定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析（QuantitativeProteomics）是對一個基因組表達的全部蛋白質(zhì)或一個復(fù)雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進行精確鑒定和定量?？捎糜诤Y選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達蛋白，結(jié)合生物信息學(xué)揭示細胞生理病理等功能，同時也可對某些關(guān)鍵蛋白進行定性和定量分析。目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)常見標(biāo)記（Label）和非標(biāo)記的（LabelFree）定量策略。定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)常見的幾類主要包括：LabelFree定量蛋白組分析、SILAC與免疫共沉淀蛋白互作分析、MRM/PRM定量蛋白組學(xué)分析、SILAC/Dimethyl標(biāo)記定量蛋白組分析、SWATH定量蛋白組學(xué)、TMT/iTRAQ/multinotch定量蛋白組學(xué)分析。蛋白質(zhì)組學(xué)包括蛋白質(zhì)的表達水平。江蘇定量乙?；鞍踪|(zhì)組學(xué)檢測價格
蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)：飛行時間質(zhì)譜：MALDI的基本原理是將分析物分散在基質(zhì)分子（尼古丁酸及其同系物）中并形成晶體，當(dāng)用激光（337nm的氮激光）照射晶體時，基質(zhì)分子吸收激光能量，樣品解吸附，基質(zhì)-樣品之間發(fā)生電荷轉(zhuǎn)移使樣品分子電離。它從固相標(biāo)本中產(chǎn)生離子，并在飛行管中測定其分子量，MALDI-TOF-MS一般用于肽質(zhì)量指紋圖譜，非?？焖伲看畏治鲋恍?~5min），靈敏（達到fmol水平），可以精確測量肽段質(zhì)量，但是如果在分析前不修飾肽段，MALDI-TOF-MS不能給出肽片段的序列。上海醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進行蛋白質(zhì)組學(xué)方面的應(yīng)用性研究。
蛋白組究竟研究的是什么呢？第1，蛋白質(zhì)定性，或者說大規(guī)模檢測某些蛋白質(zhì)是否存在于樣品當(dāng)中；第2，蛋白質(zhì)定量，也就是大規(guī)模檢測某些蛋白質(zhì)的含量（包括一定含量與相對含量）；第3，蛋白質(zhì)翻譯后修飾，這些修飾主要包括磷酸化，泛素化，糖基化，乙酰化等等，也包括對這些翻譯后修飾的定量研究。這三大塊中所提到的大規(guī)模，既可以是樣品數(shù)量的大規(guī)模高通量，也可以是少量樣本中蛋白數(shù)量的大規(guī)模高通量。研究原因：首先，由于翻譯調(diào)控和翻譯后調(diào)控的存在，RNA的表達量與實際對應(yīng)蛋白質(zhì)的含量相關(guān)性并不高，就簡單地測試了酵母中mRNA和對應(yīng)蛋白質(zhì)的定量相關(guān)性，結(jié)果是，低豐度蛋白與mRNA的相關(guān)性尤其低，而高豐度蛋白和其mRNA的相關(guān)性則高，經(jīng)過平均后r值只為0.4。
PRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué)：是一種基于Orbitrap為表示的高分辨、高精度質(zhì)譜的離子監(jiān)視技術(shù)，首先利用四級桿質(zhì)量分析器的選擇能力，用Q1選擇目標(biāo)肽段的母離子，隨后在collisioncell中對母離子進行碎裂，然后利用Orbitrap分析器在二級質(zhì)譜中檢測所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片信息。這樣能夠?qū)δ繕?biāo)蛋白質(zhì)、目標(biāo)肽段（如發(fā)生翻譯后修飾的肽段）進行選擇性檢測，即可對目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進行相對(一定)定量。從而實現(xiàn)對復(fù)雜樣本中的目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進行準確地特異性分析。蛋白質(zhì)組學(xué)包括蛋白與蛋白相互作用等。
蛋白質(zhì)組學(xué)：常用技術(shù)：靶向蛋白組（PRM靶向蛋白/肽段定量），修飾蛋白組學(xué)（定量磷酸化修飾組學(xué)、定量糖基化修飾蛋白組學(xué)、定量乙?；揎椀鞍捉M學(xué)和定量泛素化修飾蛋白組學(xué)），互作蛋白組學(xué)（代謝物與蛋白互作研究）。什么樣本能做蛋白組學(xué)檢測？大概可以測到多少的蛋白種類？原則上只要能提取到蛋白，就可以做蛋白組檢測。樣本測到的蛋白種類跟數(shù)據(jù)庫和樣本本身蛋白濃度有關(guān)，一般數(shù)據(jù)庫越大，可以鑒定到的蛋白質(zhì)數(shù)量越多。也與樣本的類型有關(guān)，通常，組織細胞相比于體液樣本，能夠鑒定到更多的蛋白。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質(zhì)組比較分析，我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質(zhì)分子”。廣州高通量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)
蛋白質(zhì)組隨著基因組學(xué)研究的不斷深入，蛋白質(zhì)組學(xué)已逐漸成為研究熱點。江蘇定量乙?；鞍踪|(zhì)組學(xué)檢測價格
定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法學(xué)介紹：Label-free：Label-free定量，即非標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué)，不需要對比較樣本做特定標(biāo)記處理，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應(yīng)信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化，通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。Label-free定量不需要標(biāo)記處理，操作簡單，可以做任意樣本的總蛋白質(zhì)差異定量，但對實驗操作的穩(wěn)定性、重復(fù)性要求較高，準確性也較標(biāo)記定量差。因此，Label-free技術(shù)適合于大樣本量的定量比較，以及對無法用標(biāo)記定量實現(xiàn)的實驗設(shè)計。江蘇定量乙?；鞍踪|(zhì)組學(xué)檢測價格
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