利用ddPCR檢測溶液中空載體的濃度和整合到T細胞群中的CAR和TCR載體的平均數(shù)量。ddPCR檢測到的平均每個細胞的載體拷貝數(shù)與流式細胞術(shù)檢測到的細胞轉(zhuǎn)導(dǎo)比例呈線性關(guān)系。使用ddPCR與Real-time PCR的定量精度比較表明，ddPCR明顯更精確，測量的差異減少了7倍，文中通過一些數(shù)據(jù)的比較說明了ddPCR具有更高的準確性和穩(wěn)定性。使用ddPCR測定法通過不同的工作人員獲得了類似的載體拷貝數(shù)測量結(jié)果，突出了該測定法在技術(shù)人員之間的可重復(fù)性。對新鮮的和冷凍保存的CAR T和TCR工程改造的T細胞進行的分析得出了相似的結(jié)果。說明ddPCR是一種準確定量CAR和TCR工程T細胞中平均載體拷貝...

利用ddPCR檢測溶液中空載體的濃度和整合到T細胞群中的CAR和TCR載體的平均數(shù)量。ddPCR檢測到的平均每個細胞的載體拷貝數(shù)與流式細胞術(shù)檢測到的細胞轉(zhuǎn)導(dǎo)比例呈線性關(guān)系。使用ddPCR與Real-time PCR的定量精度比較表明，ddPCR明顯更精確，測量的差異減少了7倍，文中通過一些數(shù)據(jù)的比較說明了ddPCR具有更高的準確性和穩(wěn)定性。使用ddPCR測定法通過不同的工作人員獲得了類似的載體拷貝數(shù)測量結(jié)果，突出了該測定法在技術(shù)人員之間的可重復(fù)性。對新鮮的和冷凍保存的CAR T和TCR工程改造的T細胞進行的分析得出了相似的結(jié)果。說明ddPCR是一種準確定量CAR和TCR工程T細胞中平均載體拷貝...

對于CAR修飾的免疫細胞，應(yīng)采用多種體外方法評估其胞外抗原識別區(qū)的脫靶風(fēng)險。TCR修飾免疫細胞的脫靶毒性可通過評估TCR與人體自身抗原肽的交叉識別能力來評估。首先，應(yīng)采用體外試驗測定TCR修飾的免疫細胞與人自身抗原肽-HLA（與遞呈靶抗原肽的HLA等位基因相同）復(fù)合物的親和力，并說明抗原肽的選擇依據(jù)及選擇范圍。此外，還應(yīng)研究其他相關(guān)或不相關(guān)的蛋白中是否含有靶抗原肽序列。如果TCR與人自身抗原肽有交叉反應(yīng)可能，應(yīng)確定靶抗原肽的較小識別基序（motif），并采用計算機預(yù)測分析評估交叉反應(yīng)性。如果計算機預(yù)測可識別出具有潛在交叉反應(yīng)性的抗原肽，應(yīng)在體外測定TCR修飾免疫細胞對表達相應(yīng)蛋白或遞呈相應(yīng)抗原...

Southern blot 是一種常用的 DNA 定量的分子生物學(xué)方法。其原理是將待測的 DNA 樣品固定在固相載體（硝酸纖維膜或尼龍膜）上，與標記的核酸探針進行雜交，在與探針有同源序列的固相 DNA 的位置上顯示出雜交信號，通過檢測信號的有無、強弱可以對樣品定性、定量，從而計算出轉(zhuǎn)入的拷貝數(shù)。 Southern 法準確性高、特異性強，但存在費時費力的缺點。實時熒光定量PCR，其定量的基本原理是在PCR反應(yīng)體系中加入非特異性的熒光染料（如：SYBRGREENI）或特異性的熒光探針（如：Taqman探針）。質(zhì)粒的擴增會占用大量資源,當載體用于表達或者其他用途時,也會使用上低拷貝質(zhì)粒。寧波VCN載...

對于CAR修飾的免疫細胞，應(yīng)采用多種體外方法評估其胞外抗原識別區(qū)的脫靶風(fēng)險。TCR修飾免疫細胞的脫靶毒性可通過評估TCR與人體自身抗原肽的交叉識別能力來評估。首先，應(yīng)采用體外試驗測定TCR修飾的免疫細胞與人自身抗原肽-HLA（與遞呈靶抗原肽的HLA等位基因相同）復(fù)合物的親和力，并說明抗原肽的選擇依據(jù)及選擇范圍。此外，還應(yīng)研究其他相關(guān)或不相關(guān)的蛋白中是否含有靶抗原肽序列。如果TCR與人自身抗原肽有交叉反應(yīng)可能，應(yīng)確定靶抗原肽的較小識別基序（motif），并采用計算機預(yù)測分析評估交叉反應(yīng)性。如果計算機預(yù)測可識別出具有潛在交叉反應(yīng)性的抗原肽，應(yīng)在體外測定TCR修飾免疫細胞對表達相應(yīng)蛋白或遞呈相應(yīng)抗原...

流式檢測CAR+T細胞數(shù)量，較，作者用FC流式評估了用axis-cel和tisasa-celzhiliao的患者的CAR+T細胞的數(shù)量。在CAR-T細胞給藥后5個不同時間點冷凍的PBMCs上對UPN#009(軸細胞)和UPN#020(組織細胞)進行了回顧性FC試驗。CAR-T細胞的數(shù)量測定每ul血液。從圖4中可以明顯看出，兩種方法都可以觀察到CAR-T細胞數(shù)量的高度收斂。值得注意的是，所有三種方法(fc、dPCR和qPCR)都檢測到了第35天UPN#009中CAR-T細胞數(shù)量的復(fù)蘇。這些數(shù)據(jù)與我們小組之前觀察到的基于PCR和基于fc的定量的高一致性相一致。對于質(zhì)粒載體,拷貝數(shù)是我們關(guān)心的特性之...

主要有兩方面的原因：一方面，高拷貝數(shù)時外源基因的表達量不再由質(zhì)粒的拷貝數(shù)決定，可能是由轉(zhuǎn)錄和翻譯水平?jīng)Q定的；另一方面，高拷貝數(shù)的質(zhì)粒往往很不穩(wěn)定。由于質(zhì)?？截悢?shù)的變化直接與基因目標產(chǎn)物的產(chǎn)率有關(guān)，因此對于重組蛋白的生產(chǎn)來說，質(zhì)粒的拷貝數(shù)是一個非常重要的參數(shù)。同一個細胞里一般不會同時有兩種不同的質(zhì)粒，這是質(zhì)粒不相容性(plasmidincompatibility)。在細菌細胞增殖過程中，其中必有一種會被逐漸排斥。所以要用純化過的低拷貝質(zhì)粒。低拷貝在鳥法測序中很常用的。隨機測序戰(zhàn)略又稱鳥戰(zhàn)略(shotgunstrategy),此策略是將人類基因組DNA用機械方法隨機切割成2Kb左右的小片段,把這些...

ddPCR與qPCR在監(jiān)測CART細胞拷貝數(shù)靈敏度比較，CAR-T細胞免疫zhiliao發(fā)展迅速，CAR-T細胞zhiliao后的動力學(xué)監(jiān)測對患者隨訪至關(guān)重要，對指導(dǎo)接受CAR - T細胞zhiliao的患者的臨床決策也很重要。在給藥前，CAR - T細胞產(chǎn)品內(nèi)的轉(zhuǎn)基因副本信息，如載體副本數(shù)量，對保證患者的安全性非常重要。然而，目前還缺乏開放區(qū)域定量檢測CAR - T細胞的實驗方法。一些機構(gòu)已經(jīng)建立了內(nèi)部分析來監(jiān)測CAR - T細胞頻率。2022年2月11日，MARIA?LUISA SCHUBERT等團隊在INTERNATIONAL JOURNAL OF ONCOLOGY 上發(fā)表了題為：Com...

對特定類型基因修飾細胞產(chǎn)品的特殊考慮鑒于基因修飾細胞的產(chǎn)品種類繁多、各有特點，除上述一般技術(shù)要求外，還應(yīng)基于產(chǎn)品的特性進行相應(yīng)的特殊考慮。本指導(dǎo)原則列舉了以下三種情形的特殊考慮。CAR或TCR修飾的免疫細胞對于嵌合抗原受體（Chimericantigenreceptor，CAR）或T細胞受體（Tcellreceptor，TCR）修飾的免疫細胞，應(yīng)盡可能采用多種方法評估其靶點相關(guān)毒性和脫靶毒性風(fēng)險。對于靶點相關(guān)毒性，應(yīng)采用體外方法深入分析靶點在人體qiguan、組織和細胞中的表達分布情況，基因表達分析庫和文獻調(diào)研也可能會有助于闡明靶點在不同病理生理狀態(tài)下的表達是否存在差異。應(yīng)采用表達和不表達靶抗...

新型CAR/TCR T細胞臨床產(chǎn)品中載體拷貝數(shù)的定量—數(shù)字PCR法?；蚬こ蘐細胞已經(jīng)成為zhiliaoB細胞惡性的重要方法。CAR-T細胞的常見應(yīng)用是zhiliao過表達細胞外標記物的B細胞惡性。基因工程T細胞已經(jīng)成為zhiliaoB細胞惡性的重要方法。CAR-T細胞的常見應(yīng)用是zhiliao過表達細胞外標記物的B細胞惡性。嵌合抗原受體(CAR)T細胞是一種新型細胞療法，其中自患者體內(nèi)收獲自體T細胞并進行基因修飾以表達嵌合抗原受體。測量載體整合到T細胞基因組的效率對于評估這些ai免疫療法的效力和安全性是很重要的。 ..載體拷貝數(shù)就是某種質(zhì)粒在單個細菌中的數(shù)量。寧波基因療法載體拷貝數(shù)方法主要有...

在沒有接受任何橋接zhiliao的3名患者中，1名患者有PR,2名患者有PD之前接受過CAR-T細胞zhiliao。CAR-T細胞zhiliao后，16例患者發(fā)生CRS，其中3例為高級別CRS。6例ICANS,2例ICANS等級高。CAR-T細胞拷貝的峰值水平在43到159,304拷貝/ugPBMCDNA之間。在CAR-T細胞擴增高峰(UPN#001和#003)的患者中觀察到高ICANS。1例患者(UPN#017)在CAR-T細胞zhiliao后1周內(nèi)死亡，原因是噬血細胞性淋巴組織細胞增多/巨噬細胞活化綜合征。其余19例患者可評估臨床療效:14例(74%)患者zhiliao有效，8例(42%)...