物所能干預(yù)的新的適應(yīng)癥。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于系統(tǒng)生物學(xué)理論和生物系統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)分析來設(shè)計藥物的一門新興學(xué)科。
針對用于篩選重要作用靶標(biāo)（群）、關(guān)鍵藥效成分（群）等要素分析指標(biāo)進(jìn)行合理性評價，包括軟件/算法參數(shù)、網(wǎng)絡(luò)分析參數(shù)等。其中，網(wǎng)絡(luò)分析參數(shù)包括節(jié)點與邊的特征（如節(jié)點度、節(jié)點中心性、邊權(quán)重等）、網(wǎng)絡(luò)的凝聚性（如密度、聚類系數(shù)、子圖、連通性等）、網(wǎng)絡(luò)的可分割性（如層次聚類、譜分割等）、網(wǎng)絡(luò)模塊性、網(wǎng)絡(luò)基序等。針對研究的具體疾病，應(yīng)該綜合考慮以上指標(biāo)，建立合理的病證生物分子網(wǎng)絡(luò)，確定適宜的網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)。如使用全新計算方法確定藥效成分群與網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)，還應(yīng)該考察所選藥效成分及網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)對整體網(wǎng)絡(luò)穩(wěn)態(tài)的重要性。成分收集及處理:通過檢索數(shù)據(jù)庫、文獻(xiàn)，收集中藥所含化學(xué)成分。天津中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)價格
探究藥物所具有的功效以及具有該種功效的其他藥物，是探究中藥有效成分的一種新的思路。四川初級網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)
雖然網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)可有效地彌補既往中藥研究中單靶點、低選擇性的缺陷，應(yīng)用于中藥多方面，但在實際運用中仍面臨著一些挑戰(zhàn):(1)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是以數(shù)據(jù)庫與分析軟件為基礎(chǔ)，但由于目前的技術(shù)水平，數(shù)據(jù)庫還不太完善，所提供的數(shù)據(jù)及分析結(jié)果可靠性有待進(jìn)一步驗證，篩選成分的標(biāo)準(zhǔn)還有待優(yōu)化，如目前大多研究是以口服生物利用度值(OB)≥30%，類藥的性(DL)≥0.18作為篩選成分的標(biāo)準(zhǔn)，但缺乏一定的依據(jù);(2)采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)針對疾病篩選出的活性成分并非是中藥材現(xiàn)行標(biāo)準(zhǔn)中的主要質(zhì)控成分或藥材中含量較高的成分。四川初級網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)
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