SNP 全稱 Single Nucleotide Polymorphism,即單核苷酸多態(tài)性,是指在基因組上單個(gè)核苷酸的變異,包括 轉(zhuǎn)換,顛換,插入和缺失,形成的遺傳標(biāo)記,其數(shù)量很多,多態(tài)性豐富,有些 SNP 位點(diǎn)直接影響基因功 能,從而導(dǎo)致生物性狀改變。SNP 是研究人類家族和動(dòng)植物品系遺傳變異的重要依據(jù),因此被***用于群體遺傳學(xué)研究和疾病相關(guān) 基因的研究。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,是上海市高新技術(shù)企業(yè),至今已有十六年歷史,專注于為國內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)(高同源區(qū)段SNP分型)和質(zhì)控試劑盒。普通的二代測序SNP分型,利用生信分析手段剔除HSVs、PSVs,難度比較高。山東高同源區(qū)段SNP分型分析
上海翼和生物基于自主知識產(chǎn)權(quán)的多重PCR捕獲技術(shù),結(jié)合特色的生信分析方法,開發(fā)了基于多重PCR的多倍體擴(kuò)增子測序SNP分型,**提高了SNP分型的準(zhǔn)確度。二代測序得到單分子序列信息,通過特色生信分析方法,對混合結(jié)果進(jìn)行有效拆分,準(zhǔn)確地將測序reads比對到亞基因組,拆分亞基因組同原序列,排除PSV和HSV的干擾,從而對多倍體物種進(jìn)行SNP精細(xì)分型。應(yīng)用方向農(nóng)口:全基因組SNP基因型分析;QTL定位及基因定位;發(fā)現(xiàn)優(yōu)良等位變異;開發(fā)功能標(biāo)記;定制育種Panel;分子標(biāo)記輔助選擇育種;遺傳材料前景及背景選擇;全基因組選擇;親緣關(guān)系鑒定、DNA指紋圖譜、品種鑒定;遺傳多樣性評價(jià);群體遺傳結(jié)構(gòu)分析。山東高同源區(qū)段SNP分型分析利用長片段PCR擴(kuò)增獲得特異性片段后,可以采用一代測序、等位基因特異性PCR、CAPs等方法進(jìn)行SNP分型。
Hi-SNP 結(jié)合多重 PCR 技術(shù)和高通量測序技術(shù),對需要檢測的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物,在單管內(nèi)進(jìn)行多重 PCR 擴(kuò)增,不同的樣本以不同的 Barcode 引物區(qū)分。混合樣本后,在 Ion Proton/illumina 主流測序平臺(tái)上, 對擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測序。測序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法,區(qū)分不同的樣本,**終獲得每個(gè)位點(diǎn)的 SNP 信 息。高通量測序能一次對幾百萬條 DNA 分子進(jìn)行序列測定,相比其他的 SNP 檢測技術(shù),基于高通量測序的 SNP 分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點(diǎn)。上海翼和生物。
RFLP法的優(yōu)點(diǎn)是分型技術(shù)簡單,結(jié)果判斷容易,不需要昂貴的設(shè)備,成本低,并且實(shí)驗(yàn)人員培訓(xùn)簡單。但是通過SNP能夠?qū)е翿FLP的概率低,很多SNP位點(diǎn)不能采用這種方法進(jìn)行檢測,而且有的限制性酶價(jià)格昂貴并且不容易買到。通常酶切的條件較高,容易出現(xiàn)假陽性結(jié)果,且工作量大,耗時(shí)長,通量低。這是早期的一種SNP分型技術(shù),在通量和效率上難以滿足批量分型需求,因此這種技術(shù)目前只在個(gè)別實(shí)驗(yàn)室中還在使用中。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司在精細(xì)定位、分子育種過程中遇到高同源區(qū)段SNP,并且無法舍棄時(shí),翼和生物提供特色的解決方案,歡迎來撩!
多倍體物種SNP分型的常用技術(shù)包括Sanger測序、SNP芯片、KASP等3種,這3種技術(shù)依賴于特異性的擴(kuò)增或特異性的雜交,而多倍體物種亞基因組間高度同源,使得特異性擴(kuò)增/雜交的難度**增加,這3種常用技術(shù)在無法保證特異性的前提下,得到的是混合結(jié)果,且無法對混合結(jié)果進(jìn)行有效的拆分。這就導(dǎo)致多倍體物種SNP分型結(jié)果準(zhǔn)確率不高。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,是上海市高新技術(shù)企業(yè),至今已有十六年歷史,專注于為國內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)(高同源區(qū)段SNP分型)和質(zhì)控試劑盒。SNPs是英文Single nucleotide polymorphisms的縮寫。山東高同源分型
翼和生物推出了多重長PCR捕獲建庫的方案,有效解決了高同源區(qū)段SNP/序列分析的難題。山東高同源區(qū)段SNP分型分析
多倍體是指含有3套或3套以上完整染色體組的生物體。很多重要的農(nóng)作物和動(dòng)物都是多倍體,例如:小麥、油菜、棉花、花生、***、甘蔗、家蠶、蠑螈、果蠅、蛙等。多倍體物種基因組復(fù)雜,給遺傳學(xué)研究帶來了很大挑戰(zhàn)。在SNP分型、目標(biāo)區(qū)間重測序和分子克隆等過程中,特異性擴(kuò)增的難度增大,非特異性擴(kuò)增容易擴(kuò)增出多個(gè)亞基因組間的同源區(qū)段。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,是上海市高新技術(shù)企業(yè),至今已有十六年歷史。山東高同源區(qū)段SNP分型分析
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是一家第三方檢測服務(wù);生物專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù);健康衰老評估;大健康檢測;遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù);生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測技術(shù)技術(shù)服務(wù);小鼠遺傳品系鑒定;轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定;細(xì)胞點(diǎn)突變檢測;細(xì)胞端粒長度和端粒酶活性檢測。的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實(shí)、誠實(shí)可信的企業(yè)。翼和生物擁有一支經(jīng)驗(yàn)豐富、技術(shù)創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團(tuán)隊(duì),以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務(wù)。翼和生物不斷開拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺(tái),以應(yīng)用為重點(diǎn),以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價(jià)值,提供更優(yōu)服務(wù)。翼和生物始終關(guān)注自身,在風(fēng)云變化的時(shí)代,對自身的建設(shè)毫不懈怠,高度的專注與執(zhí)著使翼和生物在行業(yè)的從容而自信。