深圳蛋白質(zhì)糖基化修飾組學分析

來源: 發(fā)布時間:2022-03-19

蛋白磷酸化檢測方法:一、Western Blot檢測方法優(yōu)勢:1. WB方法簡便,多數(shù)實驗室具備Western Blot設備條件。2. 許多磷酸化抗體十分靈敏,能夠檢測低至10ug的蛋白樣品。3. 對于豐度低的蛋白,可以先通過IP使用目標蛋白的抗體對目標蛋白進行富集,再進行WB檢測被磷酸化的蛋白,檢測效率可以提高幾倍甚至幾十倍。二、質(zhì)譜檢測方法:Western Blot的方法雖然簡便,但是對于大規(guī)模分析復雜的生物樣品的磷酸化水平就不再適用了。而質(zhì)譜卻能很好的解決這一問題。依靠高準確度質(zhì)譜儀,如今快速準確分析細胞中高豐度蛋白的磷酸化修飾已是非常簡單的事。具體的檢測方法為先通過SDS-PAGE膠,或者2D-PAGE膠等分離目標蛋白,將含有目標蛋白的條帶切下,胰酶消化,LC-MS/MS檢測分析蛋白序列和相應位點的磷酸化修飾。這個方法適用于同時檢測多個目標蛋白的磷酸化水平。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的定位。深圳蛋白質(zhì)糖基化修飾組學分析

蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學:蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是生物體內(nèi)重要的共價修飾方式之一。磷酸化修飾本身所具有的簡單、靈活、可逆的特性,以及磷酸基團的供體ATP的易得性,使得磷酸化修飾被真核細胞所選擇接受成為一種比較普遍的調(diào)控手段。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程,幾乎調(diào)節(jié)著包括細胞的增殖、發(fā)育、分化、細胞骨架調(diào)控、細胞凋亡、神經(jīng)活動、肌肉收縮、新陳代謝發(fā)生等生命活動的所有過程,并且可逆的蛋白質(zhì)磷酸化是目前所知道的比較主要的信號轉(zhuǎn)導方式。目前已經(jīng)知道有許多人類疾病是由于異常的磷酸化修飾所引起,而有些磷酸化修飾卻是某種疾病所導致的后果。湖北棕櫚?;揎椀鞍踪|(zhì)組學價錢乙酰化修飾是體內(nèi)保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾。

質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾原理:相較于沒有發(fā)生翻譯后修飾的蛋白,翻譯后修飾蛋白會在特定肽段序列有分子量的增加。在蛋白翻譯后修飾方式的質(zhì)譜分析過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,然后進入質(zhì)譜進行分析;通過質(zhì)譜分析,得到的是一系列肽段的相對分子質(zhì)量信息。對于某一個特定的肽段而言,在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下其序列信息和分子量是確定的,當它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后,例如磷酸化修飾,因為磷酸根的分子量也是確定的,所以在質(zhì)譜檢測過程中如果發(fā)現(xiàn)部分肽段的分子量剛好增加了一個磷酸根的分子量,則可以假設這個肽段發(fā)生了磷酸化修飾,再通過二級或多級質(zhì)譜的譜圖進行二次確認即可實現(xiàn)翻譯后修飾類型鑒定及修飾位點分析等。

蛋白翻譯后修飾檢測:由于PTMs在基礎生物學以及疾病發(fā)病機理中的重要性,因此非常需要對蛋白質(zhì)的翻譯后修飾進行檢測。對蛋白翻譯后修飾進行研究時通常需要富集步驟,因為這些翻譯后修飾的蛋白質(zhì)相對含量較低。大多數(shù)PTMs的檢測方法與富集策略結合在一起開發(fā),以提供比較好的機會來識別、驗證和研究蛋白翻譯后修飾的功能。但是,在檢測已有特異性翻譯后修飾抗體的修飾蛋白質(zhì)時,可能不需要富集步驟。質(zhì)譜技術,通過測定肽段的分子量可以對該肽段的翻譯后修飾情況進行檢測,并可以對翻譯后修飾蛋白進行定性和定量分析。常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括泛素化。

蛋白質(zhì)修飾位點分析:基于LC-MS/MS分析能夠精確測定蛋白質(zhì)或多肽分子質(zhì)量這一特性,從而檢測蛋白質(zhì)或者多肽上位點發(fā)生何種修飾。可檢測修飾類型如下: 磷酸化、糖基化、乙?;⒎核鼗?、丙?;?、丁?;⒈;⑽於;㈢牾;渭谆?、二甲基化、三甲基化。1、磷酸化:信號轉(zhuǎn)導、細胞周期、生長發(fā)育機理等;2、糖基化:蛋白質(zhì)折疊、更新以及免疫應答等;3、乙?;夯虮磉_調(diào)控、細胞凋亡、細胞代謝、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性的病變等;4、泛素化:細胞周期、細胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復以及信號轉(zhuǎn)導等;5、甲基化:染色質(zhì)結構及轉(zhuǎn)錄調(diào)控等;6、丙?;?/ 丙二酰化 / 戊二?;?/ 琥珀?;褐饕嬖谟诰€粒體和細菌中,與代謝過程密切相關。蛋白質(zhì)糖基化指碳水化合物通過共翻譯或翻譯后修飾的方式附著到蛋白質(zhì)上的過程。哈爾濱蛋白質(zhì)氧化修飾組學研究

蛋白質(zhì)磷酸化修飾怎么定義?深圳蛋白質(zhì)糖基化修飾組學分析

蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學技術:蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是生物體內(nèi)重要的共價修飾方式之一。磷酸化修飾本身所具有的簡單、靈活、可逆的特性,以及磷酸基團的供體ATP的易得性,使得磷酸化修飾被真核細胞所選擇接受成為一種普遍的調(diào)控手段。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程,幾乎調(diào)節(jié)著包括細胞的增殖、發(fā)育、分化、細胞骨架調(diào)控、細胞凋亡、神經(jīng)活動、肌肉收縮、新陳代謝發(fā)生等生命活動的過程,并且可逆的蛋白質(zhì)磷酸化是目前所知道的主要的信號轉(zhuǎn)導方式。目前已經(jīng)知道有許多人類疾病是由于異常的磷酸化修飾所引起,而有些磷酸化修飾卻是某種疾病所導致的后果。深圳蛋白質(zhì)糖基化修飾組學分析

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