相信大家都聽過或已經(jīng)接觸過一些常用的分型方法,如片段長度多態(tài)性(限制性內切酶)法,直接測序法,Taqman熒光探針法,LDR連接酶檢測反應法,競爭性等位基因特異性PCR法(KASP),二代測序法等,小E就針對以上幾種常用分型方法為大家做一個介紹和總結。上海翼和應用生物技術有限上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、高質量可靠的遺傳學技術服務和產品。根據(jù)高同源區(qū)段位點數(shù)量,提供多重長片段巢式PCR-LDR SNP分型和多重長片段巢式PCR-NGS SNP分型兩種解決方案。SNP基因分型哪里好
基因的直系同源、旁系同源或異源同源關系[1]。祖先物種通過兩次物種分化形成ABC三個物種;伴隨物種分化而進行的兩次基因重復共形成A1、B1、B2、C1、C2、C3等6個基因。顯然,C2與C3互為直系同源;B1與C1互為旁系同源;AB1與其他6個基因互為異源同源。然而,B1和B2、B2和C1又是什么關系呢?在這個問題上曾引起爭議。B1和B2、B2和C1的分離是由于***次基因重復而產生的,套用定義,可得出B1和B2、B2和C1互為旁系同源。同理,B1和C2/C3、C1和C2/C3也互為旁系同源。類似的,根據(jù)直系同源基因的定義,B2和C2/C3、A1和所有B基因及C基因互為直系同源。浙江高同源SNP分型技術服務但是當位點數(shù)和樣本量都比較大的時候,長片段PCR增加成本,工作量也非常龐大了。
連接酶檢測反應(LigaseDetectionReaction,LDR)是利用高溫連接酶實現(xiàn)對基因多態(tài)性位點的識別,高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補的兩條寡聚核苷酸接頭對應處存在著基因點突變類型的堿基錯配,連接反應就不能進行。該方法,對SNP位點同時設計兩條有長度差異的探針,當探針末端與模板有一個堿基不配對,所以連接反應不能進行,沒有連接產物;相反,若探針與模板DNA完全互補,故進行連接反應,通過溫控循環(huán),該特異性連接反應可反復進行,達到線性擴增的效果。,后通過熒光掃描片段長度,實現(xiàn)對SNP位點的檢測。
SNP全稱Single Nucleotide Polymorphism,即單核苷酸多態(tài)性,是指在基因組DNA序列中由于單個核苷酸(A,T,C和G)的突變引起的多態(tài)性。一個SNP表示基因組某個位點有一個核苷酸的變化,源于單個堿基的轉換,顛換,插入和缺失。上海翼和應用生物技術有限公司是上海市遺傳學會理事單位,是上海市高新技術企業(yè),至今已有十六年歷史,專注于為國內科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學技術服務(高同源區(qū)段SNP分型)和質控試劑盒。SNP基因分型技術原理是PCR擴增含有SNP的基因組片段。
上海翼和生物根據(jù)具體實驗規(guī)模,提供兩種檢測平臺,分別為:適合中低通量檢測的PCR-LDR分型服務和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務。PCR-LDR SNP分型服務:PCR-LDR技術是PCR技術和LDR(Ligase Detection Reaction,連接酶檢測反應)想結合的檢測技術。LDR是利用高溫連接酶實現(xiàn)對基因多態(tài)性位點的識別。高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補的兩條寡聚核苷酸接頭對應處存在著基因點突變類型的堿基錯配,則連接反應就不能進行,反之則可以進行連接反應。Hi-SNP結合多重PCR技術和高通量測序技術,對需要檢測的位點設計特異性引物,在單管內進行多重PCR擴增,不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分?;旌蠘颖竞螅趇llumina 等主流測序平臺上,對擴增子進行高通量測序。測序結果使用生物信息學方法,區(qū)分不同的樣本,,終獲得每個位點的SNP信息。高通量測序能一次對幾百萬條DNA分子進行序列測定,相比其他的SNP檢測技術,基于高通量測序的SNP分型具有更準確、更靈敏的特點。.高同源區(qū)段在多倍體物種中,又細分為橫向同源和部分同源。SNP基因分型哪里好
多態(tài)性是一個群體概念,多態(tài)性指這個差異占群體的1%以上。否則就叫突變(小于1%)。SNP基因分型哪里好
RFLP法的優(yōu)點是分型技術簡單,結果判斷容易,不需要昂貴的設備,成本低,并且實驗人員培訓簡單。但是通過SNP能夠導致RFLP的概率低,很多SNP位點不能采用這種方法進行檢測,而且有的限制性酶價格昂貴并且不容易買到。通常酶切的條件較高,容易出現(xiàn)假陽性結果,且工作量大,耗時長,通量低。這是早期的一種SNP分型技術,在通量和效率上難以滿足批量分型需求,因此這種技術目前只在個別實驗室中還在使用中。上海翼和應用生物技術有限公司SNP基因分型哪里好
上海翼和應用生物技術有限公司總部位于龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號502,是一家第三方檢測服務;生物專業(yè)領域內的技術開發(fā)、技術咨詢、技術服務;健康衰老評估;大健康檢測;遺傳學技術服務;生物醫(yī)藥行業(yè)質控檢測技術技術服務;小鼠遺傳品系鑒定;轉基因小鼠基因型鑒定;細胞點突變檢測;細胞端粒長度和端粒酶活性檢測。的公司。翼和生物擁有一支經(jīng)驗豐富、技術創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團隊,以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供細胞組織小鼠質控,大健康檢測,生物技術服務。翼和生物致力于把技術上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產品上的貼心,為用戶帶來良好體驗。翼和生物始終關注醫(yī)藥健康行業(yè)。滿足市場需求,提高產品價值,是我們前行的力量。