轉錄組學：隨著越來越多的基因組序列相繼被測定,生命科學的研究進入了后基因組時代,各類組學技術得到迅速地發(fā)展與普遍地應用包括以基因為研究對象的基因組學(Genomics)、以轉錄過程為研究對象的轉錄組學(Transcriptomics)。意義：1．轉錄組譜可以提供特定條件下某些基因表達的信息,并據此推斷相應未知基因的功能,揭示特定調節(jié)基因的作用機制.2．通過基于基因表達譜的分子標簽,不只可以辨別細胞的表型歸屬,還可以用于疾病的診斷.3．轉錄組的研究應用于臨床的另一個例子是可以將表面上看似相同的病癥分為多個亞型,尤其是對原發(fā)性惡性瘤,通過轉錄組差異表達譜的建立,可以詳細描繪出患者的生存期以及對藥物的反應等。轉錄組學能準確地識別可變剪切位點及cSNP，UTR區(qū)域。南京全轉錄學組研究方法
轉錄組學（Transcriptome）廣義上指某一生理條件下，細胞內所有轉錄產物的匯合，包括信使RNA(mRNA)、核糖體RNA(rRNA)、轉運RNA(tRNA)及非編碼RNA(ncRNA)；狹義上指所有mRNA的匯合。轉錄組具有很強的時間和空間特性，是基因功能及結構研究的基礎和出發(fā)點，掌握了生物個體基因轉錄水平的變化，可深入了解其生命活動特征和調控機制。通過新一代高通量測序，能夠全方面快速地獲得某一物種特定組織在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉錄本的基因序列信息。深圳靶向轉錄組學檢測價格轉錄組學測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉錄出來的所有RNA的總和。
轉錄組學的概念：轉錄組是指特定組織或細胞在某一發(fā)育階段或功能狀態(tài)下轉錄出來的所有RNA的匯合，包括蛋白質編碼的信使RNA和非編碼RNA（rRNA、tRNA和其他ncRNAs），高通量測序技術也被稱為下一代測序（NGS）技術，推進了基因組學的研究進展。該項新技術除了研究靜態(tài)基因組，近年來也開始應用于動態(tài)轉錄分析，由此衍生的技術稱為RNA序列分析（RNA-seq）隨著DNA基因芯片技術的快速發(fā)展，開創(chuàng)了這個病癥近十年的高通量轉錄組研究。RNA-Seq技術可以從轉錄水平檢測瘤中的改變基因。通過相關軟件分析，鑒定相關改變基因在瘤發(fā)生的發(fā)展中所起的作用。然后經過刷選，進一步挑選出相關靶基因進行實驗研究，有望為瘤的基因醫(yī)治提供新的靶點。
轉錄組分析是目前應用比較廣的高通量測序分析技術之一。常見設計是不同樣品之間比較，尋找差異基因、標志基因、協同變化基因、差異剪接和新轉錄本，并進行結果可視化、功能注釋和網絡分析等。轉錄組的測序分析也相對成熟，從RNA提取、構建文庫、上機測序再到結果解析既可以自己完成，又可以在專業(yè)公司進行。概括來看轉錄組的分析流程比較簡單，序列比對-轉錄本拼接(可選)-表達定量-差異基因-功能富集-定制分析。整個環(huán)節(jié)清晰流暢，可以作為剛開始接觸高通量測序學習比較合適的技術之一。RNA-Seq轉錄組學有著巨大的應用前景。
circRNA轉錄組學成環(huán)機制：circRNA環(huán)化方式分為內含子環(huán)化和外顯子環(huán)化。目前主流的成環(huán)機制可歸類為：依賴于剪切體的索尾插接環(huán)化。在mRNA前體上，通過連續(xù)的組裝小核核糖體蛋白從而催化外顯子下游的5′供體的位點連接到上游的3′受體的位點，索尾插接形成環(huán)化，然后通過剪切形成circRNA。順式作用元件促進circRNA形成。部分circRNA外顯子兩側的內含子中含有反向互補序列，首先在剪切位點上并排形成RNA雙鏈體，再通過可變剪切形成帶內含子和不帶內含子兩種不同的circRNA?；蛘咄怙@子內部以及兩側的內含子可以競爭進行RNA配對，然后通過可變剪切形成不同類型的circRNA。轉錄組學可應用于炎癥發(fā)生機制的發(fā)現及干預。南京全轉錄學組研究方法
轉錄組學是從RNA水平研究基因表達的情況。南京全轉錄學組研究方法
全長轉錄組學測序：由于在轉錄組研究中通常所使用的第二代測序技術具有測序讀長的限制，因此在進行測序之前，需要先將樣本的mRNA打碎為小片段，之后再通過與參考基因組比對或拼接的方式識別轉錄本，這就會造成一定的錯誤比例，同時在也很難區(qū)分單堿基水平的差異。全長轉錄組測序的優(yōu)勢：1、全方面鑒定可變剪切；2、發(fā)現更多新基因；3、有效改善基因組注釋；4、鑒定更多的LncRNA；5、準確定位融合基因。研究思路：由于全長轉錄組測序是基于第三代測序技術，因而其成本依然較高，如果全部研究項目均基于全長轉錄組，通常來說很難承擔，因此，全長轉錄組測序一般與普通轉錄組測序相結合。南京全轉錄學組研究方法
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