上海種子基因脫靶檢測實(shí)驗(yàn)室

采用基因編輯技術(shù)制備的細(xì)胞產(chǎn)品。對于采用基因編輯技術(shù)制備的基因修飾細(xì)胞產(chǎn)品，應(yīng)進(jìn)行體外在靶和脫靶活性評估，以確認(rèn)修飾酶或向?qū)NA對靶基因序列的特異性。在評估基因編輯的脫靶風(fēng)險(xiǎn)時(shí)，應(yīng)說明所選擇的評價(jià)策略的合理性和敏感性。雖然采用計(jì)算機(jī)分析預(yù)測基因編輯的潛在脫靶位點(diǎn)，并對潛在脫靶位點(diǎn)進(jìn)行深度測序分析，可用于評估基因編輯的脫靶風(fēng)險(xiǎn)；但選擇的評價(jià)策略仍應(yīng)包含體外全基因組測序比對，以證明潛在脫靶位點(diǎn)未出現(xiàn)脫靶。此外，在評估脫靶活性時(shí)，還應(yīng)評估種屬特異性的差異、細(xì)胞病理生理狀態(tài)的差異或細(xì)胞類型的差異對非臨床數(shù)據(jù)預(yù)測性的影響。必要時(shí)，還應(yīng)分析基因編輯對細(xì)胞表型和生理功能的潛在影響。種子基因脫靶檢測，推薦唯可生物，實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng)，專業(yè)性高，檢測效率高，結(jié)果準(zhǔn)確率高。上海種子基因脫靶檢測實(shí)驗(yàn)室

CRISPR/Cas系統(tǒng)是細(xì)菌和古細(xì)菌在不斷進(jìn)化的過程中產(chǎn)生的適應(yīng)性免疫防御機(jī)制，它應(yīng)用CRISPR RNA（crRNA）以堿基互補(bǔ)的形式引導(dǎo)相應(yīng)的Cas蛋白識別入侵的外源基因組，并對其DNA進(jìn)行剪切，用以保護(hù)自身的基因組免受外源核酸如噬菌體、病毒等的干擾和破壞。經(jīng)過人為改造后，可在真核細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)高度靈活且特異的基因組編輯，通過設(shè)計(jì)特異性向?qū)NA(Single guide RNA, sgRNA)序列與靶序列進(jìn)行堿基配對，從而引導(dǎo)Cas蛋白結(jié)合到靶序列處，行使DNA切割功能，然后利用細(xì)胞的非同源性末端連接(Non-homologous end joining, NHEJ)或同源重組(Homologous recombination,HR)修復(fù)機(jī)制對斷裂的DNA進(jìn)行插入缺失(Indel)、修復(fù)(Repair)或替換(Replacement)。由于其相對于鋅指核酸酶(ZFNs)和轉(zhuǎn)錄jihuo因子樣效應(yīng)物核酸酶(TALENs)技術(shù)更易于操作，而且更高效，因而被廣運(yùn)用于對基因組特定位點(diǎn)進(jìn)行靶向編輯。常州種子基因脫靶檢測評估影響CRISPR靶向性效率和特異性的因素有哪些？

GUIDE-Seq脫靶評估技術(shù)的優(yōu)勢分析鼓潤致力于基因組編輯工具脫靶的分析檢測工作，為篩選、優(yōu)化基因組編輯工具的保真性提供標(biāo)準(zhǔn)化的分析。我們脫靶分析具有如下優(yōu)勢：實(shí)用性強(qiáng)：能反映CRISPR在真核細(xì)胞中進(jìn)行基因編輯的在靶與脫靶情況，以進(jìn)行安全性和有效性評價(jià)；檢測通量高：一次能檢測多個樣本的在靶與脫靶情況，并通過優(yōu)化的標(biāo)簽設(shè)計(jì)，降低實(shí)際的測序reads數(shù)量；準(zhǔn)確性高：絕大部分檢測結(jié)果可被驗(yàn)證；靈敏度高：能夠高效檢測出低頻脫靶位點(diǎn)，檢測低至0.1%的脫靶突變；實(shí)驗(yàn)難度低：操作過程簡單易行細(xì)胞適應(yīng)性強(qiáng)。

Guide-seq原理圖，Discover-seq細(xì)胞內(nèi)的脫靶切割一般無法直接捕獲，除了Guide-seq這種連接dsODN來間接記錄脫靶位點(diǎn)的方法外，研究者們還想出一種蛋白介導(dǎo)的方法Discover-seq。由于DNA雙鏈斷裂后細(xì)胞會啟動DNA修復(fù)機(jī)制，大量蛋白參與到斷裂處的修復(fù)，所以研究者就對相關(guān)蛋白進(jìn)行篩選，找到其中MRE11結(jié)合DNA的位點(diǎn)與DNA雙鏈斷裂的相關(guān)性比較好。DISCOVER-seq便是通過MRE11的CHIP-seq（染色質(zhì)免疫共沉淀）來反映CRISPR的脫靶位點(diǎn)。。。。值得收藏的CRISPR脫靶檢測方法。

檢測方法的敏感度、特異性和可重復(fù)性應(yīng)經(jīng)過驗(yàn)證，并設(shè)計(jì)適當(dāng)?shù)年栃院完幮詫φ眨划?dāng)體內(nèi)靶細(xì)胞或替代細(xì)胞中載體序列陽性的比例超出預(yù)期范圍時(shí)，應(yīng)開展克隆性生長的評估。如果存在優(yōu)勢克隆或單克隆生長，應(yīng)在不超過3個月的時(shí)間內(nèi)再次檢測確認(rèn)，并盡快開展整合位點(diǎn)的分析。當(dāng)載體的整合位點(diǎn)確定后，應(yīng)與人類基因組數(shù)據(jù)庫及基因組的其他數(shù)據(jù)庫等進(jìn)行比較，確定整合位點(diǎn)的基因功能，評估是否與包括zheng在內(nèi)的任何疾病有關(guān)。如果受試者體內(nèi)出現(xiàn)載體陽性細(xì)胞的克隆性生長，或檢測發(fā)現(xiàn)基因整合位點(diǎn)在基因或相關(guān)基因附近，應(yīng)縮短檢測間隔至不超過3個月并密切監(jiān)測惡性liu征兆，直至檢測不到基因zhiliao載體。隨著脫靶影響因素、降低策略及脫靶檢測技術(shù)研究的不斷深入，未來CRISPR/Cas9系統(tǒng)將在更多領(lǐng)域造福人類。無錫高精度脫靶檢測評估

脫靶檢測簡單有效的方法之一是全基因組測序法。上海種子基因脫靶檢測實(shí)驗(yàn)室

當(dāng)基因zhiliao產(chǎn)品在生殖qiguan持續(xù)存在時(shí)，需要進(jìn)一步研究確定其在生殖細(xì)胞（例如卵母細(xì)胞、精子）的暴露水平。根據(jù)載體類型、復(fù)制能力、基因組整合特性、劑量水平、給藥途徑等因素，分析評估基因zhiliao產(chǎn)品生殖系整合風(fēng)險(xiǎn)。遺傳毒性，基因zhiliao產(chǎn)品將遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移到宿主細(xì)胞內(nèi)或整合到宿主基因組中或?qū)λ拗骰蚪M進(jìn)行編輯，存在潛在的遺傳毒性風(fēng)險(xiǎn)。目前對于判斷細(xì)胞基因組插入/修飾是否會產(chǎn)生遺傳毒性、是否較終會發(fā)生變依然還缺乏系統(tǒng)的認(rèn)知，因此，需要分析基因組改變（載體或遺傳物質(zhì)整合進(jìn)基因組、對基因組編輯等）的特征，并評估相關(guān)潛在風(fēng)險(xiǎn)。上海種子基因脫靶檢測實(shí)驗(yàn)室

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