天津SNP分型準(zhǔn)確度高

來源: 發(fā)布時間:2021-10-29

SNP基因分型技術(shù)原理是PCR擴增含有SNP的基因組片段,主要特點是準(zhǔn)確性高、靈活性強、通量大,主要方法是TaqMan探針法。首先通過PCR擴增含有SNP的基因組片段,然后通過序列特異性引物實現(xiàn)單堿基延伸,隨后樣品分析物與芯片基質(zhì)共結(jié)晶后在真空管中受瞬時納秒 (10-9s) 強激光激發(fā)。核酸分子因此解吸附成為單電荷離子,由于電場中離子飛行時間與離子質(zhì)量成反比,通過檢測核酸分子在真空管中的飛行時間而獲得樣品分析物的精確分子量,從而檢測出SNP位點信息。理論上講,SNP既可能是二等位多態(tài)性,也可能是3個或4個等位多態(tài)性。天津SNP分型準(zhǔn)確度高

多序列比對的意義:用于描述一組序列之間的相似性關(guān)系,以便了解一個基因家族的基本特征,尋找motif,保守區(qū)域等。用于描述一個同源基因之間的親緣關(guān)系的遠(yuǎn)景,應(yīng)用到分子進(jìn)化分析中。多序列比對的方法:同源性分析中常常要通過多序列比對來找出序列之間的相互關(guān)系,和blast的局部匹配搜索不同,多序列比對大多都是采用全局比對的算法。這樣對于采用計算機程序的自動多序列比對是一個非常復(fù)雜且耗時的過程,特別是序列數(shù)目多,且序列唱的情況下。山東分型技術(shù)服務(wù)翼和生物自主研發(fā)多重長片段巢式PCR技術(shù),解決高同源區(qū)段SNP分型難題。

上海翼和生物根據(jù)具體實驗規(guī)模,提供兩種檢測平臺,分別為:適合中低通量檢測的PCR-LDR分型服務(wù)和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務(wù)。PCR-LDR SNP分型服務(wù):PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(Ligase Detection Reaction,連接酶檢測反應(yīng))想結(jié)合的檢測技術(shù)。LDR是利用高溫連接酶實現(xiàn)對基因多態(tài)性位點的識別。高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補的兩條寡聚核苷酸接頭對應(yīng)處存在著基因點突變類型的堿基錯配,則連接反應(yīng)就不能進(jìn)行,反之則可以進(jìn)行連接反應(yīng)。Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測序技術(shù),對需要檢測的位點設(shè)計特異性引物,在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴增,不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分?;旌蠘颖竞螅趇llumina 等主流測序平臺上,對擴增子進(jìn)行高通量測序。測序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法,區(qū)分不同的樣本,,終獲得每個位點的SNP信息。高通量測序能一次對幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定,相比其他的SNP檢測技術(shù),基于高通量測序的SNP分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點。

相信大家都聽過或已經(jīng)接觸過一些常用的分型方法,如片段長度多態(tài)性(限制性內(nèi)切酶)法,直接測序法,Taqman熒光探針法,LDR連接酶檢測反應(yīng)法,競爭性等位基因特異性PCR法(KASP),二代測序法等,小E就針對以上幾種常用分型方法為大家做一個介紹和總結(jié)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限上海翼和**團(tuán)隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。在經(jīng)濟作物育種領(lǐng)域,檢測SNP可實現(xiàn)對所需性狀的早期選擇。

上海翼和生物基于自主知識產(chǎn)權(quán)的多重PCR捕獲技術(shù),結(jié)合特色的生信分析方法,開發(fā)了基于多重PCR的多倍體擴增子測序SNP分型,**提高了SNP分型的準(zhǔn)確度。二代測序得到單分子序列信息,通過特色生信分析方法,對混合結(jié)果進(jìn)行有效拆分,準(zhǔn)確地將測序reads比對到亞基因組,拆分亞基因組同原序列,排除PSV和HSV的干擾,從而對多倍體物種進(jìn)行SNP精細(xì)分型。應(yīng)用方向農(nóng)口:全基因組SNP基因型分析;QTL定位及基因定位;發(fā)現(xiàn)優(yōu)良等位變異;開發(fā)功能標(biāo)記;定制育種Panel;分子標(biāo)記輔助選擇育種;遺傳材料前景及背景選擇;全基因組選擇;親緣關(guān)系鑒定、DNA指紋圖譜、品種鑒定;遺傳多樣性評價;群體遺傳結(jié)構(gòu)分析。在精細(xì)定位、分子育種過程中遇到高同源區(qū)段SNP,并且無法舍棄時,翼和生物提供特色的解決方案,歡迎來撩!高同源序列SNP分型哪個公司做

多重PCR是降低長片段PCR擴增成本的有效方式。天津SNP分型準(zhǔn)確度高

隨著二代測序技術(shù)的普及,相比Sanger測序,二代測序雖然降低了測序讀長,但是**增加的測序通量同時大幅降低測序成本。利用二代測序進(jìn)行SNP分型,不僅測序讀長滿足分型需求,并且可以同時對數(shù)十?dāng)?shù)百個位點,上千樣本進(jìn)行分型。二代測序結(jié)果判斷準(zhǔn)確直觀,相比RFLP,Taqman,LDR等方法都通過間接結(jié)果來進(jìn)行分型結(jié)果的判定,直接測序或二代測序法分型能都直接看到位點具體序列情況,SNP位點判斷更加直觀。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會理事單位,是上海市****,至今已有十六年歷史。天津SNP分型準(zhǔn)確度高

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司總部位于龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號502,是一家第三方檢測服務(wù);生物專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù);健康衰老評估;大健康檢測;遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù);生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測技術(shù)技術(shù)服務(wù);小鼠遺傳品系鑒定;轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定;細(xì)胞點突變檢測;細(xì)胞端粒長度和端粒酶活性檢測。的公司。翼和生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶的需求為向?qū)В瑸榭蛻籼峁?**的細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務(wù)。翼和生物繼續(xù)堅定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,既要實現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長,又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,實現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。翼和生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場,以敏銳的市場洞察力,實現(xiàn)與客戶的成長共贏。