高同源SNP分型

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-02-09

高通量二代測(cè)序法SNP基因分型——你有我有,你沒有我也有:上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司通過(guò)自主研發(fā)的高重PCR技術(shù),擴(kuò)增引物經(jīng)修飾及優(yōu)化,克服了傳統(tǒng)多重PCR擴(kuò)增效率不均一問(wèn)題,95%以上擴(kuò)增子的測(cè)序深度在平均測(cè)序深度的0.2X范圍,保證測(cè)序通量的有效利用?;诔咧豍CR技術(shù)平臺(tái)的高通量二代SNP分型服務(wù),適用于多種遺傳學(xué)研究領(lǐng)域,如疾病與基因的關(guān)聯(lián)分析,臨床分子診斷研究,QTL定位及分子育種等大規(guī)模多位點(diǎn)大樣本的SNP分析。在植物基因組研究中,大量的多倍體植物基因組中同樣存在大量的高同源序列。高同源SNP分型

連接酶檢測(cè)反應(yīng)(LigaseDetectionReaction,LDR)是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對(duì)基因多態(tài)性位點(diǎn)的識(shí)別,高溫連接酶一旦檢測(cè)到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對(duì)應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類型的堿基錯(cuò)配,連接反應(yīng)就不能進(jìn)行。該方法,對(duì)SNP位點(diǎn)同時(shí)設(shè)計(jì)兩條有長(zhǎng)度差異的探針,當(dāng)探針末端與模板有一個(gè)堿基不配對(duì),所以連接反應(yīng)不能進(jìn)行,沒有連接產(chǎn)物;相反,若探針與模板DNA完全互補(bǔ),故進(jìn)行連接反應(yīng),通過(guò)溫控循環(huán),該特異性連接反應(yīng)可反復(fù)進(jìn)行,達(dá)到線性擴(kuò)增的效果。,后通過(guò)熒光掃描片段長(zhǎng)度,實(shí)現(xiàn)對(duì)SNP位點(diǎn)的檢測(cè)。江蘇同源SNP分型技術(shù)服務(wù)通常所說(shuō)的SNP都是二等位多態(tài)性的。

主要是指同源蛋白質(zhì)的氨基酸序列或者堿基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和堿基序列。把幾個(gè)相似的或相關(guān)的氨基酸或堿基的序列放到NCBI或者clustalw軟件中進(jìn)行對(duì)比,比對(duì)出其相似的程度。相似度越高,說(shuō)明序列的同源性越高。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,至今已有十六年歷史,專注于為國(guó)內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和質(zhì)控試劑盒?;谧灾髦R(shí)產(chǎn)權(quán)的多重PCR技術(shù),翼和生物研發(fā)和改良了適用于熒光定量PCR、一代測(cè)序和二代高通量測(cè)序平臺(tái)的多種檢測(cè)技術(shù)和產(chǎn)品,逐步形成了在細(xì)胞組織和動(dòng)物模型質(zhì)控、大健康檢測(cè)和科學(xué)研究3大板塊產(chǎn)品布局。

二代測(cè)序法主要通過(guò)PCR的方法,對(duì)目標(biāo)SNP位點(diǎn)進(jìn)行特異性捕獲。為了提**型的通量,目前多采用多重PCR的方法同時(shí)對(duì)多個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行捕獲(可同時(shí)對(duì)1-100位點(diǎn)進(jìn)行分型)。由于二代測(cè)序通量是足夠滿足數(shù)百數(shù)千樣本的同時(shí)測(cè)序,因此需要對(duì)不同的樣本添加***的樣本標(biāo)簽(Barcode),從而在后續(xù)數(shù)據(jù)分析過(guò)程中,能夠進(jìn)行樣本拆分。因此在多重PCR完成***輪多SNP位點(diǎn)捕獲后,需要進(jìn)行第二輪PCR,在***輪PCR產(chǎn)物的基礎(chǔ)上,添加樣本樣本標(biāo)簽及測(cè)序接頭等序列。通過(guò)PCR條件優(yōu)化,目前亦可實(shí)現(xiàn)一次反應(yīng),兩輪PCR接力完成的效果。單核苷酸多態(tài)性(SNP),主要是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。

競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性PCR法——KASP(KompetitiveAlleleSpecificPCR),是英國(guó)LGC(**化學(xué)家實(shí)驗(yàn)室)公司所開發(fā)的技術(shù),被比較常見用于少位點(diǎn),多樣本的SNP分型中,與TaqMan熒光探針?lè)ㄓ幸欢ㄏ嗨菩?。KASP基于引物末端堿基的特異匹配來(lái)對(duì)SNP分型以及檢測(cè)InDels(InsertionsandDeletions,插入和缺失)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,是上海市****,至今已有十六年歷史,專注于為國(guó)內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)(高同源區(qū)段SNP分型)和質(zhì)控試劑盒。理論上講,SNP既可能是二等位多態(tài)性,也可能是3個(gè)或4個(gè)等位多態(tài)性。安徽高同源分型哪里好

SNP基因分型技術(shù)原理是PCR擴(kuò)增含有SNP的基因組片段。高同源SNP分型

在研究親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的物種時(shí),物種分化和基因重復(fù)的嵌套發(fā)生使研究具有很大的復(fù)雜性和困難度。這時(shí),籠統(tǒng)的劃分直系同源和旁系同源關(guān)系并不足以解決問(wèn)題,我們需要一個(gè)更為精確的分類。為了區(qū)別于B1和C1的簡(jiǎn)單的直向同源關(guān)系,把B2和C2/C3的同源稱為“共生直向同源”co—ortholog)或“橫向同源基因家族譜系特異性擴(kuò)充”(1ineage—specificexpansionofparalogousfamily)。為了區(qū)分C2和C3、B1和C2/C3這兩種同源關(guān)系,可以根據(jù)物種分化和基因重復(fù)的發(fā)生的先后次序,把旁系同源基因又分為內(nèi)旁系同源基因(inparalog)和外旁系同源基因(outparalog)。在物種分化之后產(chǎn)生旁系同源基因的稱“內(nèi)旁系同源基因”;在物種分化之前產(chǎn)生橫旁系同源基因的稱“外旁系同源基因”?!皟?nèi)旁系同源基因”和“外旁系同源基因”只是一種相對(duì)的劃分,取決于所研究的系統(tǒng)和選作標(biāo)準(zhǔn)的某特定分化事件。若以第二次物種分化為準(zhǔn)線,則C2和C3的分離發(fā)生在物種分化之后,因此它們互為內(nèi)旁系同源基因;B1和C2/C3的分離發(fā)生在物種分化之前,因此B1和C2/C3互為外旁系同源基因。高同源SNP分型

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司位于龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號(hào)502。公司業(yè)務(wù)分為細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù)等,目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn),為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù)。公司將不斷增強(qiáng)企業(yè)重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力,努力學(xué)習(xí)行業(yè)知識(shí),遵守行業(yè)規(guī)范,植根于醫(yī)藥健康行業(yè)的發(fā)展。在社會(huì)各界的鼎力支持下,持續(xù)創(chuàng)新,不斷鑄造***服務(wù)體驗(yàn),為客戶成功提供堅(jiān)實(shí)有力的支持。