高通量二代測序法SNP基因分型——你有我有，你沒有我也有：上海翼和應用生物技術有限公司通過自主研發(fā)的高重PCR技術，擴增引物經(jīng)修飾及優(yōu)化，克服了傳統(tǒng)多重PCR擴增效率不均一問題，95%以上擴增子的測序深度在平均測序深度的0.2X范圍，保證測序通量的有效利用。基于超高重PCR技術平臺的高通量二代SNP分型服務，適用于多種遺傳學研究領域，如疾病與基因的關聯(lián)分析，臨床分子診斷研究，QTL定位及分子育種等大規(guī)模多位點大樣本的SNP分析。SNP在基礎研究領域發(fā)揮著巨大作用。廣州同源區(qū)段SNP分型準確度高
Hi-SNP 結合多重 PCR 技術和高通量測序技術，對需要檢測的位點設計特異性引物，在單管內(nèi)進行多重 PCR 擴增，不同的樣本以不同的 Barcode 引物區(qū)分。混合樣本后，在 Ion Proton/illumina 主流測序平臺上， 對擴增子進行高通量測序。測序結果使用生物信息學方法，區(qū)分不同的樣本，**終獲得每個位點的 SNP 信 息。高通量測序能一次對幾百萬條 DNA 分子進行序列測定，相比其他的 SNP 檢測技術，基于高通量測序的 SNP 分型具有更準確、更靈敏的特點。上海翼和生物。上海高同源區(qū)段分型高同源區(qū)段是二倍體和多倍體都存在的，由于多倍體來自染色體加倍，高同源區(qū)段在多倍體中更是普遍現(xiàn)象。
二代測序法主要通過PCR的方法，對目標SNP位點進行特異性捕獲。為了提**型的通量，目前多采用多重PCR的方法同時對多個位點進行捕獲（可同時對1-100位點進行分型）。由于二代測序通量是足夠滿足數(shù)百數(shù)千樣本的同時測序，因此需要對不同的樣本添加***的樣本標簽（Barcode），從而在后續(xù)數(shù)據(jù)分析過程中，能夠進行樣本拆分。因此在多重PCR完成***輪多SNP位點捕獲后，需要進行第二輪PCR，在***輪PCR產(chǎn)物的基礎上，添加樣本樣本標簽及測序接頭等序列。通過PCR條件優(yōu)化，目前亦可實現(xiàn)一次反應，兩輪PCR接力完成的效果。
上海翼和生物基于自主知識產(chǎn)權的多重PCR捕獲技術，結合特色的生信分析方法，開發(fā)了基于多重PCR的多倍體擴增子測序SNP分型，**提高了SNP分型的準確度。二代測序得到單分子序列信息，通過特色生信分析方法，對混合結果進行有效拆分，準確地將測序reads比對到亞基因組，拆分亞基因組同原序列，排除PSV和HSV的干擾，從而對多倍體物種進行SNP精細分型。應用方向農(nóng)口：全基因組SNP基因型分析；QTL定位及基因定位；發(fā)現(xiàn)優(yōu)良等位變異；開發(fā)功能標記；定制育種Panel；分子標記輔助選擇育種；遺傳材料前景及背景選擇；全基因組選擇；親緣關系鑒定、DNA指紋圖譜、品種鑒定；遺傳多樣性評價；群體遺傳結構分析。組成DNA的堿基雖然有4種，但SNP一般只有兩種堿基組成。
主要是指同源蛋白質(zhì)的氨基酸序列或者堿基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和堿基序列。把幾個相似的或相關的氨基酸或堿基的序列放到NCBI或者clustalw軟件中進行對比，比對出其相似的程度。相似度越高，說明序列的同源性越高。上海翼和應用生物技術有限公司是上海市遺傳學會理事單位，至今已有十六年歷史，專注于為國內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學技術服務和質(zhì)控試劑盒?；谧灾髦R產(chǎn)權的多重PCR技術，翼和生物研發(fā)和改良了適用于熒光定量PCR、一代測序和二代高通量測序平臺的多種檢測技術和產(chǎn)品，逐步形成了在細胞組織和動物模型質(zhì)控、大健康檢測和科學研究3大板塊產(chǎn)品布局。翼和生物利用自主研發(fā)的多重長片段CPR技術，結合巢式PCR技術，解決高同源區(qū)段SNP/序列分析難題。高同源區(qū)段SNP分型準確度高
SNPs是英文Single nucleotide polymorphisms的縮寫。廣州同源區(qū)段SNP分型準確度高
多倍體物種SNP分型的常用技術包括Sanger測序、SNP芯片、KASP等3種，這3種技術依賴于特異性的擴增或特異性的雜交，而多倍體物種亞基因組間高度同源，使得特異性擴增/雜交的難度**增加，這3種常用技術在無法保證特異性的前提下，得到的是混合結果，且無法對混合結果進行有效的拆分。這就導致多倍體物種SNP分型結果準確率不高。上海翼和應用生物技術有限公司是上海市遺傳學會理事單位，是上海市高新技術企業(yè)，至今已有十六年歷史，專注于為國內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學技術服務（高同源區(qū)段SNP分型）和質(zhì)控試劑盒。廣州同源區(qū)段SNP分型準確度高
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