吉林網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析

在網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究中，針對(duì)不同的分析對(duì)象（疾病、藥物）和分析目的（數(shù)據(jù)庫(kù)開發(fā)、算法開發(fā)、機(jī)制研究、診療發(fā)現(xiàn)、藥物研發(fā)等），必需開展的評(píng)價(jià)內(nèi)容，以保證分析結(jié)果的真實(shí)可信。在基礎(chǔ)性評(píng)價(jià)之上，針對(duì)不同的分析對(duì)象和分析目，可選擇開展的評(píng)價(jià)內(nèi)容，使評(píng)價(jià)活動(dòng)更加深入和客觀，以提升網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析結(jié)果的可信度。主要評(píng)價(jià)藥物的物質(zhì)基礎(chǔ)、生物靶標(biāo)等基礎(chǔ)數(shù)據(jù)來(lái)源及收集方法的可靠性。評(píng)價(jià)內(nèi)容如下：1、數(shù)據(jù)來(lái)源：評(píng)價(jià)使用數(shù)據(jù)的出處，如文獻(xiàn)、數(shù)據(jù)庫(kù)、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)等；2、數(shù)據(jù)信息：評(píng)價(jià)使用數(shù)據(jù)的整體情況，如數(shù)據(jù)總量、收集時(shí)間、相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)版本等；3、關(guān)聯(lián)信息：評(píng)價(jià)不同數(shù)據(jù)間進(jìn)行關(guān)聯(lián)的相關(guān)內(nèi)容，如關(guān)聯(lián)信息的數(shù)量、種類等。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于系統(tǒng)生物學(xué)理論和生物系統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)分析來(lái)設(shè)計(jì)藥物的一門新興學(xué)科。吉林網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析

針對(duì)用于篩選重要作用靶標(biāo)（群）、關(guān)鍵藥效成分（群）等要素分析指標(biāo)進(jìn)行合理性評(píng)價(jià)，包括軟件/算法參數(shù)、網(wǎng)絡(luò)分析參數(shù)等。其中，網(wǎng)絡(luò)分析參數(shù)包括節(jié)點(diǎn)與邊的特征（如節(jié)點(diǎn)度、節(jié)點(diǎn)中心性、邊權(quán)重等）、網(wǎng)絡(luò)的凝聚性（如密度、聚類系數(shù)、子圖、連通性等）、網(wǎng)絡(luò)的可分割性（如層次聚類、譜分割等）、網(wǎng)絡(luò)模塊性、網(wǎng)絡(luò)基序等。針對(duì)研究的具體疾病，應(yīng)該綜合考慮以上指標(biāo)，建立合理的病證生物分子網(wǎng)絡(luò)，確定適宜的網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)。如使用全新計(jì)算方法確定藥效成分群與網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)，還應(yīng)該考察所選藥效成分及網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)對(duì)整體網(wǎng)絡(luò)穩(wěn)態(tài)的重要性。云南網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)近年來(lái)，網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)在中醫(yī)藥領(lǐng)域應(yīng)用普遍。

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)數(shù)據(jù)的獲取和驗(yàn)證：1、網(wǎng)絡(luò)可視化技術(shù)：該技術(shù)是指運(yùn)用可視化工具，將聯(lián)系表反應(yīng)成一張相互聯(lián)系的可視網(wǎng)絡(luò)的過(guò)程。一般有兩個(gè)步驟：一是豐富網(wǎng)絡(luò)屬性，通過(guò)增添網(wǎng)絡(luò)本身、節(jié)點(diǎn)及連接的屬性，使節(jié)點(diǎn)聯(lián)系表擴(kuò)展為包含豐富信息的網(wǎng)絡(luò)，二是網(wǎng)絡(luò)描述，通過(guò)豐富的特征描述手段，使網(wǎng)絡(luò)表現(xiàn)更加直觀。目前，大部分網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究中的可視化可以通過(guò)Cytoscape、GUESS、Pajek等專業(yè)軟件工具來(lái)實(shí)現(xiàn)。2、網(wǎng)絡(luò)分析技術(shù)：該技術(shù)可以對(duì)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分析，從中提取出有用信息。主要有網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵W(xué)信息計(jì)算，可以得到網(wǎng)絡(luò)本身的統(tǒng)計(jì)屬性，反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)中的隱藏信息；隨機(jī)網(wǎng)絡(luò)生成和比較，用來(lái)對(duì)現(xiàn)有網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行可靠性驗(yàn)證；網(wǎng)絡(luò)分層和聚類，簡(jiǎn)化網(wǎng)絡(luò)復(fù)雜度的重要算法，也是尋找網(wǎng)絡(luò)潛在信息的方法。

在中藥研究領(lǐng)域，網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)會(huì)逐漸扮演重要的角色，中醫(yī)藥將不再是“偽科學(xué)”，中醫(yī)藥的研究可以充分運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究方法，證實(shí)中藥及其復(fù)方中的多種活性成分是通過(guò)多途徑、多環(huán)節(jié)、多靶點(diǎn)來(lái)醫(yī)療復(fù)雜疾病的，將傳統(tǒng)中醫(yī)藥的優(yōu)勢(shì)和較新的科學(xué)技術(shù)相結(jié)合，明確中藥及其復(fù)方在體內(nèi)作用的物質(zhì)基礎(chǔ)及作用機(jī)制，使中醫(yī)藥擺脫藥理作用機(jī)制不明，藥效成分不明的窘境，將中醫(yī)藥現(xiàn)代化并推向世界。中藥藥效評(píng)價(jià)是借鑒西藥評(píng)價(jià)體系，如單因素觀察評(píng)價(jià)模式，這種模式對(duì)對(duì)復(fù)方中藥的藥效評(píng)價(jià)并不周全。中藥講究辨證論治、用藥?kù)`活，且中醫(yī)和西醫(yī)對(duì)疾病本質(zhì)的認(rèn)識(shí)也相差較大，因此，中藥的藥效也應(yīng)該從多角度、多層次去評(píng)價(jià)。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)它具有中醫(yī)辨證的特點(diǎn)和中藥醫(yī)療的整體觀。

中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)要解決的一個(gè)中心問(wèn)題是，如何在疾病相關(guān)網(wǎng)絡(luò)的背景下，評(píng)價(jià)中藥的多成分、多靶點(diǎn)的協(xié)同作用。根據(jù)中方子劑成分復(fù)雜、靶點(diǎn)不清、以周全調(diào)節(jié)的方式干預(yù)復(fù)雜疾病的特點(diǎn)，研究者們提出了一些中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究路線，如圖1就是一個(gè)典型的中藥復(fù)方研究的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)路線圖。這個(gè)路線圖包括數(shù)據(jù)獲取和網(wǎng)絡(luò)分析兩大部分。需要獲取的數(shù)據(jù)包括中方子劑的有效活性成分、活性化合物的靶點(diǎn)和疾病相關(guān)基因等?；谶@些數(shù)據(jù)，構(gòu)建和分析疾病相關(guān)網(wǎng)絡(luò)、藥物影響網(wǎng)絡(luò)，識(shí)別疾病和藥物影響的信號(hào)通路和生物學(xué)過(guò)程，能幫助我們闡明中方子劑的作用機(jī)制。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究離不開生物網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建。山西職業(yè)醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)費(fèi)用

實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證:采用適當(dāng)技術(shù)，對(duì)預(yù)測(cè)的中藥物質(zhì)基礎(chǔ)和作用機(jī)制進(jìn)行實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。吉林網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析

網(wǎng)絡(luò)的節(jié)點(diǎn)包括基因、通路、疾病、化合物、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域、生物學(xué)進(jìn)程、蛋白質(zhì)、代謝物、藥物、內(nèi)源性小分子等。邊表示的相互作用包括實(shí)驗(yàn)測(cè)定理化相互作用、基因調(diào)控相互作用、基因共表達(dá)等其他相互作用。不同的節(jié)點(diǎn)和邊構(gòu)成了豐富的生物網(wǎng)絡(luò)。常見的網(wǎng)絡(luò)為“化合物-靶標(biāo)-基因”網(wǎng)絡(luò)，“化合物-靶標(biāo)-通路”網(wǎng)絡(luò)，“化合物-靶標(biāo)”網(wǎng)絡(luò)。網(wǎng)絡(luò)分析通常包括網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵W(xué)信息計(jì)算、隨機(jī)網(wǎng)絡(luò)生成和比較以及網(wǎng)絡(luò)分層和聚類。常用的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵W(xué)分析內(nèi)容包括度(degree)、介數(shù)(betweenness)、較短路徑(shortestpath)、瓶頸(bottleneck)、中心節(jié)點(diǎn)(hub)、模塊(moldule)、楔點(diǎn)(chokepoint)等。一個(gè)節(jié)點(diǎn)的介數(shù)值越大，流經(jīng)它的數(shù)據(jù)分組越多，意味著它更容易擁塞，成為網(wǎng)絡(luò)的瓶頸，是網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)。網(wǎng)絡(luò)分析中關(guān)注較多的是度和介數(shù)，高的度值和介數(shù)值節(jié)點(diǎn)是新藥發(fā)現(xiàn)和靶點(diǎn)預(yù)測(cè)的重點(diǎn)。吉林網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析

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