高通量二代測序法SNP基因分型——你有我有,你沒有我也有:上海翼和應用生物技術(shù)有限公司通過自主研發(fā)的高重PCR技術(shù),擴增引物經(jīng)修飾及優(yōu)化,克服了傳統(tǒng)多重PCR擴增效率不均一問題,95%以上擴增子的測序深度在平均測序深度的0.2X范圍,保證測序通量的有效利用?;诔咧豍CR技術(shù)平臺的高通量二代SNP分型服務,適用于多種遺傳學研究領(lǐng)域,如疾病與基因的關(guān)聯(lián)分析,臨床分子診斷研究,QTL定位及分子育種等大規(guī)模多位點大樣本的SNP分析。高同源序列帶來的直接挑戰(zhàn):同源序列的干擾,無法利用簡單PCR技術(shù)或者探針雜交捕獲技術(shù),將目標區(qū)段富集。河南高同源序列SNP分型技術(shù)服務
主要是指同源蛋白質(zhì)的氨基酸序列或者堿基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和堿基序列。把幾個相似的或相關(guān)的氨基酸或堿基的序列放到NCBI或者clustalw軟件中進行對比,比對出其相似的程度。相似度越高,說明序列的同源性越高。上海翼和應用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學會理事單位,至今已有十六年歷史,專注于為國內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學技術(shù)服務和質(zhì)控試劑盒?;谧灾髦R產(chǎn)權(quán)的多重PCR技術(shù),翼和生物研發(fā)和改良了適用于熒光定量PCR、一代測序和二代高通量測序平臺的多種檢測技術(shù)和產(chǎn)品,逐步形成了在細胞組織和動物模型質(zhì)控、大健康檢測和科學研究3大板塊產(chǎn)品布局。河南分型翼和生物推出了多重長PCR捕獲建庫的方案,有效解決了高同源區(qū)段SNP/序列分析的難題。
相信大家都聽過或已經(jīng)接觸過一些常用的分型方法,如片段長度多態(tài)性(限制性內(nèi)切酶)法,直接測序法,Taqman熒光探針法,LDR連接酶檢測反應法,競爭性等位基因特異性PCR法(KASP),二代測序法等,小E就針對以上幾種常用分型方法為大家做一個介紹和總結(jié)。上海翼和應用生物技術(shù)有限上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學技術(shù)服務和產(chǎn)品。
將待檢測片段(包含待測SNP位點)進行PCR擴增并直接進行測序是SNP檢測方法中,準確的一種,堪稱SNP分型的“金標準”。獲得測序峰圖,純和位點為單峰,而雜合位點則為套峰,因此通過查看測序峰圖很容易將基因型區(qū)分開來。直接測序法不僅可用于對已知位點的檢測,還可用于發(fā)現(xiàn)未知的SNP位點。直接測序法的優(yōu)點是結(jié)果準確,能發(fā)現(xiàn)未知位點,但是其缺點是通量低,成本高。因此直接測序法適用于少位點,少樣本的分型規(guī)模,當然土豪實驗室除外!所以這種方法也很難在商業(yè)化大規(guī)模的分型實驗中得到推廣。通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。
BLAST是一個機遇序列相似性的數(shù)據(jù)庫搜索程序。是“局部相似性基本查詢工具”(BasicLocalAlignmentSearchTool)的縮寫。Blast是一個序列相似性搜索的程序包,其中包含了很多**的程序,這些程序是根據(jù)查詢對象和數(shù)據(jù)庫的不同來定義的。上海翼和應用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學會理事單位,是上海市高新技術(shù)企業(yè),至今已有十六年歷史,專注于為國內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學技術(shù)服務(高同源區(qū)段SNP分型)和質(zhì)控試劑盒。多重PCR是降低長片段PCR擴增成本的有效方式。河南SNP基因分型技術(shù)服務
在經(jīng)濟作物育種領(lǐng)域,檢測SNP可實現(xiàn)對所需性狀的早期選擇。河南高同源序列SNP分型技術(shù)服務
理論上講,SNP既可能是二等位多態(tài)性,也可能是3個或4個等位多態(tài)性,但實際上,后兩者非常少見,幾乎可以忽略。通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換(C T,在其互補鏈上則為GA),也可能是顛換(CA,GT,CG,AT)。轉(zhuǎn)換的發(fā)生率總是明顯高于其它幾種變異,具有轉(zhuǎn)換型變異的SNP約占2/3。上海翼和應用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學會理事單位,是上海市高新技術(shù)企業(yè),至今已有十六年歷史,專注于為國內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學技術(shù)服務(高同源區(qū)段SNP分型)和質(zhì)控試劑盒。河南高同源序列SNP分型技術(shù)服務
上海翼和應用生物技術(shù)有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家服務型的公司。公司自成立以來,以質(zhì)量為發(fā)展,讓匠心彌散在每個細節(jié),公司旗下細胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務深受客戶的喜愛。公司秉持誠信為本的經(jīng)營理念,在醫(yī)藥健康深耕多年,以技術(shù)為先導,以自主產(chǎn)品為重點,發(fā)揮人才優(yōu)勢,打造醫(yī)藥健康良好品牌。翼和生物秉承“客戶為尊、服務為榮、創(chuàng)意為先、技術(shù)為實”的經(jīng)營理念,全力打造公司的重點競爭力。