廣州同源區(qū)段SNP分型準確度高

來源: 發(fā)布時間:2022-02-09

LDR連接酶檢測法優(yōu)點是適用于任何多態(tài)性位點,基于雜交反應和連接反應,分型結(jié)果準確,可進行多重反應,性價比較高,且實驗靈活。但是相比TaqMan和直接測序法的單一位點檢測而言,LDR法可以實現(xiàn)多位點的同時檢測,提高檢測通量,因此前期需要一定時間構(gòu)建多重分型方案。因此該方法非常適合相同分型方案,連續(xù)樣本的分型需求,提高實驗通量的同時降低分型單價。上海翼和應用生物技術有限公司總部在上海,2011年無錫成立分公司無錫翼和應用生物技術有限公司根據(jù)高同源區(qū)段位點數(shù)量,提供多重長片段巢式PCR-LDR SNP分型和多重長片段巢式PCR-NGS SNP分型兩種解決方案。廣州同源區(qū)段SNP分型準確度高

連接酶檢測反應(LigaseDetectionReaction,LDR)是利用高溫連接酶實現(xiàn)對基因多態(tài)性位點的識別,高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補的兩條寡聚核苷酸接頭對應處存在著基因點突變類型的堿基錯配,連接反應就不能進行。該方法,對SNP位點同時設計兩條有長度差異的探針,當探針末端與模板有一個堿基不配對,所以連接反應不能進行,沒有連接產(chǎn)物;相反,若探針與模板DNA完全互補,故進行連接反應,通過溫控循環(huán),該特異性連接反應可反復進行,達到線性擴增的效果。,后通過熒光掃描片段長度,實現(xiàn)對SNP位點的檢測。安徽高同源序列SNP分型送樣要求SNP是人類可遺傳的變異中比較常見的一種。占所有已知多態(tài)性的90%以上。

常見的SNP既可以出現(xiàn)在基因編碼區(qū),也可以出現(xiàn)在非編碼區(qū),雖然發(fā)生在編碼區(qū)的概率相對較小,但會影響基因的功能,導致生物性狀改變,在遺傳性疾病的研究中具有非常重要的意義。SNP作為第三代遺傳標記,其分布密度高,遍布于整個動物和人類基因組中;與功能基因具有高度關聯(lián)性;突變率低,遺傳穩(wěn)定性強;檢測通量高便于自動化分析。某些SNP位點并不直接與疾病基因的表達相關聯(lián),但因為它與某些致病基因相鄰,所以成為重要的遺傳標記。

為了獲得更多糖原相關SNP位點,作者選擇了包括Cg_GD1基因在內(nèi)的5個基因,64個個體(32個高糖原個體和32個低糖原個體)進行重測序,,后得到732個高質(zhì)量SNP。其中32個位于Cg_GD2基因,256個位于Cg_GS基因,用于后續(xù)的關聯(lián)分析。結(jié)果顯示有兩個SNP與糖原含量有關。分別是位于Cg_GD1基因第15個內(nèi)含子的SNP(Cg_SNP_3021(R(A/G))),和位于Cg_GD1基因的SNP(Cg_SNP_3021)。上海翼和應用生物技術有限公司是上海市遺傳學會理事單位,是上海市高新技術企業(yè),至今已有十六年歷史。傳統(tǒng)的SNP檢測方法是采用一些已有的成熟技術,如DNA測序、等位基因特異的寡聚核苷酸雜交(ASO)等。

TaqMan熒光探針法優(yōu)點是操作簡單,準確性高(閉管進行,減少污染),判讀也很方便,認可度高;適合多樣本,少位點。但是其也有不可忽視的限制性,如探針合成耗時較長,價格昂貴,為了保證探針的穩(wěn)定質(zhì)量,一般大家會選擇A公司合成。TaqMan熒光探針法一般為只有幾個位點時適用,并且對樣本的質(zhì)量要求較高,除了樣本無降解外,要需要濃度盡可能的一致。上海翼和應用生物技術有限公司,地址:上海市松江區(qū)龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號502翼和生物推出了多重長PCR捕獲建庫的方案,有效解決了高同源區(qū)段SNP/序列分析的難題。江蘇高同源序列分型報告

高同源序列帶來的直接挑戰(zhàn):同源序列的干擾,無法利用簡單PCR技術或者探針雜交捕獲技術,將目標區(qū)段富集。廣州同源區(qū)段SNP分型準確度高

主要是指同源蛋白質(zhì)的氨基酸序列或者堿基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和堿基序列。把幾個相似的或相關的氨基酸或堿基的序列放到NCBI或者clustalw軟件中進行對比,比對出其相似的程度。相似度越高,說明序列的同源性越高。上海翼和應用生物技術有限公司是上海市遺傳學會理事單位,至今已有十六年歷史,專注于為國內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學技術服務和質(zhì)控試劑盒?;谧灾髦R產(chǎn)權(quán)的多重PCR技術,翼和生物研發(fā)和改良了適用于熒光定量PCR、一代測序和二代高通量測序平臺的多種檢測技術和產(chǎn)品,逐步形成了在細胞組織和動物模型質(zhì)控、大健康檢測和科學研究3大板塊產(chǎn)品布局。廣州同源區(qū)段SNP分型準確度高

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