上海分型分析

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-02-15

隨著二代測序技術(shù)的普及,相比Sanger測序,以降低測序讀長的前提,**增加的測序通量同時(shí)大幅降低測序成本。利用二代測序進(jìn)行SNP分型,不僅測序讀長滿足分型需求,可以同時(shí)對數(shù)十?dāng)?shù)百個(gè)位點(diǎn),上千樣本進(jìn)行分型。該方法相比直接測序法,除了保留測序法的優(yōu)點(diǎn)外,彌補(bǔ)了其通量不足的限制,二代測序分型法也正在快速在領(lǐng)域內(nèi)推廣。上海翼和生物提供高同源SNP分型服務(wù),無錫分公司(無錫翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司)地址:無錫市濱湖區(qū)梅梁西路138號(hào)七號(hào)樓一樓。翼和生物利用自主研發(fā)的多重長片段CPR技術(shù),結(jié)合巢式PCR技術(shù),解決高同源區(qū)段SNP/序列分析難題。上海分型分析

Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測序技術(shù),對需要檢測的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物,在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分。混合樣本后,在Ion Proton/Ion Torrent平臺(tái)上,對擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測序。測序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法,區(qū)分不同的樣本,,終獲得每個(gè)位點(diǎn)的SNP信息。高通量測序能一次對幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定,相比其他的SNP檢測技術(shù),基于高通量測序的SNP分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點(diǎn)。上海翼和生物提供高同源區(qū)段SNP分型服務(wù)。


山東高同源區(qū)段分型送樣要求.多重長片段PCR擴(kuò)增特異性序列,其產(chǎn)物可以作為后續(xù)SNP分型的模板。

所謂同源序列,簡單地說,是指從某一共同祖先經(jīng)趨異進(jìn)化而形成的不同序列。必須指出,相似性(similarity)和同源性(homology)是兩個(gè)完全不同的概念。相似性是指序列比對過程中用來描述檢測序列和目標(biāo)序列之間香通DNA堿基或氨基酸殘基順序所占比例的高低。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,至今已有十六年歷史,專注于為國內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和質(zhì)控試劑盒?;谧灾髦R(shí)產(chǎn)權(quán)的多重PCR技術(shù),翼和生物研發(fā)和改良了適用于熒光定量PCR、一代測序和二代高通量測序平臺(tái)的多種檢測技術(shù)和產(chǎn)品,逐步形成了在細(xì)胞組織和動(dòng)物模型質(zhì)控、大健康檢測和科學(xué)研究3大板塊產(chǎn)品布局。

片段長度多態(tài)性(限制性內(nèi)切酶)法——RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)法的基本原理是通過PCR擴(kuò)增目的片段DNA,擴(kuò)增產(chǎn)物再用特異性內(nèi)切酶酶切成不同大小的片段,直接通過凝膠電泳分辨基因型。不同等位基因的限制性酶切位點(diǎn)分布不同,產(chǎn)生不同長度的DNA*段條帶。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。微信公眾號(hào):上海翼和生物遺傳分析時(shí)經(jīng)常遇到高同源序列分析的挑戰(zhàn),比如存在假基因,同源基因,在多倍體物種中更為普遍。

多倍體物種SNP分型的常用技術(shù)包括Sanger測序、SNP芯片、KASP等3種,這3種技術(shù)依賴于特異性的擴(kuò)增或特異性的雜交,而多倍體物種亞基因組間高度同源,使得特異性擴(kuò)增/雜交的難度**增加,這3種常用技術(shù)在無法保證特異性的前提下,得到的是混合結(jié)果,且無法對混合結(jié)果進(jìn)行有效的拆分。這就導(dǎo)致多倍體物種SNP分型結(jié)果準(zhǔn)確率不高。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,是上海市****,至今已有十六年歷史,專注于為國內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)(高同源區(qū)段SNP分型)和質(zhì)控試劑盒。.高同源區(qū)段在多倍體物種中,又細(xì)分為橫向同源和部分同源。河南高同源序列SNP分型

多重長片段PCR技術(shù),結(jié)合了長片段PCR和多重PCR的優(yōu)勢,是解決多個(gè)高同源區(qū)段SNP分型分析的有效手段。上海分型分析

連接酶檢測反應(yīng)(LigaseDetectionReaction,LDR)是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對基因多態(tài)性位點(diǎn)的識(shí)別,高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類型的堿基錯(cuò)配,連接反應(yīng)就不能進(jìn)行。該方法,對SNP位點(diǎn)同時(shí)設(shè)計(jì)兩條有長度差異的探針,當(dāng)探針末端與模板有一個(gè)堿基不配對,所以連接反應(yīng)不能進(jìn)行,沒有連接產(chǎn)物;相反,若探針與模板DNA完全互補(bǔ),故進(jìn)行連接反應(yīng),通過溫控循環(huán),該特異性連接反應(yīng)可反復(fù)進(jìn)行,達(dá)到線性擴(kuò)增的效果。,后通過熒光掃描片段長度,實(shí)現(xiàn)對SNP位點(diǎn)的檢測。上海分型分析

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是一家第三方檢測服務(wù);生物專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù);健康衰老評估;大健康檢測;遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù);生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測技術(shù)技術(shù)服務(wù);小鼠遺傳品系鑒定;轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定;細(xì)胞點(diǎn)突變檢測;細(xì)胞端粒長度和端粒酶活性檢測。的公司,是一家集研發(fā)、設(shè)計(jì)、生產(chǎn)和銷售為一體的專業(yè)化公司。翼和生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶的需求為向?qū)?,為客戶提?**的細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務(wù)。翼和生物繼續(xù)堅(jiān)定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,既要實(shí)現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長,又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。翼和生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康行業(yè)。滿足市場需求,提高產(chǎn)品價(jià)值,是我們前行的力量。