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來源: 發(fā)布時間:2023-12-31

    m6A修飾圖譜構建及作用機制:通過m6A甲基化測序(MeRIP-Seq,miCLIP)構建疾細胞模型或者發(fā)組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布,Peak關聯(lián)基因的特征,聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關的FOXM1,通過qPCR、WB、免熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補,且共表達、共定位,進一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進ALKBH5和FOXM1初級轉(zhuǎn)錄本的相互作用。通過細胞實驗進一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達和細胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細胞中m6A修飾的特征和基因表達的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質(zhì)重構。近。細胞是生命的基本單位,所有生物體都是由一個或多個細胞組成的。下面就跟著上海東寰一起看看吧。山西乳鼠科研技術服務技術

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    如胰腺,一般取胰島較多的胰腺尾部;肺應取有細支氣管及帶有軟骨片的小支氣管部。如果實驗需進行多樣本的采集,采集順序應按照:消化,神經(jīng)系統(tǒng),皮膚,肌肉等的順序進行。選好塊的切面。熟悉某些成分安排,然后決定其切面的走向;如一長管狀以橫切面較好。切除不需要的部分。特別是周圍的脂肪等,應盡可能掉,否則給固定、脫水、浸蠟、切片等帶來一些不必要的問題。樣品的固定(1)固定的方法:①小塊固定法:從動物取下的小塊,立即置入液態(tài)固定劑(這是應用經(jīng)常的方法)。②注射/灌注固定法:某些塊由于體積過大或固定液極難滲入內(nèi)部或需要對整個臟器或整個動物進行固定,這時宜采用注射固定法,將固定液注入血管,經(jīng)血管分支到達整個和全身,從而得到充分的固定。另,空腔比如肺,肺內(nèi)含有空氣,固定液難以滲入,建議先做肺灌注,使得肺充盈滿固定液以后再進行保存,如果空腔中氣體沒有排出,后續(xù)可能影響固定效果(沒有灌注的肺會浮在液體表面不利于固定,切片以后也會看到很多的空泡)。③蒸汽固定法:比較細小而薄的標本,可用鋨酸或甲醛蒸汽固定。主要用于血液或細胞涂片以及某些薄膜的固定。。海南血液科研技術服務構建了解更多關于動物模型的問題歡迎來電咨詢,如您需要,竭誠為您服務。

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    RNA各種可逆的化學修飾被認為是一種新的表觀遺傳調(diào)控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學修飾,在調(diào)控mRNA穩(wěn)定性,剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)了METTL3(甲基轉(zhuǎn)移酶3),一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉(zhuǎn)移酶,在人肝細胞(HCC)和多種實體中高表達。在臨床上,METTL3的過度表達與肝細胞患者不良預有關。體外實驗證明敲除METTL3會抑制HCC細胞增殖,遷移及克隆形成。體內(nèi)實驗證明敲除METTL3會明顯抑制HCC體內(nèi)成瘤和肺轉(zhuǎn)移。另外,使用CRISPR/dCas9-VP64系統(tǒng),內(nèi)源性高表達METTL3會促進HCC細胞在體外和體內(nèi)生長。通過轉(zhuǎn)錄組測序、m6A-Seq、MeRIP-PCR,作者確定了SOCS2(細胞因子信號2的抑制因子)作為METTL3介導的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達會消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強SOCS2mRNA表達。m6A介導的SOCS2mRNA降解是依賴于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2??傊?,METTL3在HCC大部分高表達中,并通過m6A-YTHDF2依賴機制抑制SOCS2表達從而促進HCC進展。因此,作者發(fā)現(xiàn)了在肝發(fā)生過程中表觀遺傳改變的一種新機制。圖4RNA甲基化轉(zhuǎn)移酶METLLT3在肝組織中高表達。

    轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果及TCGA數(shù)據(jù)庫分析)圖5RNA-Seq和m6A-seq聯(lián)合鑒定SOCS2是介導的m6A修飾的下游靶基因PLoSOne2015,在許多不同種類的RNA中,都已觀察到N6-腺苷(m6A)的甲基化,但其在microRNAs中還沒有被研究。研究者在FTO1C1,FTO2D4和FTO3C3細胞系中,通過敲除m6A甲基轉(zhuǎn)移酶FTO篩選到表達差異的microRNA,說明miRNA受m6A甲基化的調(diào)控。進一步通過MeRIP-Seq發(fā)現(xiàn)相當一部分的microRNA具有m6A修飾。通過motif分析,他們發(fā)現(xiàn)了區(qū)分甲基化和非甲基化microRNA的一致序列。該文章所述的表觀遺傳修飾在基因表達的轉(zhuǎn)錄調(diào)控的復雜性上增加了一個新的層次。圖FTO敲除對甲基化的miRNAs的穩(wěn)定狀態(tài)的影響。參考文獻Y,DominissiniD,RechaviG,HeC:Geneexpressionregulationmediatedthroughreversiblem(6)(5):'(1):(12):(6):(1):(1):(uridine)(41):(6)(7540):(1):(7481):(4):(6)A-LAIC-seqrevealsthecensusandcomplexityofthem(6)(8):'UTRm(6)(4):(7544):(6)(6):(5):(7667):(2):"">panstyle="color:#f5c81c;">xiainducesthebreastcancerstemcellphenotypebyHIF-dependentandALKBH5-mediatedm(6)(14):"">panstyle="color:#f5c81c;">(40):(6)(3):(1):(1):(4):(11):。動物疾病模型還為科研人員提供了研究人類疾病的跨學科方法。

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    動物模型在科研中有著普遍的應用。首先,它們可以幫助科研人員深入理解的共同性,即不同物種之間存在的共有理變化過程。通過對動物模型的研究,科研人員可以更清楚地了解的發(fā)展過程和機制,為人類的檢查提供理論依據(jù)。其次,動物模型還為新研發(fā)和苗測試提供了的平臺。在研發(fā)過程中,科研人員可以通過對動物模型進行處理,觀察其和副作用,為新的臨床試驗提供依據(jù)。而在苗測試中,動物模型則可以用來評估苗的性和安全性。此外,動物模型還為科研人員提供了研究人類的跨學科方法。例如,通過比較人類和動物模型的基因組學、蛋白質(zhì)組學等數(shù)據(jù),可以發(fā)現(xiàn)與發(fā)生相關的關鍵基因和蛋白質(zhì),從而為的和檢查提供新的思路。雖然動物模型在科研中發(fā)揮了巨大的作用,但也存在一些挑戰(zhàn)。首先,由于物種差異的存在,動物模型的表現(xiàn)與人類可能存在差異,因此需要謹慎使用。此外,動物模型的倫理問題也不容忽視,科研人員需要在符合倫理規(guī)定的前提下進行相關研究。盡管存在挑戰(zhàn),動物模型的發(fā)展前景仍然值得期待。隨著科技的不斷進步,科研人員將能夠開發(fā)出更為精確、實用的動物模型。可以發(fā)現(xiàn)與疾病發(fā)生相關的關鍵基因和蛋白質(zhì),從而為疾病的預防和檢查提供新的思路。天津小鼠科研技術服務實驗

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