北京種子基因脫靶檢測安全性評價

通常不需要進行標準的遺傳毒性組合試驗，但應根據(jù)基因zhiliao產(chǎn)品的特點、產(chǎn)品的具體適應癥、載體的已有信息、導入基因序列結構等，評估基因zhiliao產(chǎn)品整合進基因組的可能性，判斷是否需要開展另外的遺傳毒性研究，如研究基因組修飾的發(fā)生情況，并檢測隨后可能發(fā)生的異常細胞行為；評估插入突變（插入位點、插入拷貝數(shù)等）引起的遺傳毒性風險。當基因zhiliao產(chǎn)品采用基因編輯或轉座子技術時，需要關注脫靶編輯、轉座子轉座印跡引起的遺傳毒性問題；鑒定/表征基因組整合位點。如何檢測是否發(fā)生脫靶？北京種子基因脫靶檢測安全性評價

不同基因zhiliao產(chǎn)品的特殊考慮。關于整合性載體的特殊考慮如受試者接受整合性載體基因zhiliao產(chǎn)品，例如轉座子元件、γ-逆轉錄病毒、慢病毒及其他逆轉錄病毒載體，或利用整合性載體或基于轉座子的載體在體外修飾的細胞，長期隨訪中需格外關注基因zhiliao產(chǎn)品的基因組整合風險，建議申辦方分析基因zhiliao載體在靶細胞或相關替代細胞的基因組中整合的影響（例如是否存在克隆性生長、是否存在優(yōu)勢克隆、克隆性生長是否導致惡性liu等）。如果基因組整合相關風險的分析可行，應注意以下幾點：?在接受基因zhiliao產(chǎn)品的較初5年內(nèi)，兩次檢測間的采樣間隔建議不超過6個月。此后每年至少檢測一次，直至檢測數(shù)據(jù)表明不再存在任何安全性風險。北京種子基因脫靶檢測安全性評價通過對DSB的標記實現(xiàn)了全基因組無偏脫靶檢測，如IDLVs、BLESS、GUIDE-seq技術等。

對于CAR修飾的免疫細胞，應采用多種體外方法評估其胞外抗原識別區(qū)的脫靶風險。TCR修飾免疫細胞的脫靶毒性可通過評估TCR與人體自身抗原肽的交叉識別能力來評估。首先，應采用體外試驗測定TCR修飾的免疫細胞與人自身抗原肽-HLA（與遞呈靶抗原肽的HLA等位基因相同）復合物的親和力，并說明抗原肽的選擇依據(jù)及選擇范圍。此外，還應研究其他相關或不相關的蛋白中是否含有靶抗原肽序列。如果TCR與人自身抗原肽有交叉反應可能，應確定靶抗原肽的較小識別基序（motif），并采用計算機預測分析評估交叉反應性。如果計算機預測可識別出具有潛在交叉反應性的抗原肽，應在體外測定TCR修飾免疫細胞對表達相應蛋白或遞呈相應抗原肽的的細胞的識別能力。如果不能排除交叉反應性，應基于含有潛在交叉反應性抗原肽的蛋白的表達模式以及TCR與潛在交叉反應性抗原肽的親和力來進行風險評估。為獲得TCR與其他等位HLA潛在交叉反應性的信息，應進行充分的HLA交叉反應性篩選。

CRISPR/Cas9的問題：和TALEN和ZFNS技術一樣，CRISPR/Cas9技術在應用時也存在一定概率的脫靶問題——Cas9核酸酶在非目標位點發(fā)生切割，引入非預期的基因突變。脫靶切割引入的突變可能會直接破壞細胞的基本功能，帶來不可預控的嚴重后果。如何減輕脫靶效應？gRNA的GC含量：gRNA 的序列結構對CRISPR/Cas9基因編輯的靶向活性有影響。gRNA 序列中 40%–60%的 GC 含量可以增加靶向活性，因為較高的 GC 含量穩(wěn)定了DNA：RNA 雙鏈體并破壞了脫靶結合。gRNA-on-gRNA序列的位置對編輯有影響，位于四個核苷酸末端的嘌呤殘基可以提高編輯效率。鳥嘌呤優(yōu)先選擇在gRNA的20位，胞嘧啶優(yōu)先選擇在16位以增加靶向編輯。種子基因脫靶檢測多少錢？

如何檢測脫靶效應？在gRNA修飾中，截短的sgRNA是一種減少脫靶效應的簡單方法，并且基于RNP的遞送在大多數(shù)情況下適用于獲得更高的目標活性。此外，選擇合適的Cas變體對于減少脫靶效應也至關重要。但選擇合適的脫靶檢測工具，也是重中之重。脫靶預測結合PCR檢測法，利用脫靶預測軟件預測潛在的脫靶位點，PCR擴增預測的脫靶位點，利用直接測序或酶切法檢測脫靶情況。操作簡便、成本低偏倚性預測。全基因組測序，一種通過高通量測序檢測脫靶突變的方法，需要選擇適當?shù)膮⒖蓟蚪M過濾背景突變，數(shù)據(jù)比對分析獲得含有PAM基序的潛在修飾位點，進一步基因擴增驗證其突變情況。高通量全基因組范圍檢測可檢測SNPs，Indels和染色體水平變化。脫靶檢測方法，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高，檢測效率高，結果準確率高。南京基因編輯技術脫靶檢測評估標準

高深度全基因組重測序服務,該方法能多方位精細地對基因編輯的細胞或個體進行off-target檢測。北京種子基因脫靶檢測安全性評價

長期表達。與其他產(chǎn)品相比，部分基因zhiliao產(chǎn)品的明顯特征是可以在患者靶細胞或基因修飾細胞中持續(xù)存在并編碼表達作用因子（功能性蛋白或基因表達調節(jié)元件），并通過長久或長期改變靶細胞或組織的功能來達到zhiliao效果。同時，由于基因zhiliao編碼的作用因子在體內(nèi)的長期暴露或表達異常，可能產(chǎn)生與其功能相關的長期安全性風險，如細胞生長失控和惡性liu形成、自身免疫反應或其他無法預測的遲發(fā)性不良反應。潛伏再jihuo。部分病毒類基因zhiliao產(chǎn)品可能存在從潛伏期被再jihuo的可能性或者引起機體中已有病毒ganran的再jihuo，存在ganran相關的遲發(fā)性不良反應的風險。北京種子基因脫靶檢測安全性評價