上海高同源序列SNP分型送樣要求

來源: 發(fā)布時間:2021-10-17

1. SNP數(shù)量多,分布比較常見。據(jù)估計,人類基因組中每1000個核苷酸就有一個SNP,人類30億堿基***有300萬以上的SNPs.SNP 遍布于整個人類基因組中,根據(jù)SNP在基因中的位置,可分為基因編碼區(qū)SNPs(Coding-region SNPs,cSNPs)、基因周邊SNPs(Perigenic SNPs,pSNPs)以及基因間SNPs(Intergenic SNPs,iSNPs)等三類。2、 SNP適于快速、規(guī)模化篩查。組成DNA的堿基雖然有4種,但SNP一般只有兩種堿基組成,所以它是一種二態(tài)的標記,即二等位基因(biallelic)。 由于SNP的二態(tài)性,非此即彼,在基因組篩選中SNPs往往只需+/-的分析,而不用分析片段的長度,這就利于發(fā)展自動化技術(shù)篩選或檢測SNPs.3、SNP等位基因頻率的容易估計。采用混和樣本估算等位基因的頻率是種高效快速的策略。該策略的原理是:首先選擇參考樣本制作標準曲線,然后將待測的混和樣本與標準曲線進行比較,根據(jù)所得信號的比例確定混和樣本中各種等位基因的頻率。4、易于基因分型。SNPs的二態(tài)性,也有利于對其進行基因分型。.多重長片段PCR擴增特異性序列,其產(chǎn)物可以作為后續(xù)SNP分型的模板。上海高同源序列SNP分型送樣要求

SNP(單核苷酸多態(tài)性)是遺傳學研究是不可缺少的一部分,上海翼和應用生物技術(shù)有限公司作為一家專門從事遺傳學技術(shù)服務的公司,SNP基因分型也是日常項目中經(jīng)常碰到的對象。但是目前成熟的SNP分型方法有很多,各有各的特點和適用性,這讓很多剛開始接觸SNP分型的人們難以選擇,適合自己的分型方法。翼和生物可根據(jù)客戶提供的樣本量,位點數(shù)目等情況,提供不同的方案。SNP分型技術(shù)大盤點,選擇,適合的才是,好的。上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學技術(shù)服務和產(chǎn)品。高同源區(qū)段SNP分型在精細定位、分子育種過程中遇到高同源區(qū)段SNP,并且無法舍棄時,翼和生物提供特色的解決方案,歡迎來撩!

相信大家都聽過或已經(jīng)接觸過一些常用的分型方法,如片段長度多態(tài)性(限制性內(nèi)切酶)法,直接測序法,Taqman熒光探針法,LDR連接酶檢測反應法,競爭性等位基因特異性PCR法(KASP),二代測序法等,小E就針對以上幾種常用分型方法為大家做一個介紹和總結(jié)。上海翼和應用生物技術(shù)有限上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學技術(shù)服務和產(chǎn)品。

理論上講,SNP既可能是二等位多態(tài)性,也可能是3個或4個等位多態(tài)性,但實際上,后兩者非常少見,幾乎可以忽略。因此,通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換(C T,在其互補鏈上則為G A),也可能是顛換(C A,G T,C G,A T)。轉(zhuǎn)換的發(fā)生率總是明顯高于其它幾種變異,具有轉(zhuǎn)換型變異的SNP約占2/3,其它幾種變異的發(fā)生幾率相似。Wang等的研究也證明了這一點。轉(zhuǎn)換的幾率之所以高,可能是因為CpG二核苷酸上的胞嘧啶殘基是人類基因組中,易發(fā)生突變的位點,其中大多數(shù)是甲基化的,可自發(fā)地脫去氨基而形成胸腺嘧啶。在基因組DNA中,任何堿基均有可能發(fā)生變異,因此SNP既有可能在基因序列內(nèi),也有可能在基因以外的非編碼序列上??偟膩碚f,位于編碼區(qū)內(nèi)的SNP(coding SNP,cSNP)比較少,因為在外顯子內(nèi),其變異率*及周圍序列的1/5.但它在遺傳性疾病研究中卻具有重要意義,因此cSNP的研究更受關(guān)注。多重長片段PCR,同時擴增10個以上長片段,長片段區(qū)間內(nèi)覆蓋多個SNP位點,通過這種方法高效捕獲特異性序列。

Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測序技術(shù),對需要檢測的位點設計特異性引物,在單管內(nèi)進行多重PCR擴增,不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分。混合樣本后,在Ion Proton/Ion Torrent平臺上,對擴增子進行高通量測序。測序結(jié)果使用生物信息學方法,區(qū)分不同的樣本,,終獲得每個位點的SNP信息。高通量測序能一次對幾百萬條DNA分子進行序列測定,相比其他的SNP檢測技術(shù),基于高通量測序的SNP分型具有更準確、更靈敏的特點。上海翼和生物提供高同源區(qū)段SNP分型服務。


遺傳分析時經(jīng)常遇到高同源序列分析的挑戰(zhàn),比如存在假基因,同源基因,在多倍體物種中更為普遍。高同源區(qū)段SNP分型

多重PCR是降低長片段PCR擴增成本的有效方式。上海高同源序列SNP分型送樣要求

競爭性等位基因特異性PCR法——KASP(KompetitiveAlleleSpecificPCR),是英國LGC(**化學家實驗室)公司所開發(fā)的技術(shù),被比較常見用于少位點,多樣本的SNP分型中,與TaqMan熒光探針法有一定相似性。KASP基于引物末端堿基的特異匹配來對SNP分型以及檢測InDels(InsertionsandDeletions,插入和缺失)。上海翼和應用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學會理事單位,是上海市高新技術(shù)企業(yè),至今已有十六年歷史,專注于為國內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學技術(shù)服務(高同源區(qū)段SNP分型)和質(zhì)控試劑盒。上海高同源序列SNP分型送樣要求

上海翼和應用生物技術(shù)有限公司辦公設施齊全,辦公環(huán)境優(yōu)越,為員工打造良好的辦公環(huán)境。Biowing是上海翼和應用生物技術(shù)有限公司的主營品牌,是專業(yè)的第三方檢測服務;生物專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務;健康衰老評估;大健康檢測;遺傳學技術(shù)服務;生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測技術(shù)技術(shù)服務;小鼠遺傳品系鑒定;轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定;細胞點突變檢測;細胞端粒長度和端粒酶活性檢測。公司,擁有自己獨立的技術(shù)體系。公司以用心服務為重點價值,希望通過我們的專業(yè)水平和不懈努力,將第三方檢測服務;生物專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務;健康衰老評估;大健康檢測;遺傳學技術(shù)服務;生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測技術(shù)技術(shù)服務;小鼠遺傳品系鑒定;轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定;細胞點突變檢測;細胞端粒長度和端粒酶活性檢測。等業(yè)務進行到底。自公司成立以來,一直秉承“以質(zhì)量求生存,以信譽求發(fā)展”的經(jīng)營理念,始終堅持以客戶的需求和滿意為重點,為客戶提供良好的細胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務,從而使公司不斷發(fā)展壯大。