北京小鼠細(xì)胞STR鑒定周期

來源: 發(fā)布時(shí)間:2021-11-14

短串聯(lián)重復(fù)(Short tandem repeats, STR),又稱微衛(wèi)星DNA(Microsatellite DNA)或簡單重復(fù)序列(Simple repeat sequence, SRS或SSR),是普遍存在于原核生物和真核生物基因組中的核苷酸重復(fù)序列。有絲分裂過程中DNA鏈之間的錯(cuò)配引起的復(fù)制滑動(dòng)被認(rèn)為是導(dǎo)致STR產(chǎn)生的較為常見原因,并且依據(jù)不同復(fù)制單元大小的不同以及不同物種之間,復(fù)制滑動(dòng)發(fā)生的概率也不相同。STR已被廣泛應(yīng)用于親子鑒定、個(gè)體識別、司法鑒定、交通事故鑒定、(造血干細(xì)胞)移植醫(yī)治后嵌合情況監(jiān)測等領(lǐng)域。什么是細(xì)胞系STR鑒定?北京小鼠細(xì)胞STR鑒定周期

熱烈祝賀上海翼和生物客戶第三軍醫(yī)大學(xué)新橋醫(yī)院內(nèi)分泌科發(fā)表文章“NRF2 activation by antioxidant antidiabetic agents accelerates tumor metastasis ”于Science Translational Medicine雜志,影響因子16.3,其中上海翼和生物為研究中所涉及到的細(xì)胞系提供了細(xì)胞STR鑒定服務(wù)。恭賀上海翼和生物客戶趙永良研究員課題組在Cancer Research雜志(IF=8.5)發(fā)表研究論文。熱烈祝賀上海翼和生物客戶中科院北京基因組研究所趙永良研究員課題組默董亮博士發(fā)表文章“Human helicase RECQL4 drives cisplatin resistance in gastric cancer by activating an AKT-YB1-MDR1 signaling pathway”于Cancer Research雜志,影響因子8.556,其中上海翼和生物為研究中所涉及到的多株細(xì)胞系提供了細(xì)胞STR鑒定服務(wù)。鄭州小鼠細(xì)胞STR鑒定位點(diǎn)一株細(xì)胞系的遺傳特征確立后,細(xì)胞系可以通過定期的檢測,以防止出現(xiàn)細(xì)胞系被誤認(rèn)或交叉污染的情況。

現(xiàn)如今,大家在購買細(xì)胞株的時(shí)候,會(huì)面臨諸多突出的問題︰①細(xì)胞活性不足,收到細(xì)胞后存活率不高,導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)無法正常進(jìn)行;②細(xì)胞本身的質(zhì)量無法保證,除正規(guī)單位的細(xì)胞外,無法確認(rèn)細(xì)胞源本身質(zhì)量;③市場上以次充好、良莠不齊、魚龍混珠的假細(xì)胞比比皆是、無法分辨。如果你一不注意,使用了沒有經(jīng)過相應(yīng)的細(xì)胞鑒定的細(xì)胞、或者是被污染的細(xì)胞,極有可能的結(jié)果就是——論文的結(jié)論被否定、論文被召回,這中間大量的時(shí)間、物力和人力均被浪費(fèi),一切都要從頭再來。

在過去的的幾十年間,在細(xì)胞生物學(xué)領(lǐng)域,文章一直在發(fā)表,科研成果一直在公布,但是當(dāng)中哺乳動(dòng)物細(xì)胞被錯(cuò)誤鑒定,存在交叉污染的情況也同時(shí)存在著。2010年有雜志(IJC)統(tǒng)計(jì)出一列表,在346篇文章中,有 103篇存在細(xì)胞被Hela細(xì)胞污染的情況。當(dāng)然還有,在2001年,科學(xué)家在一篇論文里報(bào)道了一株新建立的大鼠(rat)視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)的細(xì)胞系(留個(gè)印象是大鼠來源的),命名為RGC-5。在隨后的十幾年時(shí)間里,至少230篇論文的研究與假設(shè)是建立在這株細(xì)胞系上。結(jié)果在2009年,序列測定結(jié)果表明,RGC-5是一株小鼠(mouse)細(xì)胞。隨著越來也多細(xì)胞被污染的問題出現(xiàn),大家也開始意識到細(xì)胞污染的嚴(yán)重性,2007年,NIH強(qiáng)烈建議在使用細(xì)胞時(shí)進(jìn)行鑒定。目前STR基因分型方法被認(rèn)為是檢測細(xì)胞交叉污染和性質(zhì)鑒定極為有效以及準(zhǔn)確的方法,多個(gè)細(xì)胞庫分別提供了各種細(xì)胞株的STR基因分析數(shù)據(jù)以供參考比對。所謂細(xì)胞系鑒定即通過STR(短串聯(lián)重復(fù))圖譜所建立細(xì)胞系的遺傳特征。

如何知道細(xì)胞系是否發(fā)生交叉污染了?如果存在細(xì)胞系之間發(fā)生交叉污染,而且鑒定用的細(xì)胞可能有兩種以上的細(xì)胞系時(shí),那么在進(jìn)行STR位點(diǎn)檢測的時(shí)候,多個(gè)位點(diǎn)會(huì)出現(xiàn)兩個(gè)以上的峰。峰高值表示該等位基因的信號強(qiáng)度,理論上峰值與樣本的DNA濃度有直接的關(guān)系。因此,存在交叉污染的混合細(xì)胞系中,其中一個(gè)位點(diǎn)中某些峰會(huì)明顯高于其他的峰,其中大峰是屬于混合細(xì)胞系中那個(gè)主要細(xì)胞系,而小峰則屬于那個(gè)次要細(xì)胞系。STR鑒定目前已被ICLAC、ATCC等機(jī)構(gòu)作為金標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)用于細(xì)胞鑒定,越來越多的雜志要求在投稿時(shí)提供細(xì)胞STR分型數(shù)據(jù)。存在細(xì)胞系之間發(fā)生交叉污染,在進(jìn)行STR位點(diǎn)檢測的時(shí)候,多個(gè)位點(diǎn)會(huì)出現(xiàn)兩個(gè)以上的峰。浙江小鼠STR鑒定位點(diǎn)

細(xì)胞鑒定哪家強(qiáng),上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司。本公司比較多可提供20余對STR引物,對細(xì)胞進(jìn)行鑒定。北京小鼠細(xì)胞STR鑒定周期

短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeat,STR),又稱為微衛(wèi)星標(biāo)記(microsalite)。它普遍并均勻地存在于真核生物基因組中,一般由一個(gè)長2~6bp的中心序列經(jīng)多次串聯(lián)重復(fù)排列而成,重復(fù)次數(shù)大多在10~60次之間。個(gè)體間中心序列的重復(fù)次數(shù)呈高度變異性,構(gòu)成了STR的遺傳多態(tài)性。由于其序列簡短,通過PCR很容易從基因組DNA中特異性地?cái)U(kuò)增出來,極大簡化了微衛(wèi)星多態(tài)性分析的操作。研究者只需在目標(biāo)基因座設(shè)計(jì)一對或多對引物,通過PCR反應(yīng)從模板DNA中將該基因擴(kuò)增出來,然后使用測序儀進(jìn)行電泳分離分析即可。它具有分布普遍,易于檢測,信息量大,有高度多態(tài)性并遵循孟德爾共顯性遺傳等優(yōu)點(diǎn),被認(rèn)為是繼限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)之后的第二代遺傳標(biāo)記,已普遍應(yīng)用于遺傳圖譜繪制、基因定位、法醫(yī)鑒定、遺傳病診斷等諸多領(lǐng)域。北京小鼠細(xì)胞STR鑒定周期

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