山東醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析

中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)要解決的一個(gè)中心問(wèn)題是，如何在疾病相關(guān)網(wǎng)絡(luò)的背景下，評(píng)價(jià)中藥的多成分、多靶點(diǎn)的協(xié)同作用。根據(jù)中方子劑成分復(fù)雜、靶點(diǎn)不清、以周全調(diào)節(jié)的方式干預(yù)復(fù)雜疾病的特點(diǎn)，研究者們提出了一些中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究路線，如圖1就是一個(gè)典型的中藥復(fù)方研究的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)路線圖。這個(gè)路線圖包括數(shù)據(jù)獲取和網(wǎng)絡(luò)分析兩大部分。需要獲取的數(shù)據(jù)包括中方子劑的有效活性成分、活性化合物的靶點(diǎn)和疾病相關(guān)基因等?；谶@些數(shù)據(jù)，構(gòu)建和分析疾病相關(guān)網(wǎng)絡(luò)、藥物影響網(wǎng)絡(luò)，識(shí)別疾病和藥物影響的信號(hào)通路和生物學(xué)過(guò)程，能幫助我們闡明中方子劑的作用機(jī)制。中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)已成為近年來(lái)研究的熱點(diǎn)和國(guó)家自然基金重點(diǎn)支持的領(lǐng)域。山東醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析

2007年英國(guó)Dundee大學(xué)藥理學(xué)家AndrewL.Hopkins率先提出了網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)”概念。該概念是基于系統(tǒng)生物學(xué)、基因組學(xué)、蛋白組學(xué)、多向藥理學(xué)等學(xué)科的理論，運(yùn)用組學(xué)、高通量篩選、網(wǎng)絡(luò)可視化及網(wǎng)絡(luò)分析等技術(shù)揭示藥物、基因、靶點(diǎn)、疾病之間復(fù)雜的生物網(wǎng)絡(luò)關(guān)系，在此基礎(chǔ)上分析、預(yù)測(cè)藥物的藥理學(xué)機(jī)制并通過(guò)相應(yīng)的實(shí)驗(yàn)來(lái)驗(yàn)證、評(píng)估藥物的藥效、不良反應(yīng)及作用機(jī)制，發(fā)現(xiàn)高效低毒的藥物。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于系統(tǒng)生物學(xué)的理論，對(duì)生物系統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)分析，選取特定信號(hào)節(jié)點(diǎn)進(jìn)行多靶點(diǎn)藥物分子設(shè)計(jì)的新學(xué)科。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)強(qiáng)調(diào)對(duì)信號(hào)通路的多途徑調(diào)節(jié)，提高藥物的醫(yī)療效果，降低毒副作用，從而提高新藥臨床試驗(yàn)的成功率，節(jié)省藥物的研發(fā)費(fèi)用。山東醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析評(píng)價(jià)生物靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)分析中新開(kāi)發(fā)算法的可靠性，或擬選擇分析方法的正確性與穩(wěn)定性。

評(píng)價(jià)用于驗(yàn)證網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析結(jié)果的試驗(yàn)設(shè)計(jì)、檢測(cè)方法等具體實(shí)現(xiàn)過(guò)程的合理性。主要的評(píng)價(jià)內(nèi)容包括：1、驗(yàn)證模型，評(píng)價(jià)結(jié)果驗(yàn)證所采用的模型，如計(jì)算機(jī)模型、實(shí)驗(yàn)?zāi)Ｐ?、臨床研究隊(duì)列等；2、檢測(cè)指標(biāo)，評(píng)價(jià)結(jié)果驗(yàn)證所參考的具體檢測(cè)指標(biāo)，包括計(jì)算機(jī)模擬的輸出結(jié)果、算法效能的檢測(cè)指標(biāo)、實(shí)驗(yàn)或臨床試驗(yàn)的檢測(cè)指標(biāo)等。對(duì)于新開(kāi)發(fā)的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析算法，需根據(jù)結(jié)果類(lèi)型提供適宜的性能評(píng)價(jià)指標(biāo)，對(duì)其預(yù)測(cè)結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證，必要時(shí)可采用標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集進(jìn)行驗(yàn)證。

事實(shí)上，人體內(nèi)存在復(fù)雜的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)以及代謝網(wǎng)絡(luò)等。人體本身就是一個(gè)有機(jī)的整體，疾病的產(chǎn)生是眾多因素共同作用的結(jié)果，研究疾病的醫(yī)療應(yīng)該更加注重對(duì)整體的把握。如果將疾病認(rèn)為是身體原有網(wǎng)絡(luò)平衡狀態(tài)的改變，那么有效的藥物應(yīng)該是使得原有平衡狀態(tài)恢復(fù)的藥物或藥物組合，由于網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜性和穩(wěn)定性，這通常需要同時(shí)對(duì)多個(gè)靶點(diǎn)進(jìn)行調(diào)節(jié)。近年來(lái)研究人員發(fā)現(xiàn)，在精神疾病和抗傳染等方面，具有多靶點(diǎn)藥理作用的藥物比單靶點(diǎn)藥物具有更好的療效，并由此產(chǎn)生了多向藥理學(xué)和多靶點(diǎn)藥物設(shè)計(jì),并已經(jīng)應(yīng)用于多種復(fù)雜疾病的藥物研究。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是在網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)與多向藥理學(xué)的基礎(chǔ)上提出的藥物設(shè)計(jì)的新思路。

一個(gè)中藥復(fù)方通常由許多天然產(chǎn)物組成，如草藥、動(dòng)物藥和礦物藥，每一種都含有大量的化學(xué)分子。復(fù)方中的活性化合物與特定疾病相關(guān)的功能失調(diào)蛋白相互作用，從而醫(yī)療該疾病。因此，對(duì)中藥有效成分及其作用靶點(diǎn)的鑒定，對(duì)于深入了解中方子劑的作用機(jī)理具有重要意義。目前已經(jīng)建立了若干數(shù)據(jù)庫(kù)，提供有關(guān)中藥的各方面信息，包括疾病、方劑、草藥或天然產(chǎn)物、生物活性成分和靶點(diǎn)。這些數(shù)據(jù)庫(kù)成為中醫(yī)藥與現(xiàn)代的生物醫(yī)學(xué)之間的橋梁，在中藥藥理學(xué)研究中發(fā)揮了重要作用。在網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)評(píng)價(jià)中，要求從可靠性、規(guī)范性和合理性三個(gè)方面進(jìn)行評(píng)價(jià)。湖北初級(jí)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)

基因富集分析:對(duì)共同靶標(biāo)進(jìn)行基因富集分析，預(yù)測(cè)中藥醫(yī)療疾病的關(guān)鍵通路。山東醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析

針對(duì)用于篩選重要作用靶標(biāo)（群）、關(guān)鍵藥效成分（群）等要素分析指標(biāo)進(jìn)行合理性評(píng)價(jià)，包括軟件/算法參數(shù)、網(wǎng)絡(luò)分析參數(shù)等。其中，網(wǎng)絡(luò)分析參數(shù)包括節(jié)點(diǎn)與邊的特征（如節(jié)點(diǎn)度、節(jié)點(diǎn)中心性、邊權(quán)重等）、網(wǎng)絡(luò)的凝聚性（如密度、聚類(lèi)系數(shù)、子圖、連通性等）、網(wǎng)絡(luò)的可分割性（如層次聚類(lèi)、譜分割等）、網(wǎng)絡(luò)模塊性、網(wǎng)絡(luò)基序等。針對(duì)研究的具體疾病，應(yīng)該綜合考慮以上指標(biāo)，建立合理的病證生物分子網(wǎng)絡(luò)，確定適宜的網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)。如使用全新計(jì)算方法確定藥效成分群與網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)，還應(yīng)該考察所選藥效成分及網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)對(duì)整體網(wǎng)絡(luò)穩(wěn)態(tài)的重要性。山東醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析

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