南京分型準(zhǔn)確度高

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2021-11-12

高通量二代測(cè)序法SNP基因分型——你有我有,你沒(méi)有我也有:上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司通過(guò)自主研發(fā)的高重PCR技術(shù),擴(kuò)增引物經(jīng)修飾及優(yōu)化,克服了傳統(tǒng)多重PCR擴(kuò)增效率不均一問(wèn)題,95%以上擴(kuò)增子的測(cè)序深度在平均測(cè)序深度的0.2X范圍,保證測(cè)序通量的有效利用?;诔咧豍CR技術(shù)平臺(tái)的高通量二代SNP分型服務(wù),適用于多種遺傳學(xué)研究領(lǐng)域,如疾病與基因的關(guān)聯(lián)分析,臨床分子診斷研究,QTL定位及分子育種等大規(guī)模多位點(diǎn)大樣本的SNP分析。針對(duì)已知SNP的分型,也有很多低通量的解決方案,但是高通量的解決方案還沒(méi)有很好的方法來(lái)解決。南京分型準(zhǔn)確度高

序列的相似性和序列的同源性有一定的關(guān)系,一般來(lái)說(shuō)序列間的相似性越高的話(huà),它們是同源序列的可能性就越高,所以經(jīng)??梢酝ㄟ^(guò)序列的相似性來(lái)推測(cè)序列是否同源。正因?yàn)榇嬖谶@樣的關(guān)系,很多時(shí)候?qū)π蛄械南嗨菩院屯葱跃蜎](méi)有做很明顯的區(qū)分,造成經(jīng)常等價(jià)混用兩個(gè)名詞。所以有出現(xiàn)A序列和B序列的同源性為80%一說(shuō)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,上海市高新技術(shù)企業(yè),至今已有十六年歷史,專(zhuān)注于為國(guó)內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類(lèi)分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和質(zhì)控試劑盒。南京高同源序列SNP分型機(jī)構(gòu)SNP所表現(xiàn)的多態(tài)性只涉及到單個(gè)堿基的變異,這種變異可由單個(gè)堿基的轉(zhuǎn)換或顛換所引起。

將待檢測(cè)片段(包含待測(cè)SNP位點(diǎn))進(jìn)行PCR擴(kuò)增并直接進(jìn)行測(cè)序是SNP檢測(cè)方法中,準(zhǔn)確的一種,堪稱(chēng)SNP分型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。獲得測(cè)序峰圖,純和位點(diǎn)為單峰,而雜合位點(diǎn)則為套峰,因此通過(guò)查看測(cè)序峰圖很容易將基因型區(qū)分開(kāi)來(lái)。直接測(cè)序法不僅可用于對(duì)已知位點(diǎn)的檢測(cè),還可用于發(fā)現(xiàn)未知的SNP位點(diǎn)。直接測(cè)序法的優(yōu)點(diǎn)是結(jié)果準(zhǔn)確,能發(fā)現(xiàn)未知位點(diǎn),但是其缺點(diǎn)是通量低,成本高。因此直接測(cè)序法適用于少位點(diǎn),少樣本的分型規(guī)模,當(dāng)然土豪實(shí)驗(yàn)室除外!所以這種方法也很難在商業(yè)化大規(guī)模的分型實(shí)驗(yàn)中得到推廣。

網(wǎng)絡(luò)版本的NCBI在內(nèi)的很多網(wǎng)站都提供了在線(xiàn)的blast服務(wù),是**經(jīng)常用到的blast服務(wù)。網(wǎng)絡(luò)版本的NCBI優(yōu)點(diǎn):方便,容易操作,數(shù)據(jù)庫(kù)同步更新等優(yōu)點(diǎn)。網(wǎng)絡(luò)版本的NCBI缺點(diǎn):不利于操作大批量的數(shù)據(jù),同時(shí)也不能定義搜索的數(shù)據(jù)庫(kù)。單機(jī)版本的NCBI   通過(guò)NCBI的ftp站點(diǎn)獲得。獲得程序的同事必須取相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫(kù)才能在本地進(jìn)行BLAST分析。單機(jī)版本的NCBI優(yōu)點(diǎn):可以處理大批的數(shù)據(jù),可以自己定義數(shù)據(jù)庫(kù)。單機(jī)版本的NCBI缺點(diǎn):需要耗費(fèi)本地機(jī)的大量資源,此外操作也沒(méi)有網(wǎng)絡(luò)版直觀、方便,需要一定的計(jì)算機(jī)操作水平。理論上講,SNP既可能是二等位多態(tài)性,也可能是3個(gè)或4個(gè)等位多態(tài)性。

①所謂同源區(qū)段,就是針對(duì)一對(duì)同源染色體,兩條同源染色體上的相同位置的一個(gè)區(qū)段就是同源區(qū)段,對(duì)不對(duì)?對(duì);②然后同源區(qū)段和等位基因有什么區(qū)別聯(lián)系?同源區(qū)段可以當(dāng)做同源染色體來(lái)理解,那么上面就有等位基因;③是不是如果一個(gè)染色體沒(méi)有某個(gè)同源區(qū)段的話(huà),那就是說(shuō)他沒(méi)有該性狀等位基因?是的。翼和生物研發(fā)和改良了適用于熒光定量PCR、一代測(cè)序和二代高通量測(cè)序平臺(tái)的多種檢測(cè)技術(shù)和產(chǎn)品,逐步形成了在細(xì)胞組織和動(dòng)物模型質(zhì)控、大健康檢測(cè)和科學(xué)研究3大板塊產(chǎn)品布局。高同源區(qū)段是二倍體和多倍體都存在的,由于多倍體來(lái)自染色體加倍,高同源區(qū)段在多倍體中更是普遍現(xiàn)象。天津高同源區(qū)段SNP分型報(bào)告

目前已有多種方法可用于SNP檢測(cè),如根據(jù)動(dòng)態(tài)等位基因特異的雜交、DNA芯片以及TaqMan系統(tǒng)等。南京分型準(zhǔn)確度高

競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性PCR法——KASP(KompetitiveAlleleSpecificPCR),是英國(guó)LGC(**化學(xué)家實(shí)驗(yàn)室)公司所開(kāi)發(fā)的技術(shù),被比較常見(jiàn)用于少位點(diǎn),多樣本的SNP分型中,與TaqMan熒光探針?lè)ㄓ幸欢ㄏ嗨菩?。KASP基于引物末端堿基的特異匹配來(lái)對(duì)SNP分型以及檢測(cè)InDels(InsertionsandDeletions,插入和缺失)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,是上海市高新技術(shù)企業(yè),至今已有十六年歷史,專(zhuān)注于為國(guó)內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類(lèi)分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)(高同源區(qū)段SNP分型)和質(zhì)控試劑盒。南京分型準(zhǔn)確度高

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司位于龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號(hào)502,交通便利,環(huán)境優(yōu)美,是一家服務(wù)型企業(yè)。公司致力于為客戶(hù)提供安全、質(zhì)量有保證的良好產(chǎn)品及服務(wù),是一家私營(yíng)有限責(zé)任公司企業(yè)。公司始終堅(jiān)持客戶(hù)需求優(yōu)先的原則,致力于提供高質(zhì)量的細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù)。翼和生物以創(chuàng)造高品質(zhì)產(chǎn)品及服務(wù)的理念,打造高指標(biāo)的服務(wù),引導(dǎo)行業(yè)的發(fā)展。