基因的直系同源、旁系同源或異源同源關(guān)系[1]。祖先物種通過兩次物種分化形成ABC三個(gè)物種；伴隨物種分化而進(jìn)行的兩次基因重復(fù)共形成A1、B1、B2、C1、C2、C3等6個(gè)基因。顯然，C2與C3互為直系同源；B1與C1互為旁系同源；AB1與其他6個(gè)基因互為異源同源。然而，B1和B2、B2和C1又是什么關(guān)系呢?在這個(gè)問題上曾引起爭議。B1和B2、B2和C1的分離是由于***次基因重復(fù)而產(chǎn)生的，套用定義，可得出B1和B2、B2和C1互為旁系同源。同理，B1和C2/C3、C1和C2/C3也互為旁系同源。類似的，根據(jù)直系同源基因的定義，B2和C2/C3、A1和所有B基因及C基因互為直系同源。SNP分型遇到高同源區(qū)段怎么辦？翼和生物自主研發(fā)多重長片段巢式PCR技術(shù)，解決高同源區(qū)段SNP分型難題。上海高同源序列SNP分型分析
連接酶檢測反應(yīng)(LigaseDetectionReaction，LDR)是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對(duì)基因多態(tài)性位點(diǎn)的識(shí)別，高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對(duì)應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類型的堿基錯(cuò)配，連接反應(yīng)就不能進(jìn)行。該方法，對(duì)SNP位點(diǎn)同時(shí)設(shè)計(jì)兩條有長度差異的探針，當(dāng)探針末端與模板有一個(gè)堿基不配對(duì)，所以連接反應(yīng)不能進(jìn)行，沒有連接產(chǎn)物；相反，若探針與模板DNA完全互補(bǔ)，故進(jìn)行連接反應(yīng)，通過溫控循環(huán)，該特異性連接反應(yīng)可反復(fù)進(jìn)行，達(dá)到線性擴(kuò)增的效果。，后通過熒光掃描片段長度，實(shí)現(xiàn)對(duì)SNP位點(diǎn)的檢測。上海高同源序列SNP分型分析翼和生物推出了多重長PCR捕獲建庫的方案，有效解決了高同源區(qū)段SNP/序列分析的難題。
上海翼和生物基于自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的多重PCR捕獲技術(shù)，結(jié)合特色的生信分析方法，開發(fā)了基于多重PCR的多倍體擴(kuò)增子測序SNP分型，**提高了SNP分型的準(zhǔn)確度。二代測序得到單分子序列信息，通過特色生信分析方法，對(duì)混合結(jié)果進(jìn)行有效拆分，準(zhǔn)確地將測序reads比對(duì)到亞基因組，拆分亞基因組同原序列，排除PSV和HSV的干擾，從而對(duì)多倍體物種進(jìn)行SNP精細(xì)分型。應(yīng)用方向農(nóng)口：全基因組SNP基因型分析；QTL定位及基因定位；發(fā)現(xiàn)優(yōu)良等位變異；開發(fā)功能標(biāo)記；定制育種Panel；分子標(biāo)記輔助選擇育種；遺傳材料前景及背景選擇；全基因組選擇；親緣關(guān)系鑒定、DNA指紋圖譜、品種鑒定；遺傳多樣性評(píng)價(jià)；群體遺傳結(jié)構(gòu)分析。
1. SNP數(shù)量多，分布比較常見。據(jù)估計(jì)，人類基因組中每1000個(gè)核苷酸就有一個(gè)SNP，人類30億堿基***有300萬以上的SNPs.SNP 遍布于整個(gè)人類基因組中，根據(jù)SNP在基因中的位置，可分為基因編碼區(qū)SNPs（Coding-region SNPs，cSNPs）、基因周邊SNPs（Perigenic SNPs，pSNPs）以及基因間SNPs（Intergenic SNPs，iSNPs）等三類。2、 SNP適于快速、規(guī)?；Y查。組成DNA的堿基雖然有4種，但SNP一般只有兩種堿基組成，所以它是一種二態(tài)的標(biāo)記，即二等位基因（biallelic）。 由于SNP的二態(tài)性，非此即彼，在基因組篩選中SNPs往往只需+/-的分析，而不用分析片段的長度，這就利于發(fā)展自動(dòng)化技術(shù)篩選或檢測SNPs.3、SNP等位基因頻率的容易估計(jì)。采用混和樣本估算等位基因的頻率是種高效快速的策略。該策略的原理是：首先選擇參考樣本制作標(biāo)準(zhǔn)曲線，然后將待測的混和樣本與標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行比較，根據(jù)所得信號(hào)的比例確定混和樣本中各種等位基因的頻率。4、易于基因分型。SNPs的二態(tài)性，也有利于對(duì)其進(jìn)行基因分型。二代測序SNP分型，針對(duì)同源片段數(shù)量比較少的區(qū)段，PCR擴(kuò)增后建庫時(shí)，隨機(jī)抽樣抽到目的片段的概率比較高。
主要是指同源蛋白質(zhì)的氨基酸序列或者堿基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和堿基序列。把幾個(gè)相似的或相關(guān)的氨基酸或堿基的序列放到NCBI或者clustalw軟件中進(jìn)行對(duì)比，比對(duì)出其相似的程度。相似度越高，說明序列的同源性越高。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位，至今已有十六年歷史，專注于為國內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和質(zhì)控試劑盒。基于自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的多重PCR技術(shù)，翼和生物研發(fā)和改良了適用于熒光定量PCR、一代測序和二代高通量測序平臺(tái)的多種檢測技術(shù)和產(chǎn)品，逐步形成了在細(xì)胞組織和動(dòng)物模型質(zhì)控、大健康檢測和科學(xué)研究3大板塊產(chǎn)品布局。由于SNP的二態(tài)性，非此即彼，在基因組篩選中SNPs往往只需+/-的分析這就利于發(fā)展自動(dòng)化技術(shù)篩選或檢測SNPs.江蘇高同源序列分型機(jī)構(gòu)
在進(jìn)行基因組研究中經(jīng)常會(huì)遇到各類高同源區(qū)段，比如人基因組中P450基因家族，HLA基因座位。上海高同源序列SNP分型分析
RFLP法的優(yōu)點(diǎn)是分型技術(shù)簡單，結(jié)果判斷容易，不需要昂貴的設(shè)備，成本低，并且實(shí)驗(yàn)人員培訓(xùn)簡單。但是通過SNP能夠?qū)е翿FLP的概率低，很多SNP位點(diǎn)不能采用這種方法進(jìn)行檢測，而且有的限制性酶價(jià)格昂貴并且不容易買到。通常酶切的條件較高，容易出現(xiàn)假陽性結(jié)果，且工作量大，耗時(shí)長，通量低。這是早期的一種SNP分型技術(shù)，在通量和效率上難以滿足批量分型需求，因此這種技術(shù)目前只在個(gè)別實(shí)驗(yàn)室中還在使用中。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司上海高同源序列SNP分型分析
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司總部位于龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號(hào)502，是一家第三方檢測服務(wù)；生物專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù)；健康衰老評(píng)估；大健康檢測；遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)；生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測技術(shù)技術(shù)服務(wù)；小鼠遺傳品系鑒定；轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定；細(xì)胞點(diǎn)突變檢測；細(xì)胞端粒長度和端粒酶活性檢測。的公司。公司自創(chuàng)立以來，投身于細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控，大健康檢測，生物技術(shù)服務(wù)，是醫(yī)藥健康的主力軍。翼和生物始終以本分踏實(shí)的精神和必勝的信念，影響并帶動(dòng)團(tuán)隊(duì)取得成功。翼和生物始終關(guān)注自身，在風(fēng)云變化的時(shí)代，對(duì)自身的建設(shè)毫不懈怠，高度的專注與執(zhí)著使翼和生物在行業(yè)的從容而自信。